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2023年12月18日
R ：随机森林（测试版3）
摘要： # 清空当前环境中的所有对象 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) library(tidyverse) library(pROC) libra 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:53 王哲MGG_AI 阅读(30) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R ：随机森林（测试版2）
摘要： # 清空当前环境中的所有对象 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) library(tidyverse) library(pROC) libra 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:53 王哲MGG_AI 阅读(8) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R : 随机森林（测试版1）
摘要： # 清空当前环境中的所有对象 rm (list = ls ()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) #随机森林 library(tidyverse) #数据分析和可视化 l 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:51 王哲MGG_AI 阅读(16) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R : PCA 主成分分析
摘要： 主成分分析 rm (list = ls ()) library(vegan) library(tidyverse) library(ggalt) library(car) library(ggforce) library(ggpubr) library(patchwork) # 2. 定义所需的函数 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:42 王哲MGG_AI 阅读(100) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2023年12月15日
宏基因组测序相比于16S等测序技术的优势
摘要： 宏基因组测序相比于16S rRNA基因测序技术有几个主要的优势： 全面性：宏基因组测序提供了对整个微生物群落基因组的综合视角，而不仅限于16S rRNA基因。这意味着它能够捕捉到更广泛的微生物多样性，包括细菌、古菌、真菌以及病毒。 功能信息：宏基因组测序不仅能够鉴定微生物群落中的物种，还能提供关于它 阅读全文
posted @ 2023-12-15 14:36 王哲MGG_AI 阅读(231) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2023年12月12日
引用近几年有较高影响力的文献
摘要： 固氮、溶磷和解钾过程： [1] Bulgarelli, D., Schlaeppi, K., Spaepen, S., van Themaat, E. V. L., & Schulze-Lefert, P. (2013). Structure and functions of the bacteri 阅读全文
posted @ 2023-12-12 11:26 王哲MGG_AI 阅读(15) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2023年12月5日
随机森林的nodesize值
摘要： 首先，什么是nodesize值，以及它的含义和作用。 nodesize值是指定每个叶子节点最少包含的样本数量的整数值，它是随机森林算法的一个重要的参数，它影响了随机森林的复杂度和泛化能力。 nodesize值的含义和作用是控制决策树的生长和剪枝，以及随机森林的随机性和准确性。 当nodesize值较 阅读全文
posted @ 2023-12-05 16:57 王哲MGG_AI 阅读(294) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2023年11月30日
R：LEfSe(线性判别分析)
摘要： rm(list=ls()) #清空工作环境 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\LDA") #设置工作目录 library(tidyverse) #包含了一系列与数据分析和可视化相关的包 library(microeco) #生态学分析的包 libra 阅读全文
posted @ 2023-11-30 16:51 王哲MGG_AI 阅读(598) 评论(6) 推荐(0) 编辑
2023年11月28日
R ：NMDS(第二版)
摘要： rm (list = ls ())#清除所有变量 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\NMDS\\Fun") #设置工作目录 # 1. 导入所需的库。 library(vegan) library(ggplot2) # 2. 定义所需的函数。 myda 阅读全文
posted @ 2023-11-28 21:42 王哲MGG_AI 阅读(29) 评论(0) 推荐(0) 编辑
留一法
摘要： “留一法"是一种常用的模型验证方法，也被称为"留一交叉验证”。这种方法的基本思想是：如果有N个样本，我们就进行N次训练和验证，每次选择一个样本作为测试集，其余的N-1个样本作为训练集。这样，我们就可以得到N个模型的测试结果，然后对这N个结果取平均，作为最终的模型性能。 这种方法的优点是每个样本都被用 阅读全文
posted @ 2023-11-28 15:04 王哲MGG_AI 阅读(257) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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