摘要：
1. popen()函数 头文件：#include <stdio.h> 函数原型：FILE * popen(const char * command, const char * type); 关闭文件流：int pclose(FILE * stream); 函数popen 先执行fork，然后调用e 阅读全文
2017年8月6日
2017年7月28日
摘要：
在电脑Windows10系统上安装Centos7，安装后找不到Windows7引导菜单。 原因：因为CentOS 7已采用新式的grub2系统，所以需要进入/boot/grub2目录后使用vi编辑grub.cfg文件。 解决方法一：修改Centos 7的Grub2引导，添加Windows的启动项 解 阅读全文
2017年7月26日
摘要：
一、几个时间概念 1.1 UTC：世界标准时间 协调世界时，又称为世界标准时间，为大家所熟知的格林威治标准时间（Greenwich Mean Time，GMT）。比如，中国内地的时间与UTC的时差为+8，也就是UTC+8。美国是UTC-5。 1.2 Calendar Time：日历时间 “从一个标准 阅读全文
2017年6月29日
摘要：
语法1: substring=${string:start:len} string的下标从0开始，以start可是，截取len个字符，并赋值于substring 语法2:截取指定字符串 ${varible##*string}：从左向右截取最后一个string后的字符串 ${varible#strin 阅读全文
2017年6月26日
摘要：
Somatic突变是不遗传的，在研究方法上主要偏重采集癌症组织和正常组织进行比较得到结果（在Call Somatic mutations 的时候最好有同一个体的正常组织进行参照）从研究意义上来讲，Somatic更偏重于单个患者的癌症分型和发病机理的研究。相对比较省事儿。 Germ-line的muta 阅读全文
2017年6月14日
摘要：
1，软件介绍 FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), ind 阅读全文
2017年6月13日
摘要：
源自：http://www.biotrainee.com/thread-1382-1-1.html 一、Duplicated reads duplicates reads 是PCR对同一个分子进行多次镜像复制的结果。 判断是否为镜像分子的标准是：reads的起始和终止位置，起点和终点之间的碱基序列一 阅读全文
2017年5月19日
摘要：
dN/dS 在遗传学中，Ka/Ks或者dN/dS表示的是异意替换（Ka）和同意替换（Ks）之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变，反之则称为非同义突变。一般认为，同义突变不受自然选择，而非同义突变则受到自然选择作用。在进化分 阅读全文
2017年5月15日
摘要：
转自：http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4316581.html samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是：将sam文件转换成bam文件；然后对bam文件进行各种操作，比 阅读全文
摘要：
VarScan使用示例，如下： samtools mpileup -q35 -d8000 -f GBS_A909.fa M008_alignmen_F4.sort.bam >M008_alignmen_F4.sort.mpileup samtools mpileup -q35 -d8000 -f G 阅读全文
