2016年12月22日

摘要: 什么是soft-clipped reads 当基因组发生某一段的缺失,或转录组的剪接,在测序过程中,横跨缺失位点及剪接位点的reads回帖到基因组时,一条reads被切成两段,匹配到不同的区域,这样的reads叫做soft-clipped reads,这些reads对于鉴定染色体结构变异及外源序列整 阅读全文
posted @ 2016-12-22 21:28 萧飞IDO 阅读(1576) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 语法结构如下: 1. if-then语句 2. if-then-else语句 3. 嵌套if(elif) 4. test命令(单测试条件) 5. 复合条件测试 6. if-then高级特性 7. case命令 阅读全文
posted @ 2016-12-22 11:56 萧飞IDO 阅读(320) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年12月19日

摘要: 转自于:http://www.jb51.net/LINUXjishu/86326.html 1、使用wget下载单个文件 2、使用wget -O 下载并以不同的文件名保存 3、使用wget -–limit-rate限速下载 4、使用wget -c 断点续传 5、使用wget -b 后台下载 6、伪装 阅读全文
posted @ 2016-12-19 19:46 萧飞IDO 阅读(609) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1. For the Impatient # Download bwakit (or from <http://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/bwakit/> manually) wget -O- http://sourceforge.net/proj 阅读全文
posted @ 2016-12-19 18:29 萧飞IDO 阅读(1388) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Reference Genome Components 1. GRCh38 is special because it has alternate contigs that represent population haplotypes. Don’t know alternate contig fr 阅读全文
posted @ 2016-12-19 13:58 萧飞IDO 阅读(2599) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年12月16日

摘要: 1. 官方网址 https://software.broadinstitute.org/gatk/ 2. 下载Latest version: 3.7 3. FileZilla 上传至服务器,解压 tar jxvf GenomeAnalysisTK-3.6.tar.bz2 4. 测试是否安装成功 安装 阅读全文
posted @ 2016-12-16 21:55 萧飞IDO 阅读(628) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 特别感谢simomo 什么是线程池? 诸如web服务器、数据库服务器、文件服务器和邮件服务器等许多服务器应用都面向处理来自某些远程来源的大量短小的任务。构建服务器应用程序的一个过于简单的模型是:每当一个请求到达就创建一个新的服务对象,然后在新的服务对象中为请求服务。但当有大量请求并发访问时,服务器不 阅读全文
posted @ 2016-12-16 17:11 萧飞IDO 阅读(294) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 参考:http://blog.csdn.net/kobeyan/article/details/44039831 1. 锁的概念 在python中,存在GIL,也就是全局解释器锁,能够保证同一时刻只有一个线程在运行,在这个方面可以认为是线程安全的,但是在线程运行的时候,是共享内存的,共享相同的数据信 阅读全文
posted @ 2016-12-16 16:51 萧飞IDO 阅读(451) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年12月15日

摘要: 参考:http://www.cnblogs.com/aylin/p/5601969.html 我是搬运工,特别感谢张岩林老师! python 线程与进程简介 进程与线程的历史 我们都知道计算机是由硬件和软件组成的。硬件中的CPU是计算机的核心,它承担计算机的所有任务。 操作系统是运行在硬件之上的软件 阅读全文
posted @ 2016-12-15 22:59 萧飞IDO 阅读(253) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2016年12月14日

摘要: 第一、创建配置文件 $dircolors -p>~/.dircolors 第二、编辑配置文件 打开文件: $vi ~/.dircolors 找到这一行: DIR 01;34 # directory #可用颜色: # 40=black 41=red 42=green 43=yellow 44=blue 45=magenta 46=cyan 47=white 第三、重新加载 $vi ~... 阅读全文
posted @ 2016-12-14 15:25 萧飞IDO 阅读(252) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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