centos7 vmd-1.9.3安装

1. 下载安装包

安装包下载地址是http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/，选择自己合适的版本，我下载1.9.3版本

2. 安装必要库

yum install freeglut*

3. 解压

tar zxvf vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz

4. configure

cd vmd-1.9.3
./configure LINUXAMD64 # 不加后面选项会报错

5. 编译

cd src
make install

6. 运行

vmd

 7. 用法

vmd -parm7 $dir/WT_box_strip_wat.prmtop -netcdf $dir/WT_box_wat_md_strip_wat.nc