深度学习框架PyTorch一书的学习-第五章-常用工具模块

https://github.com/chenyuntc/pytorch-book/blob/v1.0/chapter5-常用工具/chapter5.ipynb

希望大家直接到上面的网址去查看代码,下面是本人的笔记

 

在训练神经网络过程中,需要用到很多工具,其中最重要的三部分是:数据、可视化和GPU加速。本章主要介绍Pytorch在这几方面的工具模块,合理使用这些工具能够极大地提高编码效率。

1.数据处理

PyTorch提供了几个高效便捷的工具,以便使用者进行数据处理或增强等操作,同时可通过并行化加速数据加载。

基本原理就是使用Dataset提供数据集的封装,再使用Dataloader实现数据并行加载

1)Dataset

在PyTorch中,数据加载可通过自定义的数据集对象。数据集对象被抽象为Dataset类,实现自定义的数据集需要继承Dataset,并实现两个Python魔法方法:

  • __getitem__:返回一条数据,或一个样本。obj[index]等价于obj.__getitem__(index)
  • __len__:返回样本的数量。len(obj)等价于obj.__len__()

这里我们以Kaggle经典挑战赛"Dogs vs. Cat"的数据为例,来详细讲解如何处理数据。"Dogs vs. Cats"是一个分类问题,判断一张图片是狗还是猫,其所有图片都存放在一个文件夹下,根据文件名的前缀判断是狗还是猫。

import torch as t
from torch.utils import data

自定义数据集加载函数:

import os
from PIL import Image
import numpy as np

#加载数据
class DogCat(data.Dataset):
    def __init__(self, root):
        imgs = os.listdir(root)
        #所有图片的绝对路径
        #这里不实际加载图片,只是指定路径,当调用__getitem__时才会真正读图片
        self.imgs = [os.path.join(root, img) for img in imgs]
        
    def __getitem__(self, index): #生成图片数据及其标签数据
        img_path = self.imgs[index]
        #dog则label为1,cat则为0
        label = 1 if 'dog' in img_path.split('/')[-1] else 0
        pil_img = Image.open(img_path)
        array = np.asarray(pil_img)
        data = t.from_numpy(array)
        return data, label
    
    def __len__(self): #得到数据大小信息
        return len(self.imgs)

测试:

dataset = DogCat('./data/dogcat/')
img, label = dataset[0] #相当于调用dataset.__getitem__(0)
for img, label in dataset:
    print(img.size(), img.float().mean(), label)

返回:

torch.Size([375, 499, 3]) tensor(150.5079) 1
torch.Size([500, 497, 3]) tensor(106.4915) 0
torch.Size([499, 379, 3]) tensor(171.8085) 0
torch.Size([375, 499, 3]) tensor(116.8138) 1
torch.Size([374, 499, 3]) tensor(115.5177) 0
torch.Size([236, 289, 3]) tensor(130.3004) 0
torch.Size([377, 499, 3]) tensor(151.7174) 1
torch.Size([400, 300, 3]) tensor(128.1550) 1

通过上面的代码,我们学习了如何自定义自己的数据集,并可以依次获取。但这里返回的数据不适合实际使用,因其具有如下两方面问题:

  • 返回样本的形状不一,因每张图片的大小不一样,这对于需要取batch训练的神经网络来说很不友好
  • 返回样本的数值较大,未归一化至[-1, 1]

针对上述问题,PyTorch提供了torchvision1。它是一个视觉工具包,提供了很多视觉图像处理的工具,其中transforms模块提供了对PIL Image对象和Tensor对象的常用操作。

对PIL Image的操作包括:

  • Scale:调整图片尺寸,长宽比保持不变
  • CenterCropRandomCropRandomResizedCrop: 裁剪图片
  • Pad:填充
  • ToTensor:将PIL Image对象转成Tensor,会自动将[0, 255]归一化至[0, 1]

对Tensor的操作包括:

  • Normalize:标准化,即减均值,除以标准差
  • ToPILImage:将Tensor转为PIL Image对象

如果要对图片进行多个操作,可通过Compose函数将这些操作拼接起来,类似于nn.Sequential。注意,这些操作定义后是以函数的形式存在,真正使用时需调用它的__call__方法,这点类似于nn.Module。例如要将图片调整为$224\times 224$,首先应构建这个操作trans = Resize((224, 224)),然后调用trans(img)

下面我们就用transforms的这些操作来优化上面实现的dataset

import os
from PIL import Image
import numpy as np
from torchvision import transforms as T

transform = T.Compose([
    T.Resize(224), #缩放图片,保持长宽比不变,最短边为224像素
    T.CenterCrop(224), #从图片中间切出224*224的图片
    T.ToTensor(), #将图片(Image)转成Tensor,归一化至[0, 1]
    T.Normalize(mean=[.5, .5, .5], std=[.5, .5, .5]) # 标准化至[-1, 1],规定均值和标准差,即减均值,除以标准差
])

#加载数据
class DogCat(data.Dataset):
    def __init__(self, root, transforms=None):
        imgs = os.listdir(root)
        #所有图片的绝对路径
        #这里不实际加载图片,只是指定路径,当调用__getitem__时才会真正读图片
        self.imgs = [os.path.join(root, img) for img in imgs]
        self.transforms = transform
        
    def __getitem__(self, index): #生成图片数据及其标签数据
        img_path = self.imgs[index]
        #dog则label为1,cat则为0
        label = 0 if 'dog' in img_path.split('/')[-1] else 1
        data = Image.open(img_path)
        if self.transforms:
            data = self.transforms(data)
        return data, label
    
    def __len__(self): #得到数据大小信息
        return len(self.imgs)
    
dataset = DogCat('./data/dogcat/', transforms=transform)
img, label = dataset[0]
for img, label in dataset:
    print(img.size(), label)

