2016年12月2日

摘要: gcc编译器能够支持c/c++的编译和运行,能够产生最终可执行文件(如test.exe) 1.官方下载地址 https://sourceforge.net https://sourceforge.net/projects/mingw/?source=typ_redirect 一定要下载该程序:min 阅读全文
posted @ 2016-12-02 23:23 萧飞IDO 阅读(178) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1.改变磁盘 直接输出磁盘名字即可: D:\>f: F:\>dir 2.列出磁盘下的详细文件目录:dir命令 F:\>dir 驱动器 F 中的卷是 博士 卷的序列号是 CEE2-7ACB F:\ 的目录 2016/10/23 19:20 <DIR> 136套年终总结PPT模板 2016/08/16 阅读全文
posted @ 2016-12-02 23:01 萧飞IDO 阅读(155) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年11月28日

摘要: 1. 概述 软件版本号有四部分组成,第一部分为主版本号,第二部分为次版本号,第三部分为修订版本号,第四部分为日期版本号加希腊字母版本号,希腊字母版本号共有五种,分别为base、alpha、beta 、RC 、 release。 如1.6.2.20161128_alpha 注:上一级有改动时,下一级要 阅读全文
posted @ 2016-11-28 11:42 萧飞IDO 阅读(161) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. 在linux终端操作界面,按照如下的方式打开vim配置文件(~/.vimrc,该配置文件为个人账户的vim配置文件,不影响其用户) vim ~/.vimrc 2. 在配置文件的最后一行添加如下命令: hi comment ctermfg=2 3. 在vim配置文件中,注释信息颜色分类: 0 黑 阅读全文
posted @ 2016-11-28 10:55 萧飞IDO 阅读(1011) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年11月13日

摘要: Indel Calling相比于SNP Calling的难度要大一些,因为由于这种插入-缺失的存在,本身就很容易干扰排序,这种干扰会导致Indel周围出现很多假阳性的SNP,而且会影响Indel本身的准确性。理论上来说,检测Indel的最好方式就是做de novo assembly,然后比较de n 阅读全文
posted @ 2016-11-13 10:38 萧飞IDO 阅读(3397) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年11月12日

摘要: 常用的比对软件列表 软件 发表年代 PMID SOAP 2008 18227114 Maq 2008 18714091 BWA 2009 19451168 Bowtie 2009 19261174 NovoAlign 2009 Subread 2013 23558742 阅读全文
posted @ 2016-11-12 20:47 萧飞IDO 阅读(371) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: santools可以作为文本查看工具,查看比对结果文件,下面做一简单介绍: 1. 通过BWA比对获取sam比对文件,也可以将fastq文件转化为bam/sam文件; 2. 转换sam文件为bam文件,samtools view -bS seq.sam > seq.bam 3. 对bam文件进行排序, 阅读全文
posted @ 2016-11-12 18:46 萧飞IDO 阅读(638) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年11月7日

摘要: 一、异常对象 类异常支持异常的层次结构:超类变成分类名称,而子类变成这个分类中特定种类的异常。except字句列出一个通用的异常超类,就可捕捉整个分类中的各种异常:任何特定的子类都可匹配。 注意: ①必须继承内置异常超类或内置异常子类,就像object一样: 内置Exception类: BaseEx 阅读全文
posted @ 2016-11-07 22:09 萧飞IDO 阅读(1119) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 运算符重载是指在类方法中拦截内置操作-当类的实例出现在内置操作中,python自动调用你定制的方法,并且你的方法的返回值变成了相应操作结果。 常见的运算符重载方法 方法 重载 __init__ 构造函数 __del__ 析构函数 __add__ 运算符+ __or__ 运算符| __repr__,_ 阅读全文
posted @ 2016-11-07 18:28 萧飞IDO 阅读(348) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年11月4日

摘要: getwd() 显示当前工作目录 setwd("mydirectory") 修改当前工作目录为mydirectory ls() 列出当前工作空间中的对象 rm(obj) 删除一个或多个对象 help(options) 显示可用选项的说明 options() 显示或设置当前选项 history(#) 阅读全文
posted @ 2016-11-04 22:26 萧飞IDO 阅读(304) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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