医学细胞生物学笔记1

毕业前跟去山东当老师的同学讨论时,他问什么是组学?虽然搞生物信息,但是具体也没有给他解释清楚。最近医学细胞生物学书里第一章我看到有相关的描述,于是总结一下。

现在的组学研究,个人理解狭义上就是指基因组学和蛋白质组学。这里所谓的组,就是指一套相对完整的遗传物质,包括基因和基因间的DNA总和,即基因组,或者由该基因组所表达的全部蛋白质。

组学的后缀中的MIC是形态学(Morphology,M)、免疫学(Immunology,I)和细胞遗传学(Cytogenetic,C)三字的缩写。

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七月底八月初组内很多同学讲了一堆在研究的内容和书上的内容。博二博三的经常提表观遗传学,即研究没有DNA序列变化并且可以遗传的基因功能变化。书上提到的表观遗传学的研究对象其实还有很多。

DNA甲基化:在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。

组蛋白密码(蛋白的乙酰化、甲基化、磷酸化、腺苷酸化、泛素化、糖基化、羰基化):其中乙酰化就是将有机化合物分子中的氮、氧、碳原子上引入乙酰基CH3CO-的反应;组蛋白被甲基化的位点是赖氨酸和精氨酸,赖氨酸可以分别被一、二、三甲基化,精氨酸只能被一、二甲基化;磷酸化是将磷酸基团加在中间代谢产物上或加在蛋白质;多聚腺苷酸化是指多聚腺苷酸与信使RNA(mRNA)分子的共价链结,在蛋白质生物合成的过程中,这是产生准备作翻译的成熟mRNA的方式的一部分;泛素化是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰;糖基化是在酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,起始于内质网,结束于高尔基体;羰基化则是制备醛、酮等羰基化合物的重要方法。

至于如何使用机器学习的方法进行预测,肯定首先是要有清洗完毕的数据,即标准的数据集,这个过程首先要建立好生物模型,或者弄懂已有的生物模型来对号入座地把相应的数据放入。

基因组印记

表观基因组学

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另外一个研究热点是细胞信号转导通路。信号分子,包括神经递质、激素和旁分泌因子来完成。这些信号分子与细胞表面或者细胞内部的受体结合,并引起下游胞内吸纳好哦分子的级联反应,实现对细胞调节的过程。而传递信息的过程需要包含复杂RNA和蛋白质的小膜泡,即外泌体。

posted @ 2019-08-29 08:52  [6G]蓝色の云风  阅读(730)  评论(0编辑  收藏  举报