返回:

torch.Size([3, 224, 224]) 0
torch.Size([3, 224, 224]) 1
torch.Size([3, 224, 224]) 1
torch.Size([3, 224, 224]) 0
torch.Size([3, 224, 224]) 1
torch.Size([3, 224, 224]) 1
torch.Size([3, 224, 224]) 0
torch.Size([3, 224, 224]) 0

 

除了上述操作之外,transforms还可通过Lambda封装自定义的转换策略。例如想对PIL Image进行随机旋转,则可写成这样:

trans=T.Lambda(lambda img: img.rotate(random()*360))

torchvision已经预先实现了常用的Dataset,包括前面使用过的CIFAR-10,以及ImageNet、COCO、MNIST、LSUN等数据集,可通过诸如torchvision.datasets.CIFAR10来调用,具体使用方法请参看官方文档1。在这里介绍一个会经常使用到的Dataset——ImageFolder,它的实现和上述的DogCat很相似。

ImageFolder假设所有的文件按文件夹保存,每个文件夹下存储同一个类别的图片,文件夹名为类名,其构造函数如下:

ImageFolder(root, transform=None, target_transform=None, loader=default_loader)

它主要有四个参数:

  • root:在root指定的路径下寻找图片
  • transform:对PIL Image进行的转换操作,transform的输入是使用loader读取图片的返回对象
  • target_transform:对label的转换
  • loader:给定路径后如何读取图片,默认读取为RGB格式的PIL Image对象

label是按照文件夹名顺序排序后存成字典,即{类名:类序号(从0开始)},一般来说最好直接将文件夹命名为从0开始的数字,这样会和ImageFolder实际的label一致,如果不是这种命名规范,建议看看self.class_to_idx属性以了解label和文件夹名的映射关系。

有以下成员变量:

  • self.classes - 用一个list保存 类名
  • self.class_to_idx - 类名对应的 索引
  • self.imgs - 保存(图片路径, 图片class) tuple的list

比如文件:

root/dog/xxx.png
root/dog/xxy.png
root/dog/xxz.png

root/cat/123.png
root/cat/nsdf3.png
root/cat/asd932_.png

调用为:

dset.ImageFolder(root="root folder path", [transform, target_transform])

 

开始操作:

from torchvision.datasets import ImageFolder
dataset = ImageFolder('data/dogcat_2/')

查看:

# cat文件夹的图片对应label 0,dog对应1
dataset.class_to_idx

返回:

{'cat': 0, 'dog': 1}

 

#图片对应的类别
dataset.classes

返回:

['cat', 'dog']

 

# 所有图片的路径和对应的label
dataset.imgs

返回:

[('data/dogcat_2/cat/cat.12484.jpg', 0),
 ('data/dogcat_2/cat/cat.12485.jpg', 0),
 ('data/dogcat_2/cat/cat.12486.jpg', 0),
 ('data/dogcat_2/cat/cat.12487.jpg', 0),
 ('data/dogcat_2/dog/dog.12496.jpg', 1),
 ('data/dogcat_2/dog/dog.12497.jpg', 1),
 ('data/dogcat_2/dog/dog.12498.jpg', 1),
 ('data/dogcat_2/dog/dog.12499.jpg', 1)]

 

# 没有任何的transform,所以返回的还是PIL Image对象
print(dataset[0][1]) # 第一维是第几张图,第二维为1返回label,返回0
dataset[0][0] # 为0返回图片数据

图示:

定义transform:

#加上transform
#给定均值:(R,G,B) 方差:(R,G,B),将会把Tensor正则化。
#即:Normalized_image=(image-mean)/std
normalize = T.Normalize(mean=[0.4, 0.4, 0.4], std=[0.2, 0.2, 0.2])
transform = T.Compose([
    T.RandomResizedCrop(224), #先将给定的PIL.Image随机切,然后再resize成给定的size大小
    T.RandomHorizontalFlip(), #随机水平翻转,概率为0.5。即:一半的概率翻转,一半的概率不翻转
    #把一个取值范围是[0,255]的PIL.Image或者shape为(H,W,C)的numpy.ndarray,
    #转换成形状为[C,H,W],取值范围是[0,1.0]的torch.FloadTensor    
    T.ToTensor(),
    normalize,
])

获取图片数据:

dataset = ImageFolder('data/dogcat_2/', transform=transform)

查看图片数据大小:

## 深度学习中图片数据一般保存成CxHxW,即通道数x图片高x图片宽
dataset[0][0].size()

返回:

torch.Size([3, 224, 224])

将tensor图片数据变回图片:

to_img = T.ToPILImage()
#将dataset[0][0]的图片数据通过和标准差和均值的计算重新返回成图片
to_img(dataset[0][0]*0.2+0.4)

图示:

 

2.DataLoader
Dataset
只负责数据的抽象,一次调用__getitem__只返回一个样本。前面提到过,在训练神经网络时,最好是对一个batch的数据进行操作,同时还需要对数据进行shuffle和并行加速等。对此,PyTorch提供了DataLoader帮助我们实现这些功能。

 

DataLoader的函数定义如下: 

DataLoader(dataset, batch_size=1, shuffle=False, sampler=None, num_workers=0, collate_fn=default_collate, pin_memory=False, drop_last=False)
  • dataset:加载的数据集(Dataset对象)
  • batch_size:batch size
  • shuffle::是否将数据打乱
  • sampler: 样本抽样,后续会详细介绍
  • num_workers:使用多进程加载的进程数,0代表不使用多进程
  • collate_fn: 如何将多个样本数据拼接成一个batch,一般使用默认的拼接方式即可
  • pin_memory:是否将数据保存在pin memory区,pin memory中的数据转到GPU会快一些
  • drop_last:dataset中的数据个数可能不是batch_size的整数倍,drop_last为True会将多出来不足一个batch的数据丢弃

