摘要：
安装之前注意gcc版本，我用centos8的4.8.5装不了，后面自己安装的gcc8.4.0 1. conda create -n af2 python=3.8 -y 2. conda activate af2 3. conda install -y -c nvidia cudnn==8.0.4 4 阅读全文
随笔档案-2021年10月
RoseTTAFold安装
2021-10-21 15:44 by 丨o聽乄雨o丨, 1383 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
1. 下载RoseTTAFold $ git clone https://github.com/RosettaCommons/RoseTTAFold.git (100M) $ cd RoseTTAFold 2. 下载权重、数据库 $ wget https://files.ipd.uw.edu/pub 阅读全文
rosetta使用silent格式储存PDB结构，节省本地存储
2021-10-10 22:08 by 丨o聽乄雨o丨, 583 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
二进制silent文件是一种专有的Rosetta格式，它比PDB文件紧凑得多，可以存储任意数量的结构，避免了许多文件系统上的磁盘空间和文件数量限制。 一、只需要在输出时加一个flag就可以生成silent格式输出。 flag如下： 1 -out:file:silent scoring.silent 阅读全文
