2015年5月22日
02、CDF文件
摘要： 有了探针排布图像的基础，我们就可以更好地理解CDF文件了。假如每个探针的位置用一个坐标表示，以左上角为（0，0），那么整张芯片的坐标就如下图（行数n必须等于列数m，这里共有n*m个探针）：0,01,02,03,0…m,00,10,20,3…0，n那么这些探针怎么根据坐标对应到探针组呢？我们来看C... 阅读全文
posted @ 2015-05-22 14:02 洗浄 阅读(1556) 评论(0) 推荐(0) 编辑
01、探针分布图
摘要： R语言软件arrayanalysis（http://arrayanalysis.org/）提供了绘制探针排布图像的方法，读者可通过该图像更好地理解芯片的设计。图中的黑/灰色代表普通探针的PM、MM探针，深蓝/浅蓝色代表控制探针的PM、MM探针，红色代表无定义的探针（非PM，非MM）。不过用Jav... 阅读全文
posted @ 2015-05-22 13:58 洗浄 阅读(592) 评论(0) 推荐(0) 编辑
00、生物芯片笔记前言
摘要： 基因芯片主要分为双通道cDNA芯片和高密度寡核苷酸芯片。双通道cDNA芯片：每个微阵列产生两个探针水平的数据集（红色通道和绿色通道）。高密度寡核苷酸芯片：每个微阵列产生一个探针水平的数据集。一些探针是匹配探针（Perfectmatch，PM），一些探针是错配探针（Mismatch，MM。不过有些芯片... 阅读全文
posted @ 2015-05-22 13:54 洗浄 阅读(1088) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2015年3月25日
3、Java调用C语言（JNA法）
摘要： 这个方法挺方便的……（改写“二、Java调用C语言（JNative法）“的例子） 一、访问https://github.com/twall/jna ，下载jna-4.1.0.jar（版本不同名字不同），把它放在你jdk下的\jre\lib\ext目录下 二、在 F:\MinGW\Jna新建 Test 阅读全文
posted @ 2015-03-25 14:09 洗浄 阅读(3562) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2015年3月23日
2、Java调用C语言（JNative法）
摘要： 这个方法也是挺麻烦的…… 一、下载JNative.jar，把它放在你jdk下的\jre\lib\ext目录下 二、在 F:\MinGW\JNative 新建 Test.java： public class Test { public static void main(String[] args) t 阅读全文
posted @ 2015-03-23 11:17 洗浄 阅读(818) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2015年3月22日
Structs2下的MyFirstTest
摘要： 1.这是《Struts2-权威指南》第二章的例子2.博文主要说明在eclipse下如何创建一个struts2项目3.实现功能：在login.jsp输入用户名和密码，若用户名为scott且密码为tiger则进入welcome.jsp，否则进入error.jsp一、新建项目File/New/Other/... 阅读全文
posted @ 2015-03-22 17:54 洗浄 阅读(159) 评论(0) 推荐(0) 编辑
1、Java调用C语言（本地法）
摘要： 这是一个比较麻烦的方法。。 一、首先，你要先安装一个VC，我的装在了D:\software\C++\Microsoft Visual Studio 二、我的jdk安装目录是D:\Program Files\Java\jdk1.7.0_67， 那么把： D:\Program Files\Java\jd 阅读全文
posted @ 2015-03-22 14:44 洗浄 阅读(729) 评论(0) 推荐(0) 编辑
Rtools的安装
摘要： long long ago，我在http://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/下载到了Rtools30.exe……这是一个神奇的工具……我Rtools的安装路径：　D:\software\R\Rtools我R.exe的路径： D:\software\R\R... 阅读全文
posted @ 2015-03-22 14:36 洗浄 阅读(13573) 评论(0) 推荐(0) 编辑
MinGW的安装
摘要： 我在MinGW官网下载到的版本是mingw-w64-install.exe，不过这差不多是一年以前的事了……安装路径：D:\Program Files (x86)\mingw-w64\i686-4.9.2-posix-dwarf-rt_v3-rev1环境变量：C_INCLUDEDE_PATH： D:... 阅读全文
posted @ 2015-03-22 14:26 洗浄 阅读(505) 评论(0) 推荐(0) 编辑