 下面举例说明:

from torch.utils.data import DataLoader

 

#上面对数据处理后得到dataset,下面使用DataLoader实现其他操作
dataloader = DataLoader(dataset, batch_size=3, shuffle=True, num_workers=0, drop_last=False)

 

dataiter = iter(dataloader)
imgs, labels = next(dataiter)
imgs.size() # batch_size, channel, height, weight

返回:

torch.Size([3, 3, 224, 224])

dataloader是一个可迭代的对象,意味着我们可以像使用迭代器一样使用它,例如:

for batch_datas, batch_labels in dataloader:
    train()

dataiter = iter(dataloader)
batch_datas, batch_labesl = next(dataiter)

 

1》图片出问题时的解决方法:

1)将出错的样本剔除

在数据处理中,有时会出现某个样本无法读取等问题,比如某张图片损坏。这时在__getitem__函数中将出现异常,此时最好的解决方案即是将出错的样本剔除。如果实在是遇到这种情况无法处理,则可以返回None对象,然后在Dataloader中实现自定义的collate_fn,将空对象过滤掉。但要注意,在这种情况下dataloader返回的batch数目会少于batch_size。

下面举例说明:

class NewDogCat(DogCat): #继承前面实现的DogCat数据集
    def __getitem__(self, index):
        try:
            # 调用父类的获取函数,即 DogCat.__getitem__(self, index)
            return super(NewDogCat, self).__getitem__(index)
        except:
            return None, None
from torch.utils.data.dataloader import default_collate #导入默认的拼接方式
#自定义
def my_collate_fn(batch):
    '''
    batch中每个元素形如(data, label)
    '''
    # 过滤为None的数据
    batch = list(filter(lambda x : x[0] is not None, batch))
    if len(batch) == 0: return t.Tensor()
    return default_collate(batch) # 用默认方式拼接过滤后的batch数据

获取dataset:

#会去调用父类DogCat生成dataset
dataset = NewDogCat('data/dogcat_wrong/', transforms=transform) 

查看:

dataset[5]

返回:

(tensor([[[ 0.9804,  1.0196,  1.0980,  ..., -1.1765, -1.1373, -1.1176],
          [ 0.9804,  1.0196,  1.0980,  ..., -1.1765, -1.1373, -1.1176],
          [ 1.0588,  1.0980,  1.1765,  ..., -1.1961, -1.1569, -1.1373],
          ...,
          [ 2.2941,  2.2941,  2.3137,  ...,  2.4902,  2.5098,  2.5098],
          [ 2.2941,  2.2941,  2.3137,  ...,  2.4902,  2.4902,  2.4902],
          [ 2.2941,  2.2941,  2.3137,  ...,  2.4902,  2.4902,  2.4902]],
 
         [[ 0.8824,  0.9216,  1.0000,  ..., -1.2157, -1.1765, -1.1569],
          [ 0.8824,  0.9216,  1.0000,  ..., -1.2157, -1.1765, -1.1569],
          [ 0.9608,  1.0000,  1.0784,  ..., -1.2353, -1.1961, -1.1765],
          ...,
          [ 2.1961,  2.1961,  2.2157,  ...,  2.4902,  2.4902,  2.4902],
          [ 2.1961,  2.1961,  2.2157,  ...,  2.4902,  2.4902,  2.4902],
          [ 2.1961,  2.1961,  2.2157,  ...,  2.4902,  2.4902,  2.4902]],
 
         [[ 0.8235,  0.8627,  0.9412,  ..., -1.1961, -1.1569, -1.1373],
          [ 0.8235,  0.8627,  0.9412,  ..., -1.1961, -1.1569, -1.1373],
          [ 0.9020,  0.9412,  1.0196,  ..., -1.2157, -1.1765, -1.1569],
          ...,
          [ 2.0784,  2.0784,  2.0980,  ...,  2.3529,  2.3529,  2.3529],
          [ 2.0784,  2.0784,  2.0980,  ...,  2.3333,  2.3333,  2.3333],
          [ 2.0784,  2.0784,  2.0980,  ...,  2.3333,  2.3333,  2.3333]]]), 1)

得到dataloader:

#然后对dataset进行处理,使用自定义的collate_fn
dataloader = DataLoader(dataset, 2, collate_fn=my_collate_fn, num_workers=1,shuffle=True)
for batch_datas, batch_labels in dataloader:
    print(batch_datas.size(), batch_labels.size())
    

返回:

torch.Size([2, 3, 224, 224]) torch.Size([2])
torch.Size([2, 3, 224, 224]) torch.Size([2])
torch.Size([1, 3, 224, 224]) torch.Size([1])
torch.Size([2, 3, 224, 224]) torch.Size([2])
torch.Size([1, 3, 224, 224]) torch.Size([1])

来看一下上述batch_size的大小。其中第3个的batch_size为1,这是因为有一张图片损坏,导致其无法正常返回。而最后1个的batch_size也为1,这是因为共有9张(包括损坏的文件)图片,无法整除2(batch_size),因此最后一个batch的数据会少于batch_szie,可通过指定drop_last=True来丢弃最后一个不足batch_size的batch。

 

2)随机取一张图片代替

对于诸如样本损坏或数据集加载异常等情况,还可以通过其它方式解决。例如但凡遇到异常情况,就随机取一张图片代替:

import random
class NewDogCat(DogCat): #继承前面实现的DogCat数据集
    def __getitem__(self, index):
        try:
            # 调用父类的获取函数,即 DogCat.__getitem__(self, index)
            return super(NewDogCat, self).__getitem__(index)
        except:
            #更改这里成随机选取一个图片替代
            new_index = random.randint(0,len(self)-1)
            return self[new_index]
from torch.utils.data.dataloader import default_collate #导入默认的拼接方式
#自定义
def my_collate_fn(batch):
    '''
    batch中每个元素形如(data, label)
    '''
    # 过滤为None的数据
    batch = list(filter(lambda x : x[0] is not None, batch))
    if len(batch) == 0: return t.Tensor()
    return default_collate(batch) # 用默认方式拼接过滤后的batch数据

