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摘要: 在py文件中能否构建一个个cell 坑, 好像不行,需要用jupyter 可以的: Pycharm: run only part of my Python file - Stack Overflow 今日悟出了奇淫巧技:如何在py文件中构建cell的概念(类似于juptyer),但是可以在pycha 阅读全文
posted @ 2022-08-23 16:39 bH1pJ 阅读(31) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: scanpy change the pdf save path 修改保存地址的路径 figsavePath =r'aaa\bbb\c' fig, ax = plt.subplots() with rc_context({'figure.figsize': (5, 5)}): sc.pl.umap(a 阅读全文
posted @ 2022-08-23 16:26 bH1pJ 阅读(70) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: pandas某一列的某一行, choosed列的第i行: adata.obs['choosed'] = str(0) for i in range(adata.obs['leiden'].shape[0]): id = str(i + 1).zfill(3) if adata.obs['leiden 阅读全文
posted @ 2022-08-23 16:00 bH1pJ 阅读(63) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 最棒的color map,热图的color bar:cmp='bwr' 感觉比matlab里边的turbo好看,比jet好看 阅读全文
posted @ 2022-08-23 11:43 bH1pJ 阅读(33) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 如何理解dotplot 这种图,看起来真的费劲。这么费劲的图,只会给人带来无尽的困扰: dotplot A quick way to check the expression of these genes per cluster is to using a dotplot. This type of 阅读全文
posted @ 2022-08-23 10:53 bH1pJ 阅读(180) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: numpy生成一定范围内的随机数 阅读全文
posted @ 2022-08-21 23:13 bH1pJ 阅读(45) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Numpy进行排序 中文论坛里找了10分钟,不如外论坛找1分钟。 从小到大的排序 arNeurons2 = np.sort(arNeurons, axis=1) # 从大到小的排序 arNeurons2 = -np.sort(-arNeurons, axis=1) 阅读全文
posted @ 2022-08-21 17:22 bH1pJ 阅读(23) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 将Pandas中的DataFrame类型转换成Numpy中array类型的三种方法_qq_30163461的博客-CSDN博客_dataframe转换为array 阅读全文
posted @ 2022-08-21 15:34 bH1pJ 阅读(84) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: pyqtgraph只使用image view进行热图的可视化展示 """ import scipy.io as scio import numpy as np import pyqtgraph as pg from PyQt5 import QtCore, QtGui from PyQt5.QtWi 阅读全文
posted @ 2022-08-21 15:13 bH1pJ 阅读(119) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Matlab中Jet 的HeatMap的 color值分别都是多少? 在python中: colors = [(0, 0, 0), (45, 5, 61), (84, 42, 55), (150, 87, 60), (208, 171, 141), (255, 255, 255)] self.ivN 阅读全文
posted @ 2022-08-21 14:35 bH1pJ 阅读(145) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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