摘要：
./configure --prefix=/hpcfs/fhome/user/Programs/clustal-omega-1.2.4 CFLAGS='-I/hpcfs/fhome/user/Programs/argtable2-13/include' LDFLAGS="-L/hpcfs/fhome 阅读全文
随笔分类 - software
ubuntu2004安装Multiwfn
2023-09-06 18:30 by 丨o聽乄雨o丨, 72 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
安装依赖库： sudo apt install libxm4 libgl1 解压后调整环境变量： #Multiwfn3.8dev export OMP_STACKSIZE=200M ulimit -s unlimited export Multiwfnpath=$Programs/Multiwfn_ 阅读全文
配置tabby目录跟随
2023-05-22 11:12 by 丨o聽乄雨o丨, 238 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
BASH： 打开配置： vim ~/.bashrc 加入下面这句： 1 # directory following 2 export PS1="$PS1\[\e]1337;CurrentDir="'$(pwd)\a\]' ZSH： vim ~/.zshrc: 加入下面这句： 1 precmd () 阅读全文
unbantu libsqlite3.o
2022-10-12 15:54 by 丨o聽乄雨o丨, 31 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
1 sudo apt-get install sqlite3 2 sudo apt-get install libsqlite3-0 3 sudo apt-get install libsqlite3-dev 阅读全文
onionnet安装
2022-06-02 17:42 by 丨o聽乄雨o丨, 32 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
conda env create -f onionnet.yaml python -m pip install --upgrade pip pip install -r requirements_onionnet.txt conda install -c conda-forge mdtraj(如果后 阅读全文
origin散点图坐标轴遮挡问题解决方法
2022-05-06 16:17 by 丨o聽乄雨o丨, 3882 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
解决办法： 双击坐标系内任意空白区域，在打开的plot details 对话框中选择display标签，在clipping margins设置HV均为-2即可。 阅读全文
alphafold2_conda版安装
2021-10-22 11:34 by 丨o聽乄雨o丨, 861 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
安装之前注意gcc版本，我用centos8的4.8.5装不了，后面自己安装的gcc8.4.0 1. conda create -n af2 python=3.8 -y 2. conda activate af2 3. conda install -y -c nvidia cudnn==8.0.4 4 阅读全文
RoseTTAFold安装
2021-10-21 15:44 by 丨o聽乄雨o丨, 1280 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
1. 下载RoseTTAFold $ git clone https://github.com/RosettaCommons/RoseTTAFold.git (100M) $ cd RoseTTAFold 2. 下载权重、数据库 $ wget https://files.ipd.uw.edu/pub 阅读全文
alphafold2的几项便利性修改。
2021-08-31 16:34 by 丨o聽乄雨o丨, 449 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
#Run alphafold2 # conda activate af2 # run_alphafold.py --fasta_paths=Test.fasta --max_template_date=2020-05-14 # run_alphafold.py --fasta_paths=N7.fa 阅读全文
centos8/7 非root安装gcc8.4.0, 解决gcc版本过低及libgfortran.so.5缺失问题
2021-07-29 19:57 by 丨o聽乄雨o丨, 4355 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
在非root环境下安装gcc-8.4.0，可以解决redhat/centos gcc版本过低导致的软件编译错误的问题。gcc-8.4.0需要一系列的依赖包。 1.下载依赖包: gmp-6.2.0, mpfr-4.1.0, mpc-1.2.0, isl-0.18 可以从以下链接中下载 http://m 阅读全文
centos8.2装teamviewer，启动时无法显示GUI，无法登录，但是不报错的解决办法。
2020-11-26 19:43 by 丨o聽乄雨o丨, 784 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
首先明确一点，不是不报错，而是错误储存到了log里，你没看到！ 安装的过程很简单，装的时候teamviewer也不报错，也就不赘述了。 下面说解决办法： 到teamviewer官网下载源码版本teamviewer_15.12.4_amd64.tar.xz $ #解压$ tar -xvf teamvi 阅读全文
xmgrace用法简记
2020-11-26 15:46 by 丨o聽乄雨o丨, 784 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
读取已有参数文件(-param) xmgrace rmsd.agr -param rmsd.parms 修改print_setup为PNG（设置Transparent还没找到怎么设置），设置输出名称为TAX_rmsd.png，设置输出目录为$dir，还可以设置直接输出图片而不打开交互页面（-hard 阅读全文
centos8安装xmgrace5.1.25
2020-10-26 21:48 by 丨o聽乄雨o丨, 717 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
1.下载完.tar.gz格式安装包后，先安装依赖； dnf install motif motif-devel openmotif openmotif-devel libXpm-devel libXp-devel xorg-x11-xbitmaps xorg-x11-fonts* 2.解压安装包，安 阅读全文
centos8.2安装nvidia 1660s驱动及cuda10.2
2020-10-21 11:37 by 丨o聽乄雨o丨, 2611 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
本篇博客吸收了这篇外文博客https://linuxconfig.org/how-to-install-the-nvidia-drivers-on-centos-8 同时根据自己的问题又做了相关整理，欢迎大家提问。 安装过程中的难点以及注意点。主要有关闭 nouveau 驱动，关闭 security 阅读全文
chimera里常用到的命令
2020-06-19 23:21 by 丨o聽乄雨o丨, 999 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
sel #0:1.a ~sel set bgcolor white rlabel #0:14.A:15.A:16.A:17.A:115.A:13.A:117.A:118.A color green,rl #1:1336.A:1337.A:1338.A:1339.A:1014.A:1335.A:104 阅读全文
Pymol里常用到的命令，随用随记
2020-06-09 16:04 by 丨o聽乄雨o丨, 3000 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
python脚本运行方式： 1, File->Run Script->选择python脚本; 2, run python脚本 常用命令： load *.pdb remove solvent select str1, resn Cl- remove str1 align WT_ligs, WT_box 阅读全文
Centos 7, Torque 单节点部署 （转载）
2019-10-12 19:40 by 丨o聽乄雨o丨, 1226 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
转载自https://www.cnblogs.com/zhaosongbin/p/8492470.html，主要用途为自己学习和记录。 1. 准备工作 安装Torque必须首先配置linux主机名称，服务器主机名称大多默认localhost,不建议直接使用localhost。我这里修改为master 阅读全文
解决photoshop illustrator CS6在高分屏下图标文字过小的情况
2019-06-13 20:13 by 丨o聽乄雨o丨, 1064 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
参考的一位国外的大神的经验。 1、开始-运行-regedit 打开注册表编辑器；在地址栏输入“计算机\HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\SideBySide”，回车展开；右侧空白处右键点击新建-DWORD(32位 阅读全文
centos7.5 安装gaussian09和 gaussianview4
2019-04-14 20:31 by 丨o聽乄雨o丨, 3163 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
一、安装gaussian09 1. 解压安装包 2. 设置环境变量 3.错误 PGFIO/stdio: No such file or directory 解决方法： 4. g16安装方法基本类似 二、安装gaussianview4 1. 安装必要的库 2. 解压gv04 3. 设置环境变量 4. 阅读全文
centos7 vmd-1.9.3安装
2019-04-14 17:19 by 丨o聽乄雨o丨, 3750 阅读, 收藏, 编辑
摘要：
1. 下载安装包 安装包下载地址是http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/，选择自己合适的版本，我下载1.9.3版本 2. 安装必要库 yum install freeglut* 3. 解压 tar zxvf vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA 阅读全文