生成dataset:

#会去调用父类DogCat生成dataset
dataset = NewDogCat('data/dogcat_wrong/', transforms=transform) 

生成dataloader并调用:

#然后对dataset进行处理,使用自定义的collate_fn
dataloader = DataLoader(dataset, 2, collate_fn=my_collate_fn, num_workers=1,shuffle=True)
for batch_datas, batch_labels in dataloader:
    print(batch_datas.size(), batch_labels.size())
    

返回:

torch.Size([2, 3, 224, 224]) torch.Size([2])
torch.Size([2, 3, 224, 224]) torch.Size([2])
torch.Size([2, 3, 224, 224]) torch.Size([2])
torch.Size([2, 3, 224, 224]) torch.Size([2])
torch.Size([1, 3, 224, 224]) torch.Size([1]) #这是因为只有9张数据

相比较丢弃异常图片而言,这种做法会更好一些,因为它能保证每个batch的数目仍是batch_size

 

3)彻底清洗

 但在大多数情况下,最好的方式还是对数据进行彻底清洗。

 

2》DataLoader的多进程-multiprocessing
DataLoader里面并没有太多的魔法方法,它封装了Python的标准库multiprocessing,使其能够实现多进程加速。在此提几点关于Dataset和DataLoader使用方面的建议:

  1. 高负载的操作放在__getitem__中,如加载图片等。
  2. dataset中应尽量只包含只读对象,避免修改任何可变对象,利用多线程进行操作。

第一点是因为多进程会并行的调用__getitem__函数,将负载高的放在__getitem__函数中能够实现并行加速。

第二点是因为dataloader使用多进程加载,如果在Dataset实现中使用了可变对象,可能会有意想不到的冲突。在多线程/多进程中,修改一个可变对象,需要加锁,但是dataloader的设计使得其很难加锁(在实际使用中也应尽量避免锁的存在),因此最好避免在dataset中修改可变对象。

例如下面就是一个不好的例子,在多进程处理中self.num可能与预期不符,这种问题不会报错,因此难以发现。如果一定要修改可变对象,建议使用Python标准库Queue中的相关数据结构。

class BadDataset(Dataset):
    def __init__(self):
        self.datas = range(100)
        self.num = 0 # 取数据的次数
    def __getitem__(self, index):
        self.num += 1
        return self.datas[index]

 

使用Python multiprocessing库的另一个问题是,在使用多进程时,如果主程序异常终止(比如用Ctrl+C强行退出),相应的数据加载进程可能无法正常退出。这时你可能会发现程序已经退出了,但GPU显存和内存依旧被占用着,或通过topps aux依旧能够看到已经退出的程序,这时就需要手动强行杀掉进程。建议使用如下命令:

ps x | grep <cmdline> | awk '{print $1}' | xargs kill
  • ps x:获取当前用户的所有进程
  • grep <cmdline>:找到已经停止的PyTorch程序的进程,例如你是通过python train.py启动的,那你就需要写grep 'python train.py'
  • awk '{print $1}':获取进程的pid
  • xargs kill:杀掉进程,根据需要可能要写成xargs kill -9强制杀掉进程

在执行这句命令之前,建议先打印确认一下是否会误杀其它进程

ps x | grep <cmdline> | ps x

 

3》sampler——采样(shuffle=True时使用)

PyTorch中还单独提供了一个sampler模块,用来对数据进行采样。

常用的有随机采样器:RandomSampler,当dataloader的shuffle参数为True时,系统会自动调用这个采样器,实现打乱数据。默认的是采用SequentialSampler,它会按顺序一个一个进行采样。

这里介绍另外一个很有用的采样方法: WeightedRandomSampler,它会根据每个样本的权重选取数据,在样本比例不均衡的问题中,可用它来进行重采样。

构建WeightedRandomSampler时需提供两个参数:

  • 每个样本的权重weights
  • 共选取的样本总数num_samples

以及一个可选参数replacement

replacement用于指定是否可以重复选取某一个样本,默认为True,即允许在一个epoch中重复采样某一个数据。如果设为False,则当某一类的样本被全部选取完,但其样本数目仍未达到num_samples时,sampler将不会再从该类中选择数据,此时可能导致weights参数失效。

权重越大的样本被选中的概率越大,待选取的样本数目一般小于全部的样本数目。

下面举例说明:

dataset = DogCat('data/dogcat/', transforms=transform)

# 狗的图片被取出的概率是猫的概率的两倍,狗是1,猫是0
# 两类图片被取出的概率与weights的绝对大小无关,只和比值有关
weights = [2 if label == 1 else 1 for data, label in dataset]
weights

返回:

[1, 2, 2, 1, 2, 2, 1, 1]

 

from torch.utils.data.sampler import WeightedRandomSampler
sampler = WeightedRandomSampler(weights, num_samples=9,replacement=True)
dataloader = DataLoader(dataset, batch_size=3,sampler=sampler)
for datas, labels in dataloader:
    print(labels.tolist())

返回:

[1, 1, 0]
[0, 1, 1]
[1, 1, 0]

可见狗猫样本比例约为2:1,另外一共只有8个样本,但是却返回了9个,说明肯定有被重复返回的,这就是replacement参数的作用,下面将replacement设为False试试:

sampler = WeightedRandomSampler(weights, 8, replacement=False)
dataloader = DataLoader(dataset, batch_size=4, sampler=sampler)
for datas, labels in dataloader:
    print(labels.tolist())

