摘要:
1 开发环境准备 Python 3.7+Anaconda3 5.3.1(64位)+CUDA+Pycharm Community 2 安装Anaconda 2.1 进入官网下载: 根据windows版本选择64位或32位进行下载,这里选择3.7版本64位进行下载。 2.2 下载后获得.exe文件,双击 阅读全文
摘要:
背景:当拷贝了配置好的虚拟机原始文件夹到新的电脑时,再次利用VMware打开虚拟机,开机后就发现屏幕出现下图中的报错。 分析:Ubuntu在开机进入桌面时,首先会调用gnome-setting-deamon,进而调用当前用户的包括字体、显示器、开机运行程序等设置。上述弹窗的意思是,无法应用监视器的存 阅读全文
摘要:
以下代码的功能是:基于存储在“Caculating”文件夹下的多个受试者的T1结构像,使用Freesurfer做recon-all处理(非并行)。 #!/usr/bin/env bash export SUBJECTS_DIR=/yourpath/brain_models for subj in ` 阅读全文
摘要:
背景 近期在给多台电脑安装E-Prime 2.0以达到同时多被试进行实验,遇到一些问题,通过参考别人的方法最终解决。在此记录解决方法,便于后期随时查找。 1、Flipping required. 当出现下图错误时,解决方法如下。 1.1 点击Windows“开始”→“E-Prime 2.0”→“St 阅读全文
摘要:
背景 近期在处理fMRI数据,在此记录一些常用数据处理软件、工具及说明文件,便于随时查找。 1、Rest plus 包括数据处理的pipeline,以及各种绘图功能。安装方法:直接下载安装包并解压到当前文件夹,移动至MATLAB的toolbox文件夹,并设置路径,在命令行输入“restplus”即可 阅读全文
摘要:
背景 在学习fMRI数据处理的过程中,通过其他的资料看到了别人推荐的有用的fMRI数据处理软件和小插件,在此记录一下,以便后期慢慢学习使用。 1、NeuroImaging Analysis Kit (NIAK) fMRI数据预处理及质量控制pipeline。 2、FieldTrip 处理EEG、ME 阅读全文
摘要:
背景 处理fMRI数据常常用到MATLAB,在此记录一些常用代码及功能。 1、读取原始DICOM数据 1-1 读入dicom图像并绘图: Image = dicomread('fMRI.dcm'); figure; imshow(Image, [ ]); 1-2 读取dicom图像并查看图像相关信息 阅读全文
摘要:
背景 最近处理行为学数据和fMRI数据,主要使用MATLAB。有一些常用的代码被自己重复使用,所以在此记录,以便于随时调取使用。 1、PVT原生mat文件→txt文件 遇到在处理一些被试的PVT数据时,有一些数据被存为原生的mat文件。因此需要使用以下代码得到txt文件。 close all; cl 阅读全文
摘要:
1 问题描述 使用Anaconda配置了包括Pytorch、Tensorflow等多个虚拟环境后,依然无法使用Jupyter Notebook选择不同的虚拟环境运行代码,问题如下图所示。 2 解决方法 2.1 首先查看当前存在的虚拟环境: 使用组合键“win+R”打开命令提示符,输入以下命令进行查看 阅读全文
摘要:
1 数字图像处理初识 一幅图像可以这样进行定义:使用一个二维函数f(x,y),其中x和y是是空间坐标,而f在任意一对坐标(x,y)处的幅度称作该点处图像的亮度或者灰度。当x,y和f的幅值都是有限的离散值时,称该图像为数字图像。数字图像处理就是使用计算机处理这些数字图像。需要注意的是,数字图像是由有限 阅读全文