R语言之数据可视化 - RMarkdown 制作报告

1. 可重复研究 和 可再生研究（Replication vs. Reproducible Research）

　　1.1 Replication（可重复）

　　　　- 独立的研究者 / 数据 / 分析方法 / 工具得到一致的证据

　　　　　　· 小保方晴子

　　　　　　· 具身认知（embodied cognition）

　　　　- 缺点：

　　　　　　· 有些研究不可能被重复：没钱 / 没时间 / 没机会 / 独特性

　　1.2 Reproducible Research（可再现研究）

　　　　- 让数据和分析过程（code）透明

　　　　- 使用你的数据和分析方法得到你的结果

2. R  Markdown

　　- Reproducible Research 的工具

　　　　- 人可以读懂的语言：文字（目的 / 方法）

　　　　- 机器可以读懂的语言：code（夹在数据 / 计算结果 / 生成图和表）

　　　　- R  Markdown：R  code + Markdown

　　　　- R  Markdown => Markdown => HTML

　　- Markdown 语法：

　　　　1. 斜体  

　　　　　　* two stars *

　　　　2. 粗体  

　　　　　　** four stars **

　　　　3. 标题

　　　　　　## This is a secondary heading

　　　　　　### This is a tertiary heading

　　　　4. 无序列表

　　　　　　- first item

　　　　　　- second item

　　　　5. 有序列表

　　　　　　1. first item

　　　　　　2. second item

　　　　6. 链接

　　　　　　[imooc](http://www.imooc.com) 

　　　　7. 新行 / 换行

　　　　　　在上一行结尾添加两个空格

　　　　8. 更多请参见：

　　　　　　http://daringfireball.net/projects/markdown/basics

　　　　　　http://help.github.com/articles/working-with-advanced-formatting/

　　- 实例：

　　　　1. 软件自带案例

---
title: "test"
author: "Wayne"
date: "2017年2月25日"
output: html_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

## R Markdown

This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.

When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:

```{r cars}
summary(cars)
```

## Including Plots

You can also embed plots, for example:

```{r pressure, echo=FALSE}
plot(pressure)
```

Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

　　

　　　　2. 一个简单案例

---
title: "Welcome to R Visualization"
author: "Wayne"
date: "2017年2月25日"
output: html_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

## R Visualization

## Base Plotting System
- plot
- prictice

## Lattice Plotting System

## ggplot2 Plotting System
1. qplot
2. ggplot

Welcome to [imooc](http://www.imooc.com)