2016年大数据与精准生物医学信息学研讨会 上海

2016年大数据与精准生物医学信息学研讨会
(2016年3月25-27日, 上海交通大学)

会议背景

                   服务器的高性能计算越来越成为各行各业关注的最大焦点，异构服务器不论是产品架构的变化，还是应用技术的更新，最终都将在用户的需求中一分高低。然而在生命科学产业快速增长和市场急剧膨胀的过程中，必然对作为生命科学行业畅通后盾的服务器产品提出了更新更高的要求。正是在这种环境背景下，我们共同主办了这次研讨会，不仅希望能跟进生命科学行业的发展，适时的研发推出符合应用要求的高品质服务器，还希望加强高性能计算在医疗中的作用，走在推进精准生物医学信息学的前列。

               出于这个目的，我们邀请了相关领域的技术专家和技术工程师，在2016年3月组织了这次“2016年大数据与精准生物医学信息学研讨会”，让技术专家与生命科学行业的用户进行面对面的交流和沟通。

会议主题

大数据与精准生物医学信息学（精准医学和HPC高性能计算）

        会议将围绕精准医学与高性能计算的核心问题展开讨论，涉及个性化医疗与个体用药，药物基因组学，复杂疾病的遗传学机制，肿瘤分型与精准治疗，影像数据的高效利用，“精准医疗”的IT系统，基因测序海量数据的有效利用，大数据与云计算等。

议程安排

会议时间：3月26-27日

会议地点：上海交通大学闵行校区陈瑞球楼一楼100号报告厅

3月 25 日（周五）: 专家报到
入住与报到地点：上海市闵行区东川路800号上海交通大学学术活动中心

3月26日（周六）上午

8:00-8:30  签到
8:30-8:50 开幕式 主持人：魏冬青 上海交通大学
8:30-8:45	校长致欢迎词 梅宏 上海交通大学 副校长  中国科学院 院士
8:45-9:00	浪潮集团上海公司致辞 孙业志 董事长兼CEO  浪潮集团上海公司
特邀专家报告
9:00-9:40	大数据与精准医学 陈润生 院士   中国科学院
9:40-10:20	基于全基因组的CVTree方法帮助对大量致病或抗药菌株分组 郝柏林 院士   中国科学院
（10:20-10:35）专家合影
主持人：陈洛南 中国科学院上海生命科学研究院
10:35-11:00	HPC,个性化药物设计，花椒素的发现与抗衰老作用 魏冬青 教授    上海交通大学
11:00-11:25	天河超级计算机上的生物医药大数据研究 彭绍亮 研究员   国防科技大学
（11:25-12:00）参观π超算中心
（12:00-13:30）午餐

 

3月26日（周六）下午

第一场主题报告 主持人：彭绍亮  国防科技大学
13:30-13:55	生物医学大数据的“疾病前兆”预警理论和方法：基于动态网络标志物的“未病”的定量诊断 陈洛南 研究员   中国科学院上海生命科学研究院
13:55-14:20	Rapid Drug Safety Assessment in the Big Data Era 纪志梁 教授     厦门大学
14:20-14:40	基因大数据与精准医学 金刚 总裁       云健康医疗科技集团
14:40-15:00	GPU与深度学习加速生物医药大数据与精准医学发展 袁永清 专家     NVIDIA
15:00-15:25	Discovery of mutated driver pathways in cancer 张世华 副研究员 中国科学院数学与系统科学研究院
15:25-15:50	Collaborative Inference of ChIP-seq Datasets 黄德双 教授     同济大学
（15:50-16:05）茶歇
第二场主题报告 主持人：陈洛南  中科院上海生命科学研究院
16:05-16:25	高速智能网络对精准生物医学研究的重要性 刘通 HPC专家   Mellanox
16:25-16:50	Simulating the conformational change of membrane transporters and channels 龚海鹏 副教授   清华大学
16:50-17:10	高性能计算在基因组学研究中的应用 朱红 高性能计算专家 浪潮集团
17:10-17:35	冷冻电镜数据处理与生物大分子三维重构 张法 副研究员   中国科学院计算技术研究所
(18:30-20:00)答谢晚宴 地点：上海交通大学学术活动中心

 

 

3月27日（周日）上午

第三场主题报告 主持人：蒋太交 中科院生物物理研究所
8:30-8:55	Disease study by whole-genome and transcriptome sequencing of animal models 李亦学 教授     上海交通大学
8:55-9:20	基因组数据指导的医药创新 师咏勇 教授     上海交通大学Bio-X研究院
9:20-9:40	大数据在医学中的应用 靳超   专家     上海欧易生物医学科技有限公司
9:40-10:05	Divergent expression of immune-response related genes between LUAD and LUSC type lung cancers 王秀杰 研究员   中国科学院遗传与发育生物学研究所
10:05-10:30	Exploring the Pathogenic Mechanism of Pituitary Adenomas:A Transomic Study Based on Trancriptomic and Metabolomic Profiling 朱峰   教授     重庆大学
（10:30-10:45）茶歇
第四场主题报告 主持人：李亦学 上海交通大学
10:45-11:10	微生物和人类疾病网络分析 崔庆华 教授     北京大学
11:10-11:35	肠道菌群应该成为精准医学研究与应用的关键所在 张成岗 研究员   军事医学科学院放射与辐射医学研究所
11:35-12:00	微生物组学与精准医疗 蒋兴鹏 教授     华中师范大学
（12:00-13:30）午餐

 

3月27日（周日）下午

 

第五场主题报告 主持人：纪志梁 厦门大学
13:30-13:55	P4+ Medicine and the Clinically Actionable Alterations 沈百荣 教授     苏州大学
13:55-14:20	microRNA多水平分子互作网络助力肿瘤研究 陈铭  教授      浙江大学
14:20-14:45	大数据时代的传染病演化模拟 蒋太交 研究员  中国科学院生物物理研究所
14:45-15:10	λ-platform: Life and Medical Biology Data Accelerator 谭光明 研究员   中国科学院计算技术研究所
15:10-15:35	GIPS:Automatic and accurate identification of glycan branching structures using multistage mass spectrometry 卜东波 研究员   中国科学院计算技术研究所
15:35-16:00	Development of mining algorithms for biological data 李国君 教授     山东大学
茶歇（16:00-16:15）
第六场主题报告 主持人：李国君 山东大学
16:15-16:40	从RNA-seq到Drop-seq 张勇   教授     同济大学
16:40-17:05	DNA多序列比对中的算法技术和并行方法 邹权   研究员   天津大学
17:05-17:30	Large Scale Permutation Test for Validating Bioinformatic Findings 何增有 副教授   大连理工大学
17:30-17:55	Copy Number Variants Calling by Multi-constrained Optimization 蔡宏民 副教授   华南理工大学
17:55-18:00	大会总结致辞 魏冬青 教授     上海交通大学
闭幕式