2016年11月12日

[生物信息比对软件列表]
摘要： 常用的比对软件列表 软件 发表年代 PMID SOAP 2008 18227114 Maq 2008 18714091 BWA 2009 19451168 Bowtie 2009 19261174 NovoAlign 2009 Subread 2013 23558742 阅读全文
posted @ 2016-11-12 20:47 萧飞IDO 阅读(371) 评论(0) 推荐(0) 编辑
[samtools] 文本查看语法，浏览SNP/INDEL位点
摘要： santools可以作为文本查看工具，查看比对结果文件，下面做一简单介绍： 1. 通过BWA比对获取sam比对文件，也可以将fastq文件转化为bam/sam文件； 2. 转换sam文件为bam文件，samtools view -bS seq.sam > seq.bam 3. 对bam文件进行排序， 阅读全文
posted @ 2016-11-12 18:46 萧飞IDO 阅读(645) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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