返回:

[1, 0, 0, 1]
[1, 1, 0, 0]

在这种情况下,num_samples等于dataset的样本总数,为了不重复选取,sampler会将每个样本都返回,这样就失去weight参数的意义了。

从上面的例子可见sampler在样本采样中的作用:如果指定了sampler,shuffle将不再生效,并且sampler.num_samples会覆盖dataset的实际大小,即一个epoch返回的图片总数取决于sampler.num_samples

 

3.计算机视觉工具包:torchvision

计算机视觉是深度学习中最重要的一类应用,为了方便研究者使用,PyTorch团队专门开发了一个视觉工具包torchvion,这个包独立于PyTorch,需通过pip instal torchvision安装。

在之前的例子中我们已经见识到了它的部分功能,这里再做一个系统性的介绍。torchvision主要包含三部分:

  • models:提供深度学习中各种经典网络的网络结构以及预训练好的模型,包括AlexNet、VGG系列、ResNet系列、Inception系列等。
  • datasets: 提供常用的数据集加载,设计上都是继承torhc.utils.data.Dataset,主要包括MNISTCIFAR10/100ImageNetCOCO等。
  • transforms:提供常用的数据预处理操作,主要包括对Tensor以及PIL Image对象的操作。

1)models

from torchvision import models
from torch import nn
# 加载预训练好的模型,如果不存在会进行下载
# 预训练好的模型保存在 ~/.torch/models/下面
resnet34 = models.squeezenet1_1(pretrained=True, num_classes=1000)

# 修改最后的全连接层为10分类问题(默认是ImageNet上的1000分类)
resnet34.fc=nn.Linear(512, 10)

然后会开始下载模型:

Downloading: "https://download.pytorch.org/models/squeezenet1_1-f364aa15.pth" to /Users/user/.torch/models/squeezenet1_1-f364aa15.pth
4966400.0 bytes

 

2)datasets

下载数据:

from torchvision import datasets
# 指定数据集路径为data,如果数据集不存在则进行下载
# 通过train=False获取测试集
dataset = datasets.MNIST('data/', download=True, train=False, transform=transform)

返回:

Downloading http://yann.lecun.com/exdb/mnist/train-images-idx3-ubyte.gz to data/MNIST/raw/train-images-idx3-ubyte.gz
100.1%
Extracting data/MNIST/raw/train-images-idx3-ubyte.gz
Downloading http://yann.lecun.com/exdb/mnist/train-labels-idx1-ubyte.gz to data/MNIST/raw/train-labels-idx1-ubyte.gz
113.5%
Extracting data/MNIST/raw/train-labels-idx1-ubyte.gz
Downloading http://yann.lecun.com/exdb/mnist/t10k-images-idx3-ubyte.gz to data/MNIST/raw/t10k-images-idx3-ubyte.gz
100.4%
Extracting data/MNIST/raw/t10k-images-idx3-ubyte.gz
Downloading http://yann.lecun.com/exdb/mnist/t10k-labels-idx1-ubyte.gz to data/MNIST/raw/t10k-labels-idx1-ubyte.gz
180.4%
Extracting data/MNIST/raw/t10k-labels-idx1-ubyte.gz
Processing...
Done!

 

3)transforms

Transforms中涵盖了大部分对Tensor和PIL Image的常用处理,这些已在上文提到,这里就不再详细介绍。

需要注意的是转换分为两步

  • 第一步:构建转换操作,例如transf = transforms.Normalize(mean=x, std=y)
  • 第二步:执行转换操作,例如output = transf(input)

另外还可将多个处理操作用Compose拼接起来,形成一个处理转换流程。

from torchvision import transforms
to_pil = transforms.ToPILImage()
to_pil(t.randn(3, 64, 64))

图示:

 

4)常用函数

torchvision还提供了两个常用的函数。

一个是make_grid,它能将多张图片拼接成一个网格中;

另一个是save_img,它能将Tensor保存成图片。

dataloader = DataLoader(dataset, shuffle=True, batch_size=16)
from torchvision.utils import make_grid, save_image
dataiter = iter(dataloader)
img = make_grid(next(dataiter)[0], 4) #[0]是图片,[1]是label,拼成4*4网格图片,且会转成3通道
save_image(img,'a.png')

出错:

RuntimeError: output with shape [1, 224, 224] doesn't match the broadcast shape [3, 224, 224]

好像make_grid并不能转成3通道啊?????

如果换成使用的是彩色图像,就成功运行:

dataset = DogCat('data/dogcat/', transforms=transform)
dataloader = DataLoader(dataset, shuffle=True, batch_size=16)
from torchvision.utils import make_grid, save_image
dataiter = iter(dataloader)
img = make_grid(next(dataiter)[0], 4) #[0]是图片,[1]是label,拼成4*4网格图片,且会转成3通道
save_image(img,'a.png')

存储得到的a.png为:

可以使用下面语句查看图像:

Image.open('a.png')

 

4.可视化工具

在训练神经网络时,我们希望能更直观地了解训练情况,包括损失曲线、输入图片、输出图片、卷积核的参数分布等信息。这些信息能帮助我们更好地监督网络的训练过程,并为参数优化提供方向和依据。最简单的办法就是打印输出,但其只能打印数值信息,不够直观,同时无法查看分布、图片、声音等。在本节,我们将介绍两个深度学习中常用的可视化工具:Tensorboard和Visdom

