摘要: 问题描述: Claude Code 2.0 版本更新后,VSCode 插件启用了强制登录验证,要求使用官方账号,导致第三方中转 API 无法使用 VSCode 中的 Claude 插件。如下图所示。 解决方法: 通过修改 settings.json 来绕过登录限制。 示例: 在VSCode的用户se 阅读全文
posted @ 2026-01-27 11:36 wuhaoliu 阅读(503) 评论(0) 推荐(0)
摘要: git clone https@github.com:HuMingLab/SnapHiC.git cd SnapHiC/ micromamba create -n 10_snaphic_env -c https://repo.anaconda.com/pkgs/main -c https://rep 阅读全文
posted @ 2025-11-28 21:53 wuhaoliu 阅读(10) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 如何安装claude code以及ccr code 1. 安装 node 1.1 node的常规安装(适用于linux18.04,linux20.04等新版本) 参考官网安装顺序:https://nodejs.org/en/download 1.2 常规安装失败,其他情况下node的安装(适用于li 阅读全文
posted @ 2025-10-12 23:13 wuhaoliu 阅读(898) 评论(1) 推荐(1)
摘要: 背景: 安装cluade code的前提是安装好版本号大于18的node。但是在工作场景中可能会遇到低版本Linux【16.04】下使用 nvm安装node后报错: (base) ******@ubuntu:~$ node -v node: /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so 阅读全文
posted @ 2025-09-09 15:54 wuhaoliu 阅读(177) 评论(1) 推荐(1)
摘要: 以厂商出厂时自带的驱动版本为第一优先 USB 无线 WIFI 设备驱动一般不需要更新,更新时也要先选择官方渠道更新​:从设备制造商官网官网下载驱动,避免从芯片厂商(如 Realtek)下载,因为芯片厂商的驱动可能并不会适配设备制造商的产品。 COMFAST AC-938 设备设备官方驱动包 http 阅读全文
posted @ 2025-09-08 17:44 wuhaoliu 阅读(35) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 你问的scHi-C、scRNA、DNA损伤这三者主要是单细胞多组学领域常见的三种分析/表征内容,它们分别指: scHi-C(single-cell Hi-C):单细胞水平的染色质高级结构(染色质空间互作/三维基因组)分析技术。 scRNA(single-cell RNA-seq):单细胞转录组测序, 阅读全文
posted @ 2025-07-24 20:59 wuhaoliu 阅读(38) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 好的,我先从基础概念、构建方式、在 scRNA-seq 中的作用,再到如何与 scHi-C 结合的角度,详细解释 共表达网络(Gene Co-expression Network)。 1. 什么是共表达网络? 共表达网络(Gene Co-expression Network)是指: 根据基因在多个样 阅读全文
posted @ 2025-07-24 20:49 wuhaoliu 阅读(30) 评论(0) 推荐(0)
摘要: ✅ 问题背景 scHi-C 最大的问题是: 每个单细胞中观测到的染色质接触对非常稀疏(常仅几千对), 无法完整重构 TAD、Loop 等三维结构。 而 其他单细胞组学数据(如 scRNA-seq、scATAC-seq) 则通常: 数据密度高 信噪比好 功能关联明确 因此,利用这些模态中的结构相关性、 阅读全文
posted @ 2025-07-24 20:44 wuhaoliu 阅读(62) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 由于 scHi-C(单细胞染色质构象捕获)接触矩阵极度稀疏,即每个细胞仅能观测到原始三维基因组结构中极小一部分接触对(通常仅数千对),所以需要特定的策略来缓解稀疏性,以便有效地重建结构特征如 TAD-like structures、Loops 或高阶构象。 ✅ 解决 scHi-C 接触矩阵稀疏的常用 阅读全文
posted @ 2025-07-24 20:42 wuhaoliu 阅读(40) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 🔗 总体逻辑主线:从“语言建模类比”出发,到“结构建模泛化”深化 ⸻ 一、【模型谱系】按方法论发展时间轴 & 研究焦点分层: 语言建模阶段:基因表达的语义化编码尝试 代表模型 方法特点 核心任务 scBERT 基于 Transformer,模仿 BERT 的掩码建模,使用 gene2vec + 离 阅读全文
posted @ 2025-04-14 22:26 wuhaoliu 阅读(106) 评论(0) 推荐(0)