摘要：
rm(list = ls()) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\microtable") #设置工作目录 library(microeco) library(magrittr) feature_table <- read.table('featur 阅读全文
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rm(list = ls()) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\microtable") #设置工作目录 library(microeco) library(magrittr) feature_table <- read.table('featur 阅读全文
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dataset$sample_sums() %>% range #计算并查看样本总数的范围 dataset$rarefy_samples(sample.size = 1000000) #执行重采样，标准化样本中的测序深度 "46 features are removed because they a 阅读全文
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输入文件输出文件 rm(list = ls()) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\microtable") #设置工作目录 library(dplyr) library(tidyr) library(readr) # 读取文件 data <- re 阅读全文
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（一）准备示例数据 加载microeco包： library(microeco) 加载示例数据集： data(sample_info_16S) data(otu_table_16S) data(taxonomy_table_16S) data(phylo_tree_16S) data(env_dat 阅读全文
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时滞回归分析是一种统计方法，用于研究一个变量的过去值如何影响另一个变量的当前值。在日常生活中，很多事物的影响不是立即显现的，而是经过一段时间后才表现出来，这就是“时滞”的概念。时滞回归分析正是用来研究这种延迟效应的。 基本概念 想象一下你在照顾一盆植物。你浇水的量（一个变量）不会立刻影响植物的生长情 阅读全文
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降维通常被视为超越聚类的无监督学习技术，因为它不仅仅是将数据分组。降维的目标是发现数据中的底层结构，通过减少数据的维数来简化数据，同时尽可能保留重要的信息。这使得降维成为一种更为基础和广泛的数据探索方法。 以下是降维超越聚类的几个方面： 数据压缩：降维可以减少数据集的大小，这有助于减少存储空间和加快 阅读全文
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# 清除所有变量 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\PLS_Pathway") # 1. 加载所需的库 library(vegan) library(tidyverse) library 阅读全文
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# 清除所有变量 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\PCA_Pathway") # 1. 加载所需的库 library(vegan) library(tidyverse) library 阅读全文
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碎石图（Scree Plot）是一种用于主成分分析（PCA）的可视化工具，它帮助我们决定在数据集中保留多少个主成分（PCs）是合适的。在PCA中，每个主成分都代表数据中的一个方差来源，第一个主成分解释了数据中最大的方差部分，第二个主成分解释了剩余方差中最大的部分，依此类推，每个后续的主成分都解释了在 阅读全文