1)Tensorboard

Tensorboard最初是作为TensorFlow的可视化工具迅速流行开来。作为和TensorFlow深度集成的工具,Tensorboard能够展现你的TensorFlow网络计算图,绘制图像生成的定量指标图以及附加数据。但同时Tensorboard也是一个相对独立的工具,只要用户保存的数据遵循相应的格式,tensorboard就能读取这些数据并进行可视化。这里我们将主要介绍如何在PyTorch中使用tensorboardX1进行训练损失的可视化。 TensorboardX是将Tensorboard的功能抽取出来,使得非TensorFlow用户也能使用它进行可视化,几乎支持原生TensorBoard的全部功能。

在这里选择了其中一个来学习,选择了下面的Visdom

 

2)Visdom

可见pytorch visdom可视化工具学习—1—安装和使用

 

 

5.使用GPU加速:cuda

这部分内容在前面介绍Tensor、Module时大都提到过,这里将做一个总结,并深入介绍相关应用。

在PyTorch中以下数据结构分为CPU和GPU两个版本:

  • Tensor
  • nn.Module(包括常用的layer、loss function,以及容器Sequential等)

它们都带有一个.cuda方法,调用此方法即可将其转为对应的GPU对象。

注意,tensor.cuda会返回一个新对象,这个新对象的数据已转移至GPU,而之前的tensor还在原来的设备上(CPU)。

module.cuda则会将所有的数据都迁移至GPU,并返回自己。所以module = module.cuda()module.cuda()所起的作用一致。

nn.Module在GPU与CPU之间的转换,本质上还是利用了Tensor在GPU和CPU之间的转换。nn.Module的cuda方法是将nn.Module下的所有parameter(包括子module的parameter)都转移至GPU,而Parameter本质上也是tensor(Tensor的子类)。

下面将举例说明,这部分代码需要你具有两块GPU设备。但是因为我的机器中只有一块GPU,所以只能运行看看感觉,有些地方将会有点不同

 

P.S. 为什么将数据转移至GPU的方法叫做.cuda而不是.gpu,就像将数据转移至CPU调用的方法是.cpu?这是因为GPU的编程接口采用CUDA,而目前并不是所有的GPU都支持CUDA,只有部分Nvidia的GPU才支持。PyTorch未来可能会支持AMD的GPU,而AMD GPU的编程接口采用OpenCL,因此PyTorch还预留着.cl方法,用于以后支持AMD等的GPU。

user@home:/opt/user$ python
Python 3.6.3 |Anaconda custom (64-bit)| (default, Oct 13 2017, 12:02:49)
[GCC 7.2.0] on linux
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import torch as t
>>> tensor = t.Tensor(3,4)
>>> tensor.cuda(0) #返回一个新的tensor,保存在第0块GPU上,但原来的tensor并没有改变
tensor([[-4.5677e+20,  3.0805e-41,  3.7835e-44,  0.0000e+00],
        [        nan,  4.5817e-41,  1.3733e-14,  6.4069e+02],
        [ 4.3066e+21,  1.1824e+22,  4.3066e+21,  6.3828e+28]], device='cuda:0')
>>> tensor.is_cuda
False

 

>>> tensor1 = tensor.cuda() # 不指定所使用的GPU设备,将默认使用第1块GPU
>>> tensor1.is_cuda
True
>>> tensor1.get_device()
0
>>> tensor2 = tensor.cuda(1) 
#因为我的机器上只有一个GPU,所以如果想要设置第二块GPU则会报错
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
RuntimeError: CUDA error: invalid device ordinal

 

>>> from torch import nn
>>> module = nn.Linear(3,4)
#将模块设置为.cuda(),这样模块中的参数也会自动使用GPU
>>> module.cuda(device=0)
Linear(in_features=3, out_features=4, bias=True)
>>> module.weight.is_cuda
True

 

在定义网络时也可以直接在声明参数的时候指定运行的GPU:

#-*- coding: utf-8 -*-
from __future__ import print_function
import torch as t

class VeryBigModule(nn.Module):
        def __init__(self):
                super(VeryBigModule, self).__init__()
                self.GiantParameter1 = t.nn.Parameter(t.randn(100000, 20000)).cuda(0)
                self.GiantParameter2 = t.nn.Parameter(t.randn(20000, 100000)).cuda(1)

        def forward(self, x):
                x = self.GiantParameter1.mm(x.cuda(0))
                x = self.GiantParameter2.mm(x.cuda(1))
                return x    

上面最后一部分中,两个Parameter所占用的内存空间都非常大,大概是8个G,如果将这两个都同时放在一块GPU上几乎会将显存占满,无法再进行任何其它运算。此时可通过这种方式将不同的计算分布到不同的GPU中。

关于使用GPU的一些建议:

  • GPU运算很快,但对于很小的运算量来说,并不能体现出它的优势,因此对于一些简单的操作可直接利用CPU完成
  • 数据在CPU和GPU之间,以及GPU与GPU之间的传递会比较耗时,应当尽量避免
  • 在进行低精度的计算时,可以考虑HalfTensor,它相比于FloatTensor能节省一半的显存,但需千万注意数值溢出的情况。

另外这里需要专门提一下,大部分的损失函数也都属于nn.Module,但在使用GPU时,很多时候我们都忘记使用它的.cuda方法,这在大多数情况下不会报错,因为损失函数本身没有可学习的参数(learnable parameters)。

但在某些情况下会出现问题,为了保险起见同时也为了代码更规范,应记得调用criterion.cuda

下面举例说明:

# 交叉熵损失函数,带权重
>>> criterion = t.nn.CrossEntropyLoss(weight=t.Tensor([1,3]))
>>> input = t.randn(4,2).cuda()
>>> target = t.Tensor([1,0,0,1]).long().cuda(0)

# 下面这行会报错,因weight未被转移至GPU
# loss = criterion(input, target)

>>> criterion.cuda(0)
CrossEntropyLoss()
>>> loss = criterion(input, target)
>>> criterion._buffers
OrderedDict([('weight', tensor([1., 3.], device='cuda:0'))])

