linux_x86_64 blat安装

blatSrc35.zip下载地址：http://users.soe.ucsc.edu/~kent/src/

对于下载好的源代码安装包blatSrc35.zip，需进行编译,安装过程如下：

1.用unzip blatSrc35.zip 解压缩包；

2.bash：cd blatSrc 进入blatSrc文件夹下(此后直到设置环境变量，都在blatSrc文件夹下操作)；

3.bash：uname -a  查看linux系统类型，我的系统是x86_64 GUN/LINUX;

4.bash：export MACHTYPE=x86_64 回车；

5.bash：mkdir -p ~/bin/x86_64 回车；

6.bash：make 回车；

7.设置环境变量：主目录下（/home/wq） bash:vim .bashrc;

8.按”i”，编辑文档，最后行输入：export PATH=/home/wq/bin:$PATH，编辑完成后Esc，：，wq，回车；

9.bash：source .bashrc更新环境变量。

至此blat安装完毕 bash:blat *.fa **.fa 回车即以**.fa为 母库比对。