摘要： 前一阵基本看完了书的大部分内容。但是主要跟自己研究密切相关的还是细胞间信息传递这部分。于是单独拿出做个笔记。 细胞间的信息传递主要由细胞外信号分子介导，其中一些细胞外信号分子向远处的细胞传递信息，而另一些分子仅传递信息给邻近的细胞。 信号转导：细胞外信号分子通过与细胞膜上或胞内的受体特异性结合，将信 阅读全文

摘要： 毕业前跟去山东当老师的同学讨论时，他问什么是组学？虽然搞生物信息，但是具体也没有给他解释清楚。最近医学细胞生物学书里第一章我看到有相关的描述，于是总结一下。 现在的组学研究，个人理解狭义上就是指基因组学和蛋白质组学。这里所谓的组，就是指一套相对完整的遗传物质，包括基因和基因间的DNA总和，即基因组， 阅读全文

摘要： 写专利时，查找关于使用离散数据结构用于分子相互作用预测文献中，把敏感性和特异性也关注了一下。 之前和师兄合作论文的时候，只是死记硬背TP、TN等指标，但是仔细回想以前讨论时候师兄实际已经和实验室的同学用实例说明了这个问题，而且服务计算国际会议上也有老师提问过其他讲者这个问题。 对于敏感性sensit 阅读全文

摘要： 毕业最近两月累计借了一堆书，最近开始对这些书进行挖矿清理。 大数据与精准医学第二章里介绍了UCSB-GB，http://genome.ucsc.edu UCSC-GB以MySQL数据库的形式存储的数据集，因此可以在本机安装MySQL使用接口命令进行访问。 分子结构可视化方面的软件：VMD、PyMol 阅读全文

摘要： 学车中认识了一个我校学院的年轻老师（已经是副教授），坐下休息交流中他的一些观点说服了我，但是有一些观点我觉得还是不能完全认同。 我同意该老师观点的是学术道德底线必须保证。抄袭是饮鸩止渴的做法，即便是让学习困难的学生做一些简单的题目，也不能买论文和毕设。 但是我不认同的是该老师觉得学生没有能力就直接挂 阅读全文

摘要： 本文不涉及深度学习，感觉目前深度学习几乎可以独立出机器学习单出一个学科了。于是这里的笔记仅仅狭义地总结一些论文所引用的一些技巧和概念。 知乎上大神们似乎认为，子空间学习是高维空间向低维空间投影的降维。https://www.zhihu.com/question/26908926 而小样本学习，知乎的 阅读全文

摘要： 最近论文内审之后，增加了一些图。 在这其中，使用mathematica绘制了一维的正态分布图。对比matlab，不得不说mathematica在很多经典的模型图的绘制上方便很多。 Plot[Table[ PDF[NormalDistribution[0, \[Sigma]], x], {\[Sigm 阅读全文

摘要： 下午实验室师妹问我latex转word生成的格式不行咋办。于是找了一下网上，发现了一个可以自动生成word论文的网站 https://typeset.io/formats/bmc/default-template-for-bmc-journals/7b23b7ad12a88ea6f5159d0031 阅读全文

摘要： 虽然在虚拟机装了texlive以备使用，但是在不动CTeX的情况下，是否能使用LyX写中文幻灯片呢。网上只是寥寥几篇大神们在Linux用LyX的博文。 最近把论文交完写幻灯片，于是也把这个想法尝试了一下。 首先LyX有自己的英文幻灯片模板，但是如果直接往里面敲入中文是不能直接进行编译的。 于是研究了 阅读全文

摘要： 最近写大论文查到KO也是可以用于分类的一种信息。 如何使用KEGG进行通路富集http://blog.sciencenet.cn/blog-364884-779116.html kegg 数据库学习笔记 http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102wtqq. 阅读全文