 


而除了调用对象的.cuda方法之外,还可以使用torch.cuda.device,来指定默认使用哪一块GPU:

>>> with t.cuda.device(0):
...     a = t.cuda.FloatTensor(2,3)
...     b = t.FloatTensor(2,3).cuda() #如果没有显示声明,就会报错
...     print(a.get_device() == b.get_device() == 0)
...
...     c = a + b
...     print(c.get_device() == 0)
...
True
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 6, in <module>
RuntimeError: CUDA error: invalid device ordinal

从上面的情况发现最好还是显示指明使用的GPU,所以改成下面这样就可以了:

>>> with t.cuda.device(0):
...     a = t.cuda.FloatTensor(2,3)
...     b = t.FloatTensor(2,3).cuda(0)
...     print(a.get_device() == b.get_device() == 0)
...     c = a + b
...     print(c.get_device() == 0)
...     d = t.randn(2,3).cuda()
...     print(d.get_device())
...
True
True
0

还可以使用torch.set_default_tensor_type使程序默认使用GPU,不需要手动调用cuda

>>> t.set_default_tensor_type('torch.cuda.FloatTensor')
>>> a = t.ones(2,3)
>>> a.is_cuda
True

 


如果服务器具有多个GPU,tensor.cuda()方法会将tensor保存到第一块GPU上,等价于tensor.cuda(0)。此时如果想使用第二块GPU,需手动指定tensor.cuda(1),而这需要修改大量代码,很是繁琐。

这里有两种替代方法:

  • 一种是先调用t.cuda.set_device(1)指定使用第二块GPU,后续的.cuda()都无需更改,切换GPU只需修改这一行代码。
  • 更推荐的方法是设置环境变量CUDA_VISIBLE_DEVICES,例如当export CUDA_VISIBLE_DEVICE=1(下标是从0开始,1代表第二块GPU),只使用第二块物理GPU,但在程序中这块GPU会被看成是第一块逻辑GPU,因此此时调用tensor.cuda()会将Tensor转移至第二块物理GPU。CUDA_VISIBLE_DEVICES还可以指定多个GPU,如export CUDA_VISIBLE_DEVICES=0,2,3,那么第一、三、四块物理GPU会被映射成第一、二、三块逻辑GPU,tensor.cuda(1)会将Tensor转移到第三块物理GPU上。

设置CUDA_VISIBLE_DEVICES有两种方法:

  • 一种是在命令行中CUDA_VISIBLE_DEVICES=0,1 python main.py
  • 一种是在程序中import os;os.environ["CUDA_VISIBLE_DEVICES"] = "2"。如果使用IPython或者Jupyter notebook,还可以使用%env CUDA_VISIBLE_DEVICES=1,2来设置环境变量。

从 0.4 版本开始,pytorch新增了tensor.to(device)方法,能够实现设备透明,便于实现CPU/GPU兼容。这部份内容已经在第三章讲解过了。

从PyTorch 0.2版本中,PyTorch新增分布式GPU支持。分布式是指有多个GPU在多台服务器上,而并行一般指的是一台服务器上的多个GPU。分布式涉及到了服务器之间的通信,因此比较复杂,PyTorch封装了相应的接口,可以用几句简单的代码实现分布式训练。分布式对普通用户来说比较遥远,因为搭建一个分布式集群的代价十分大,使用也比较复杂。相比之下一机多卡更加现实。对于分布式训练,这里不做太多的介绍,感兴趣的读者可参考文档1

 

单机多卡并行

要实现模型单机多卡十分容易,直接使用 new_module = nn.DataParallel(module, device_ids), 默认会把模型分布到所有的卡上。多卡并行的机制如下:

  • 将模型(module)复制到每一张卡上
  • 将形状为(N,C,H,W)的输入均等分为 n份(假设有n张卡),每一份形状是(N/n, C,H,W),然后在每张卡前向传播,反向传播,梯度求平均。要求batch-size 大于等于卡的个数(N>=n)

在绝大多数情况下,new_module的用法和module一致,除了极其特殊的情况下(RNN中的PackedSequence)。另外想要获取原始的单卡模型,需要通过new_module.module访问。

 

6.持久化

在PyTorch中,以下对象可以持久化到硬盘,并能通过相应的方法加载到内存中:

  • Tensor
  • Variable
  • nn.Module
  • Optimizer

本质上上述这些信息最终都是保存成Tensor。Tensor的保存和加载十分的简单,使用t.save和t.load即可完成相应的功能。在save/load时可指定使用的pickle模块,在load时还可将GPU tensor映射到CPU或其它GPU上。

我们可以通过t.save(obj, file_name)等方法保存任意可序列化的对象到file_name文件中,然后通过obj = t.load(file_name)方法加载保存的数据file_name

对于Module和Optimizer对象,这里建议保存对应的state_dict,而不是直接保存整个Module/Optimizer对象。Optimizer对象保存的主要是参数,以及动量信息,通过加载之前的动量信息,能够有效地减少模型震荡

下面举例说明:

 

>>> a = t.Tensor(3,4)
>>> if t.cuda.is_available():
...     a = a.cuda(0) # 把a转为GPU0上
...     t.save(a, 'a.pth') #保存a的值到'a.pth'
...     b = t.load('a.pth') #加载'a.pth'为b, 因为保存时tensor在GPU0上,所以b也会存储与GPU0
...     c = t.load('a.pth', map_location=lambda storage, loc:storage) #加载为c, 存储于CPU
...
>>> b
tensor([[1.0373e-22, 9.1637e-41, 1.0373e-22, 9.1637e-41],
        [2.5318e-12, 3.2127e+21, 0.0000e+00, 0.0000e+00],
        [0.0000e+00, 0.0000e+00, 0.0000e+00, 0.0000e+00]])
>>> a
tensor([[1.0373e-22, 9.1637e-41, 1.0373e-22, 9.1637e-41],
        [2.5318e-12, 3.2127e+21, 0.0000e+00, 0.0000e+00],
        [0.0000e+00, 0.0000e+00, 0.0000e+00, 0.0000e+00]])
>>> a.get_device() == b.get_device()
True
>>> c.is_cuda #可见c为CPU
False
>>> c #三者的值是相同的
tensor([[1.0373e-22, 9.1637e-41, 1.0373e-22, 9.1637e-41],
        [2.5318e-12, 3.2127e+21, 0.0000e+00, 0.0000e+00],
        [0.0000e+00, 0.0000e+00, 0.0000e+00, 0.0000e+00]], device='cpu')

