摘要: 今日悟出了奇淫巧技:如何在py文件中构建cell的概念(类似于juptyer),但是可以在pycharm中查看变量,弥补了jupyter的巨大弊端 终于解决了心中的一个大困惑呀。Nice 我去,高兴太早了,所有的cell都会被运行到。。。 郁闷 前人已经有相似的提问了: 这个插件yyds 阅读全文
posted @ 2022-08-23 22:27 bH1pJ 阅读(16) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在py文件中能否构建一个个cell 坑, 好像不行,需要用jupyter 可以的: Pycharm: run only part of my Python file - Stack Overflow 今日悟出了奇淫巧技:如何在py文件中构建cell的概念(类似于juptyer),但是可以在pycha 阅读全文
posted @ 2022-08-23 16:39 bH1pJ 阅读(27) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: scanpy change the pdf save path 修改保存地址的路径 figsavePath =r'aaa\bbb\c' fig, ax = plt.subplots() with rc_context({'figure.figsize': (5, 5)}): sc.pl.umap(a 阅读全文
posted @ 2022-08-23 16:26 bH1pJ 阅读(50) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: pandas某一列的某一行, choosed列的第i行: adata.obs['choosed'] = str(0) for i in range(adata.obs['leiden'].shape[0]): id = str(i + 1).zfill(3) if adata.obs['leiden 阅读全文
posted @ 2022-08-23 16:00 bH1pJ 阅读(59) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 最棒的color map,热图的color bar:cmp='bwr' 感觉比matlab里边的turbo好看,比jet好看 阅读全文
posted @ 2022-08-23 11:43 bH1pJ 阅读(28) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 如何理解dotplot 这种图,看起来真的费劲。这么费劲的图,只会给人带来无尽的困扰: dotplot A quick way to check the expression of these genes per cluster is to using a dotplot. This type of 阅读全文
posted @ 2022-08-23 10:53 bH1pJ 阅读(157) 评论(0) 推荐(0) 编辑