10 2018 档案

爬取xml数据之R
摘要：生物信息很多时候要爬数据。最近也看了一些这些方面的。 url<-"要爬取的网址" url.html<-htmlParse(url,encoding="UTF-8") 如果要获得部分信息，则使用XPath方法。 xpath<-"//*[@id='填写目标id']/span[@id='细分标签的id'] 阅读全文
posted @ 2018-10-31 14:57 [6G]蓝色の云风 阅读(323) 评论(0) 推荐(0)
R和中心度、中心势
摘要：最近用R画论文里的弦图，恰好借的书里着重写了中心度等问题。 网上流行一套密歇根大学社交计算的教程。但是前两年看了好几遍总是搞不清，即便是记公式也是收效不大。不妨按照书上总结一下。 绝对法： 无向图点度中心度=点度数，即与该点相连的点的度数 有向图内点度中心度=点入度，即直接指向该店的点的总数 有向图 阅读全文
posted @ 2018-10-31 13:54 [6G]蓝色の云风 阅读(2192) 评论(0) 推荐(0)
用Beamer做Slides
摘要：学术用幻灯片，首选还是latex。但是问题来了，Beamer这个latex幻灯模板还需要很多自定义设置。于是找了网上一些自己觉得好的例子。 http://www.latexstudio.net/index.html http://qingjingyan.blog.sohu.com/116053034 阅读全文
posted @ 2018-10-30 22:47 [6G]蓝色の云风 阅读(454) 评论(0) 推荐(0)
知识图谱的绘制
摘要：今天抽出晚上时间专门查了一下知识图谱的绘制。大致就是类似下面这种图 其实研二时候找nature的论文就遇到过这种图，博一时候又在弄R的时候学了一下。但是放了一段时间又忘记了。主要还是在于得自己用到论文里。 这种图在和生物相关的论文会经常遇到。其中，一级项目按比重由大到小排列，二级项目同理，连线表示关 阅读全文
posted @ 2018-10-19 22:39 [6G]蓝色の云风 阅读(5467) 评论(0) 推荐(0)
python的一些配置
摘要：昨天西邮的学友让我看一段python svm的输入文件格式，但是我打开很久不用的pycharm后发觉python包早已过时。于是搜了一下教程，看来python也得同时补习了 另外，机器学习还需要装很多包，比如numpy https://jingyan.baidu.com/article/03b2f7 阅读全文
posted @ 2018-10-17 13:54 [6G]蓝色の云风 阅读(186) 评论(0) 推荐(0)
损失函数的一些初步学习
摘要：最近几个同专业的都发了trans,相比起来自己trans也得努力了。而看了看他们的论文，也几乎不约而同的在损失函数上做了文章。 比如hinge loss https://blog.csdn.net/chaipp0607/article/details/76037351 https://blog.cs 阅读全文
posted @ 2018-10-16 13:14 [6G]蓝色の云风 阅读(128) 评论(0) 推荐(0)
随机过程和指数分布
摘要：前一阵实验室聪明的师弟选了随机过程，认为这个课有用。而最近又遇到一个题。于是这次认真搞一下。 网络里有N个节点，每个节点有三个状态，且都服从指数分布。现在要求一步转移概率矩阵，感染状态有n+1种， 泊松分布是单位时间内独立事件发生次数的概率分布，指数分布是独立事件的时间间隔的概率分布。 指数分布的公 阅读全文
posted @ 2018-10-15 17:06 [6G]蓝色の云风 阅读(604) 评论(0) 推荐(0)
修改论文的一些记录
摘要：最近大修一篇论文，遇到一些问题，比如be superior to , be superior than http://tieba.baidu.com/p/1220700874 还有介绍前人工作一般得用现在完成时。之前一直没注意这个问题 ******** 提交完论文后，估计还需要两周；但是忽然发现ad 阅读全文
posted @ 2018-10-05 15:32 [6G]蓝色の云风 阅读(239) 评论(0) 推荐(0)
用latex写简历
摘要：最近终于逐渐掌握了用Latex写中文简历的问题。首先就是必须基于交大前辈bin yuan的模板进行学习。 如果有了一般论文撰写和Beamer做PPT的经验，不难发现resume的模板也是遵循一套程式的，就是按照一个个section写即可。 当然交大的模板很简单，自然很多缺少的元素也需要看其他大神的模 阅读全文
posted @ 2018-10-02 15:16 [6G]蓝色の云风 阅读(296) 评论(0) 推荐(0)