 

存储模型和优化器参数:

>>> t.set_default_tensor_type('torch.FloatTensor')
>>> from torchvision.models import SqueezeNet
>>> model = SqueezeNet()
# module的state_dict是一个字典
>>> model.state_dict().keys()
odict_keys(['features.0.weight', 'features.0.bias', 'features.3.squeeze.weight', 'features.3.squeeze.bias', 'features.3.expand1x1.weight', 'features.3.expand1x1.bias', 'features.3.expand3x3.weight', 'features.3.expand3x3.bias', 'features.4.squeeze.weight', 'features.4.squeeze.bias', 'features.4.expand1x1.weight', 'features.4.expand1x1.bias', 'features.4.expand3x3.weight', 'features.4.expand3x3.bias', 'features.5.squeeze.weight', 'features.5.squeeze.bias', 'features.5.expand1x1.weight', 'features.5.expand1x1.bias', 'features.5.expand3x3.weight', 'features.5.expand3x3.bias', 'features.7.squeeze.weight', 'features.7.squeeze.bias', 'features.7.expand1x1.weight', 'features.7.expand1x1.bias', 'features.7.expand3x3.weight', 'features.7.expand3x3.bias',
'features.8.squeeze.weight', 'features.8.squeeze.bias', 'features.8.expand1x1.weight', 'features.8.expand1x1.bias', 'features.8.expand3x3.weight', 'features.8.expand3x3.bias', 'features.9.squeeze.weight', 'features.9.squeeze.bias', 'features.9.expand1x1.weight', 'features.9.expand1x1.bias', 'features.9.expand3x3.weight', 'features.9.expand3x3.bias', 'features.10.squeeze.weight', 'features.10.squeeze.bias', 'features.10.expand1x1.weight', 'features.10.expand1x1.bias', 'features.10.expand3x3.weight',
'features.10.expand3x3.bias', 'features.12.squeeze.weight', 'features.12.squeeze.bias', 'features.12.expand1x1.weight', 'features.12.expand1x1.bias', 'features.12.expand3x3.weight', 'features.12.expand3x3.bias', 'classifier.1.weight', 'classifier.1.bias'])

# Module对象的保存与加载
>>> t.save(model.state_dict(), 'squeezenet.pth')
>>> model.load_state_dict(t.load('squeezenet.pth'))

#优化器
>>> optimizer = t.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.1)
>>> t.save(optimizer.state_dict(), 'optimizer.pth')
>>> optimizer.load_state_dict(t.load('optimizer.pth'))  

#将两者的状态存放在一起
>>> all_data = dict(
...     optimizer = optimizer.state_dict(),
...     model = model.state_dict(),
...     info = 'the all parameters of model and optimizer'
... )
>>> t.save(all_data, 'all.pth')
>>> load_all_data = t.load('all.pth')

>>> load_all_data.keys()
dict_keys(['optimizer', 'model', 'info'])

>>> load_all_data['model'].keys()
odict_keys(['features.0.weight', 'features.0.bias', 'features.3.squeeze.weight', 'features.3.squeeze.bias', 'features.3.expand1x1.weight', 'features.3.expand1x1.bias', 'features.3.expand3x3.weight', 'features.3.expand3x3.bias', 'features.4.squeeze.weight', 'features.4.squeeze.bias', 'features.4.expand1x1.weight', 'features.4.expand1x1.bias', 'features.4.expand3x3.weight', 'features.4.expand3x3.bias', 'features.5.squeeze.weight', 'features.5.squeeze.bias', 'features.5.expand1x1.weight', 'features.5.expand1x1.bias', 'features.5.expand3x3.weight', 'features.5.expand3x3.bias', 'features.7.squeeze.weight', 'features.7.squeeze.bias', 'features.7.expand1x1.weight', 'features.7.expand1x1.bias', 'features.7.expand3x3.weight', 'features.7.expand3x3.bias', 'features.8.squeeze.weight', 'features.8.squeeze.bias', 'features.8.expand1x1.weight', 'features.8.expand1x1.bias', 'features.8.expand3x3.weight', 'features.8.expand3x3.bias', 'features.9.squeeze.weight', 'features.9.squeeze.bias', 'features.9.expand1x1.weight', 'features.9.expand1x1.bias', 'features.9.expand3x3.weight', 'features.9.expand3x3.bias', 'features.10.squeeze.weight', 'features.10.squeeze.bias', 'features.10.expand1x1.weight', 'features.10.expand1x1.bias', 'features.10.expand3x3.weight', 'features.10.expand3x3.bias', 'features.12.squeeze.weight', 'features.12.squeeze.bias', 'features.12.expand1x1.weight', 'features.12.expand1x1.bias', 'features.12.expand3x3.weight', 'features.12.expand3x3.bias', 'classifier.1.weight', 'classifier.1.bias'])

>>> load_all_data['optimizer'].keys()
dict_keys(['state', 'param_groups'])

 

posted @ 2019-04-08 14:38  慢行厚积  阅读(4503)  评论(0编辑  收藏  举报