Anaconda安装及R环境配置
一、Anaconda安装
本文是基于Ubuntu 16.04的Linux操作系统
Anaconda系统的下载:wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh
Anaconda系统安装:sh Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh
安装过程中,会有协议的阅读与同意,方可进行安装。如果出现选项,请请选择“yes”。此外,也可指定安装路径。
二、基于Anaconda的R版本的安装
2.1 在Anaconda安装目录(usrnamePath/anaconda3/bin/) bin目录下,需找conda指令。基于该指令下载并安装最新版本的R软件和包
usrPath/anaconda3/bin/conda create -n r_env r-essentials r-base
2.2 激活Anaconda环境中的R语言环境。激活后,基于Anaconda环境的R被使用。此时,R为独立于已有操作系统中的R版本,为个人用户的R环境操作。
usrPath/anaconda3/bin/conda activate r-environment
如果要退出Anaconda环境中的R环境,可执行如下程序:
usrPath/anaconda3/bin/conda deactivate
2.3 可以将其配置到自己的环境变量中
vi ~/.bashrc
添加:
alias Rconda='usrPath/anaconda3/bin/conda activate r-environment'
source ~/.bashrc
下一次打开即生效,即命令行输入Rconda打开环境
三、常见错误
如果上述问题出错,可能是由于没有将anaconda加入到配置文件中,具体操作如下:
vi ~/.bashrc
在文件末尾加上:
export PATH="/usrPath/anaconda3/bin:$PATH"
生效:
source ~/.bashrc
启动环境:
conda activate r-environment