王哲_UJN_MGG_AI

摘要： 测序的读段指的是dna或rna样本经过测序分析之后，得到的含有基因信息的短片段。这些读段可以用于鉴定微生物，比对它们已知的基因组/基因来确定它们所属的分类和可能的生物学功能。在微生物学研究中，测序的读段通常会被拼接成完整的基因组序列，从而更好地理解细菌、真菌和病毒之间的差异性，并推断它们的生态和微生 阅读全文

摘要： 宏基因组学是在生物技术和计算机科学的帮助下发展起来的，它的出现可以追溯到上世纪90年代后期。传统微生物学侧重于使用培养方法研究单个微生物菌落，而宏基因组学则通过分析环境中的dna，可以同时研究数百万个微生物群体。这种方法能够提供关于整个微生物群落的结构、功用潜力和相互作用等信息。 宏基因组学对于微生 阅读全文

摘要： 在 Humann 工具中，-o 是 --output 参数的简写形式，用于指定生成的输出文件的路径和名称。该参数通常用于自定义输出文件的名称和路径。 Humann 可以生成多种类型的输出文件，包括功能注释结果、物种组成结果、代谢通路丰度和覆盖度等。当您运行 Humann 时，使用 -o 参数可以指定 阅读全文

摘要： 要在conda上安装MetaPhlAn3，可以按照以下步骤进行操作： 首先，打开终端或Anaconda Prompt（如果您正在使用Windows）。 激活您的conda环境。如果您还没有conda环境，请创建一个新环境。 运行以下命令以添加Bioconda和conda-forge channels 阅读全文

摘要： １、创建虚拟环境： Anaconda创建环境：比如，创建pyhon＝3.7的版本环境取名叫mpa conda create -n mpa python=3.72、删除虚拟环境操作（谨慎操作） conda remove -n mpa --all ３、激活环境 conda activate mpa 4、 阅读全文

摘要： 在Linux上彻底删除conda的步骤如下： 删除conda安装目录 首先要删除conda的安装目录。通过以下命令可以找到conda的安装位置： 复制代码 which conda 根据输出的路径，使用以下命令删除conda的安装目录： 复制代码 rm -rf /path/to/conda 注意将/p 阅读全文

摘要： 在生信分析领域利用博客记录和分享代码的好处如下： 方便知识共享：博客可以帮助研究人员将自己的经验和知识分享给其他人。通过记录自己的实验过程、数据分析流程以及代码实现，可以使得其他有类似问题的人快速了解相关知识。 提高交流效率：生信领域涉及到很多复杂的数据处理和分析技术，交流起来有时会比较困难。但如果 阅读全文