LeViT-UNet:transformer 编码器和CNN解码器的有效整合
前言 本文介绍了一种新的医学图像分割架构levi-unet,它使用transformer 作为编码器,这使得它能够更有效地学习远程依赖关系。levi-unet比传统的U-Nets更快,同时仍然实现了最先进的分割性能。
本文转载自DeepHub IMBA
作者 | Golnaz Hosseini
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LeViT-UNet架构
levi - unet的编码器使用LeViT块构建,设计用于高效和有效地学习全局特征。解码器是使用卷积块构建的。
编码器从多个分辨率的输入图像中提取特征映射。这些特征映射被上采样,连接然后通过跳过连接传递到解码器。跳过连接允许解码器从编码器访问高分辨率的局部特征,有助于提高分割性能。
这种设计使模型能够综合transformer 和cnn的优点。transformer 刚擅长学习全局特征,而cnn擅长学习局部特征。通过结合这两种方法,levi - unet能够获得良好的分割性能,同时也相对高效。
LeViT编码器
编码器采用LeViT[1],主要由两个部分组成:卷积块和变压器块。卷积块通过对输入图像应用4层3x3卷积(步幅为2)来执行分辨率降低。在提取更多抽象特征的同时,这将图像的分辨率降低了一半。然后transformer块获取卷积块的特征映射并学习全局特征。
在编码器的最后阶段将来自卷积块和变压器块的特征连接起来。这使得编码器具有本地和全局特性。局部特征对于识别图像中的小而详细的物体很重要,而全局特征对于识别图像的整体结构很重要。通过结合局部和全局特征,编码器能够生成更准确的分割。
根据输入第一个transformer块的通道数量,开发了3个LeViT编码器:levi -128s, levi -192和levi -384。
CNN解码器
levi - unet的解码器将编码器的特征与跳过连接连接在一起。使得解码器能够从编码器访问高分辨率的局部特征,并采用级联上采样策略,利用cnn从前一层恢复分辨率。它由一系列上采样层组成,每个上采样层后面是两个3x3卷积层,一个BN和一个ReLU层。
实验结果
实现细节:数据增强(随机翻转和旋转),优化器(Adam,学习率1e-5,权重衰减1e-4),图像大小224x224,批大小8,epoch 350和400用于Synapse和ACDC数据集
LeViT模型优于现有模型,并且明显快于TransUNet,后者将Transformer块合并到CNN中。
上图显示了TransUNet、UNet、DeepLabv3+和levi -UNet四种不同方法的定性分割结果。其他三种方法更可能导致器官不足或者过度分割。例如,胃被TransUNet和DeepLabV3+分割不足(如上行第三个面板的红色箭头所示),被UNet过度分割(如第二行第四个面板的红色箭头所示)。
与其他方法相比,论文提出的模型输出相对平滑,表明在边界预测方面更具优势。
2篇论文:
[1] Benjamin Graham, Alaaeldin El-Nouby, Hugo Touvron, Pierre Stock, Armand Joulin, Herv’e J’egou, Matthijs Douze, LeViT: a Vision Transformer in ConvNet’s Clothing for Faster Inference, 2021
https://arxiv.org/abs/2104.01136
[2] Guoping Xu, Xingrong Wu, Xuan Zhang, Xinwei He, LeViT-UNet: Make Faster Encoders with Transformer for Medical Image Segmentation, 2021
https://arxiv.org/abs/2107.08623
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