microeco包网络分析的一些关键属性
Vertex 135
Edge 1523
Average_degree 22.562962962963
Average_path_length 2.20846705198353
Network_diameter 6
Clustering_coefficient 0.701431967070555
Density 0.168380320619127
Heterogeneity 0.744514690067939
Centralization 0.264455500276396
Modularity 0.343660068724841
-
Vertex (顶点):
- 135:网络中有135个节点(顶点)。在微生物网络分析中,每个节点通常代表一个微生物分类单元(如属、科、目等)。
-
Edge (边):
- 1523:网络中有1523条边。边表示节点之间的相关性关系。在微生物网络中,边通常代表微生物分类单元之间的相关性(如共现关系)。
-
Average_degree (平均度):
- 22.562962962963:每个节点的平均连接数(度)。这是所有节点的度的平均值。较高的平均度通常表明网络较为密集,节点之间的连接较多。
-
Average_path_length (平均路径长度):
- 2.20846705198353:网络中任意两个节点之间的平均最短路径长度。较短的路径长度通常表示网络较为紧密,信息或物质可以在网络中快速传递。
-
Network_diameter (网络直径):
- 6:网络中最远的两个节点之间的最短路径的长度(通过最少的边数)。这是整个网络中最长的最短路径。
-
Clustering_coefficient (聚类系数):
- 0.701431967070555:衡量节点的邻居节点之间的连接紧密程度。高聚类系数表示网络具有较强的社区结构,节点及其邻居节点之间有较多的三角形连接(闭环)。
-
Density (密度):
- 0.168380320619127:网络中实际存在的边数与可能存在的边数之比。网络密度越高,表示节点之间的连接越多。
-
Heterogeneity (异质性):
- 0.744514690067939:衡量网络节点度的变异性。高异质性表明网络中存在一些高连接度的中心节点,而大多数节点连接较少。
-
Centralization (中心化):
- 0.264455500276396:衡量网络中中心节点的重要性。高中心化表示网络中存在几个重要的中心节点,其他节点大部分与这些中心节点相连。
-
Modularity (模块化):
- 0.343660068724841:衡量网络中社区结构的强度。高模块化值表示网络中存在明显的社区或模块,节点主要在社区内部连接,而社区之间的连接较少。
分析总结:
- 这个网络由135个节点和1523条边组成,平均每个节点有22.56条连接,表明网络比较密集。
- 网络的平均路径长度为2.21,表示节点之间的连接较为紧密。
- 网络直径为6,表明最远的两个节点之间的最短路径较短。
- 聚类系数为0.70,说明网络具有很强的社区结构,节点之间形成了大量的三角形连接。
- 网络密度为0.168,意味着网络中大约16.8%的可能连接是实际存在的。
- 异质性为0.744,表明网络中存在一些高连接度的节点。
- 中心化为0.264,显示出网络中有一些中心节点。
- 模块化为0.344,表示网络具有明显的社区结构。
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R包 microeco
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