基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析

基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析

吕利王晓利张文娟韩芝侠

宝鸡文理学院电子电气工程学院

摘要：目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷，并提出改进措施，以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法，包括基于“校正后组装”策略的FALCON,Canu和MECAT组装方法，基于“组装后校正”策略的Flye和Wtdbg2组装方法，指出不同策略的优缺点。结果与结论综合2种组装策略的优势，提出了可以融合2种组装策略优势的新的基因组组装方案，解决了当前基于三代测序数据的基因组组装中的难点。

关键词：

三代测序数据;基因组组装;生物信息学;

基金资助：

宝鸡文理学院重点科研项目(ZK16120)； 宝鸡文理学院第十五批教学改革项目(20JGYB57)；

• DOI：

  10.13467/j.cnki.jbuns.2023.01.009

• 专辑：

  基础科学

• 专题：

  生物学

• 分类号：

  Q811.4