fMRI数据分析相关软件与工具

背景

近期在处理fMRI数据，在此记录一些常用数据处理软件、工具及说明文件，便于随时查找。

1、Rest plus

包括数据处理的pipeline，以及各种绘图功能。安装方法：直接下载安装包并解压到当前文件夹，移动至MATLAB的toolbox文件夹，并设置路径，在命令行输入“restplus”即可调出界面。

软件包下载链接：http://www.restfmri.net/forum/sites/default/files/200902_1511_RESTplus_v1.24.tar.gz

Manual：http://www.restfmri.net/forum/sites/default/files/RESTplus%20V1.21%20Manual.pdf

2、Conn

同样包括数据处理的pipeline，以及各种绘图功能。特点是做功能连接分析。安装方法：直接下载安装包并解压到当前文件夹，移动至MATLAB的toolbox文件夹，并设置路径，在命令行输入“conn”即可调出界面。

软件包下载链接：https://www.nitrc.org/projects/conn/

3、Cat12

主要是用于脑部疾病的VBM分析，处理多种结构像数据。

软件包下载链接：http://www.neuro.uni-jena.de/cat/index.html#DOWNLOAD

Manual：http://www.neuro.uni-jena.de/cat12/CAT12-Manual.pdf

4、AFNI

同样包括数据处理的pipeline，以及各种绘图功能。个人主要用于统计分析。

官网链接：https://afni.nimh.nih.gov/

Manual：https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/doc/program_help/

培训材料：https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/edu/2007_02_korea/afni_pdf_handouts/

中文版教程：https://max.book118.com/html/2016/0421/40991686.shtm

5、SPM Anatomy Toolbox

主要是用于roi的定义与提取。

软件下载链接：https://www.fz-juelich.de/SharedDocs/Downloads/INM/INM-7/EN/SPM_Toolbox/Toolbox_22c.html

 

根据学习进度，后续会继续补充相关内容。