摘要：我们使用linux的转换目录命令 cd 时经常会遇到想回到cd之前目录的情况，比如不小心按了 cd 回车，跳出了工作目录，又想回到刚刚的目录。 这种情况下，就用到了我们这篇博客的主角 cd - 。 cd - 命令可以回到上一个目录，等同于 cd $OLDPWD 执行此命令后，目录会变到上次目录，并返 阅读全文
linux中巧用ctrl-z后台运行程序
2019-02-02 19:27 by 丨o聽乄雨o丨, 1446 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：我们知道后台运行任务时，可以用 () 和 &，但是有的时候我们会忘记加&，对于执行需要很长时间的任务来说，Ctrl+Z可能是一个比较好的把任务转入后台的方法。 当我们按下Ctrl+Z时， [1]+ Stopped /root/bin/rsync.sh 然后我们可以把程序调度到后台执行:(bg 后面的 阅读全文
Failed to set MokListRT: Invalid Parameter Something as gone seriously wrong: import_mok_state() failed: Invalid Parameter
2018-12-14 14:09 by 丨o聽乄雨o丨, 4724 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：今天yum update升级centos7，重启后发现开不了机，报错如下： Failed to set MokListRT: Invalid ParameterSomething as gone seriously wrong: import_mok_state() failed: Invalid 阅读全文
RAxML安装
2018-12-14 00:32 by 丨o聽乄雨o丨, 3824 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：1.下载解压 $ wget https://codeload.github.com/stamatak/standard-RAxML/zip/master -O standard-RAxML-master.zip $ unzip standard-RAxML-master.zip $ cd stand 阅读全文
centos7.5图形界面与命令行界面转换
2018-11-05 11:04 by 丨o聽乄雨o丨, 1966 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：查看当前状态下的显示模式： 转换为图形界面： 转换为命令行界面： 阅读全文
centos7.5固定局域网ip
2018-09-29 17:47 by 丨o聽乄雨o丨, 1335 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：有de时候，比如像我们单位，没事干就停一次网，结果ip变了，还得重新看ip，重新配置，很麻烦，所以干脆把自己ip固定，以不变应万变！！！ 1.首先查看自己的ip是什么： $ ifconfig eno1: flags=4163<UP,BROADCAST,RUNNING,MULTICAST> mtu 1 阅读全文
enzyme design 整体流程及感想
2018-08-13 23:43 by 丨o聽乄雨o丨, 1824 阅读, 2 推荐, 收藏, 编辑
摘要：想起什么来写什么吧。 整体流程（以Ceas2, TPP, G3P为例）： 准备蛋白即配体参数文件(pdb文件需要有header，header的顺序符合cst block的顺序，且residue1和residue2的顺序也必须符合cst block)； 设置CST文件； 准备protocol和flag 阅读全文
rosetta geometric constraint file（用于match和design）
2018-08-12 17:29 by 丨o聽乄雨o丨, 1320 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：cst(constraint file)文件示例： 上述是一个经典的cst文件的示例，res1为三字符的D2N，res2为单字符的氨基酸缩写H（HIS）。 1. cst文件以CST::BEGIN开始，以CST::END结束； 2. TEMPLATE:: ATOM_MAP: 记录什么原子被限制及残基名 阅读全文
关闭图形界面下普通用户关机重启命令- 7.x - CentOS
2018-08-09 12:04 by 丨o聽乄雨o丨, 447 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：不用重启，命令就会运行 阅读全文
Monte Carlo simulated annealing
2018-08-07 21:39 by 丨o聽乄雨o丨, 473 阅读, 0 推荐, 收藏, 编辑
摘要：蒙特·卡罗分子模拟计算 蒙特·卡罗分子模拟计算 使用蒙特·卡罗方法进行分子模拟计算是按照以下步骤进行的： 1． 使用随机数发生器产生一个随机的分子构型。 2． 对此分子构型的其中粒子坐标做无规则的改变，产生一个新的分子构型。 3． 计算新的分子构型的能量。 4． 比较新的分子构型于改变前的分子构型的 阅读全文