摘要:
简介 top命令是Linux下常用的性能分析工具,能够实时显示系统中各个进程的资源占用状况,类似于Windows的任务管理器。 top显示系统当前的进程和其他状况,是一个动态显示过程,即可以通过用户按键来不断刷新当前状态.如果在前台执行该命令,它将独占前台,直到用户终止该程序为止. 比较准确的说,t 阅读全文
摘要:
The BLAST Databases Last updated on January 12, 2015 This document describes the BLAST databases available on the NCBI FTP site under the /blast/db di 阅读全文
摘要:
1. Velvet的安装 Velvet用于基因组的de novo组装,支持各种原始数据,包括Illumina的short reads和454的long reads。 首先下载velvet的安装包,直接使用make命令来编译,即可获得可执行主程序velveth和velvetg。安装如下: 值得注意的是 阅读全文
摘要:
Velvet简单介绍: velvet是一款常用的基因组拼接软件,与soapdenovo一起常用于二代测序数据的处理,相对于soapdenovo拼接的完整性更好。他能同时支持fasta、fastq格式的数据,同时支持多个文库的数据同时使用。 其工作的一般过程简化为:输入short read序列,排除错 阅读全文
摘要:
1、环境变量(PATH) 在Linux中,在执行命令时,系统会按照PATH的设置,去每个PATH定义的路径下搜索执行文件,先搜索到的文件先执行。 我们知道查阅文件属性的指令ls 完整文件名为:/bin/ls(这是绝对路径), 那你会不会觉得很奇怪:"为什么我可以在任何地方执行/bin/ls这个指令呢 阅读全文