摘要:
常用的比对软件列表 软件 发表年代 PMID SOAP 2008 18227114 Maq 2008 18714091 BWA 2009 19451168 Bowtie 2009 19261174 NovoAlign 2009 Subread 2013 23558742 阅读全文
摘要:
santools可以作为文本查看工具,查看比对结果文件,下面做一简单介绍: 1. 通过BWA比对获取sam比对文件,也可以将fastq文件转化为bam/sam文件; 2. 转换sam文件为bam文件,samtools view -bS seq.sam > seq.bam 3. 对bam文件进行排序, 阅读全文