12 2023 档案

摘要:两组对比,t.test计算差异 rm (list = ls ()) #清除所有变量 library(ggplot2) library(ggpubr) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹") #设置工作目录 index <- read.tab 阅读全文
posted @ 2023-12-29 17:48 王哲MGG_AI 阅读(46) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:rm(list=ls()) #清除R环境中的所有对象 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹") #设置工作目录 library(vegan) # 读取数据 df <- read.table("otu_table_R.txt", header 阅读全文
posted @ 2023-12-28 16:52 王哲MGG_AI 阅读(315) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:PARTIAL LEAST SQUARES PATH MODELING (PLS-PM) MODEL SPECIFICATION 1 Number of Cases 40 2 Latent Variables 5 3 Manifest Variables 11 4 Scale of Data Sta 阅读全文
posted @ 2023-12-28 10:40 王哲MGG_AI 阅读(8237) 评论(3) 推荐(1) 编辑
摘要:> dat_pls Partial Least Squares Path Modeling (PLS-PM) NAME DESCRIPTION 1 $outer_model outer model 2 $inner_model inner model 3 $path_coefs path coeff 阅读全文
posted @ 2023-12-28 09:52 王哲MGG_AI 阅读(984) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:rm (list = ls ()) #清除所有变量 # 1. 导入所需的库。 library(vegan) #提供了进行社区生态学分析的函数,包括多元分析、物种多样性分析等。 library(tidyverse) #一组用于数据科学的R包,包括ggplot2、dplyr、tidyr、readr、pu 阅读全文
posted @ 2023-12-26 10:24 王哲MGG_AI 阅读(127) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:# 清除所有变量 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\NMDS") # 导入所需的库 library(vegan) library(ggplot2) # 读取数据 mydata <- re 阅读全文
posted @ 2023-12-26 10:23 王哲MGG_AI 阅读(105) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:rm (list = ls ()) #清除所有变量 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\PCoA") #设置工作目录 # 加载必要的库 library(dplyr) # 读取数据,假设您的文件名是 data.txt # 请根据您的文件实际 阅读全文
posted @ 2023-12-26 09:43 王哲MGG_AI 阅读(1875) 评论(4) 推荐(0) 编辑
摘要:绝对丰度和相对丰度是生态学和生物统计学中常用的两个概念,它们用于描述物种在特定环境中的分布和数量。 绝对丰度(Absolute Abundance): 绝对丰度是指在特定区域或样本中某个物种的实际数量。 它通常用个体数来衡量,比如在一个湖泊中特定鱼类的个体总数。 绝对丰度提供了物种在给定环境中的具体 阅读全文
posted @ 2023-12-26 09:39 王哲MGG_AI 阅读(7129) 评论(2) 推荐(0) 编辑
摘要:# 清空当前环境中的所有对象 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) library(tidyverse) library(pROC) libra 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:53 王哲MGG_AI 阅读(50) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:# 清空当前环境中的所有对象 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) library(tidyverse) library(pROC) libra 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:53 王哲MGG_AI 阅读(17) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:# 清空当前环境中的所有对象 rm (list = ls ()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\随机森林4") library(randomForest) #随机森林 library(tidyverse) #数据分析和可视化 l 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:51 王哲MGG_AI 阅读(27) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:主成分分析 rm (list = ls ()) library(vegan) library(tidyverse) library(ggalt) library(car) library(ggforce) library(ggpubr) library(patchwork) # 2. 定义所需的函数 阅读全文
posted @ 2023-12-18 20:42 王哲MGG_AI 阅读(271) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:宏基因组测序相比于16S rRNA基因测序技术有几个主要的优势: 全面性:宏基因组测序提供了对整个微生物群落基因组的综合视角,而不仅限于16S rRNA基因。这意味着它能够捕捉到更广泛的微生物多样性,包括细菌、古菌、真菌以及病毒。 功能信息:宏基因组测序不仅能够鉴定微生物群落中的物种,还能提供关于它 阅读全文
posted @ 2023-12-15 14:36 王哲MGG_AI 阅读(685) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:固氮、溶磷和解钾过程: [1] Bulgarelli, D., Schlaeppi, K., Spaepen, S., van Themaat, E. V. L., & Schulze-Lefert, P. (2013). Structure and functions of the bacteri 阅读全文
posted @ 2023-12-12 11:26 王哲MGG_AI 阅读(33) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:首先,什么是nodesize值,以及它的含义和作用。 nodesize值是指定每个叶子节点最少包含的样本数量的整数值,它是随机森林算法的一个重要的参数,它影响了随机森林的复杂度和泛化能力。 nodesize值的含义和作用是控制决策树的生长和剪枝,以及随机森林的随机性和准确性。 当nodesize值较 阅读全文
posted @ 2023-12-05 16:57 王哲MGG_AI 阅读(522) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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