生物信息学

单体型？

药物反应预测？

药物疾病关联预测？

miRNA-疾病预测？

De novo assembly , De novo 测序， polyploid/haplotype phasing

生物信息学目前主要根据基因与基因组来算命；未来应该考虑到基因之外的其他因素。在我这个非常非常小的领域，以前的研究范式是：噬菌体展示实验，或噬菌体展示实验+生物信息学分析。随着数据的积累与深度学习方法的进步，我想未来范式可能是根据数据建立特定虚拟噬菌体展示模型（生物信息学），然后实验验证算命结果

《命自我立》这是禅宗的思想，所谓心外无物，出世即禅宗，入世即心学，跟贝克莱的思维是一致的。不过这套东西太老了，没有什么发展，所以已经不能再忽

生物信息学目前主要根据基因与基因组来算命；未来应该考虑到基因之外的其他因素。在我这个非常非常小的领域，以前的研究范式是：噬菌体展示实验，或噬菌体展示实验+生物信息学分析。随着数据的积累与深度学习方法的进步，我想未来范式可能是根据数据建立特定虚拟噬菌体展示模型（生物信息学），然后实验验证算命结果。收起

名校中的王牌专业和劝退专业，就业率和就业质量可以差出一大截。有些同学图面子，迷信985名校的品牌和光环，其就业结果可能不尽如人意。就算是考上名校本科的好专业，未来大概率还得读研，否则还是很难进入高层次的平台工作。

生物信息学就是算命的，算所有形式的生命及遗传环境互作下的命运，并为如何改变命运提供关键靶标与可行方案。正如《命自我立》的前半段，人生很多事都是命中注定的，取决于你的基因组。生物信息学一开始就是根据基因与基因组来算命的。但事实上，我们的命运至少还有一半取决于环境。因此，即便命中注定，我们也还有机会通过适应环境，改造环境，选择或逃离特定环境来改变命运。这就好像《命自我立》的后半段，在知道自己造化的命运之后，人们仍然能有机会掌握自己的未来。

生物信息学是以分子生物学（实验、技术）为基础，以计算机（软件、算法）和信息技术（数据筛选、数据库建立）为工具来分析解决生物学问题的一门交叉学科。

生物信息学应用领域非常广泛，从学科划分来说，生物科学、农学、林学、医学等所有涉及生命的领域，都有生物信息学的身影

1996年作为第一个测出基因组真核生物，酿酒酵母一直是生物信息之船的强大引擎。

重复数深度覆盖度biological replicates/depths/coverage
Drug response prediction
Drug Target interaction prediction

(WGCNA)weighted gene co-expression network analysis
DDI=Drug-Drug interactions
de novo assembly
detect SV using long reads
Differential Expression Analysis
GGI=gene-gene interactions
GWAS
haplotype assembly 单体型组装
polyploid phasing
PPI(Protein-Protein Interaction)
Single Cell Sequencing 单细胞测序
SNP-SNP interactions