代码改变世界

calibur处理ROSETTA输出的多个结构文件，clustering

2018-01-24 10:21  丨o聽乄雨o丨  阅读(528)  评论(0)  编辑  收藏  举报

下载网址：https://sourceforge.net/projects/calibur/

安装：

1 $ tar zxvf calibur.tar.gz
2 $ cd calibur
3 $ make

安装完成后，会产生calibur和calibur-lite两个可执行文件。

添加环境变量：

1 $ vim ~/.bashrc
2 　　#calibur
3 　　export PATH=$Programs/calibur:$PATH
4 $ source ~/.bashrc

安装及配置完成。

用法：

1. 首先需要把所有pdb文件的名称制成一个列表；

1 $ ls *.pdb > pdblist

2. 运行calibur；

1 $ calibur pdblist　　　    # 软件自行指定合适的阈值
2 $ calibur pdblist 1　　　　# 自己指定阈值
3 $ calibur　　　　　　　　　　# 打印帮助信息