imageJ 对视频序列进行crop和resize的脚本 宏脚本

imageJ 对视频序列进行crop和resize的脚本

以下的功能是：

1、读入一个avi文件；

2、进行crop；

3、进行resize；

4、导出为tif文件；

fileRootPath="rootpath";
fileName="aaa.avi";
ROI=newArray(162,245,842,628);
function processFile(fileRootPath, fileName) {
    setBatchMode(true); 
    open(fileRootPath + "/" + fileName);
    id = getImageID();
    selectImage(id);
    makeRectangle(ROI[0], ROI[1], ROI[2], ROI[3]);
    run("Crop");
    outputFileName = "Crop_"+fileName.substring(0,lengthOf(fileName)-4)+".tif";
    saveAs("Tiff", fileRootPath+"/"+outputFileName);

    run("8-bit");    

    run("Close");
}
processFile(fileRootPath,fileName);

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如果你想导出为avi文件，并进行压缩，

可以将

saveAs("Tiff", fileRootPath+"/"+outputFileName);

修改为（要选择压缩，不然文件的size非常大）：

run("AVI... ", "compression=JPEG frame=60 save=./B.avi");