大数据与精准医学笔记

毕业最近两月累计借了一堆书，最近开始对这些书进行挖矿清理。

大数据与精准医学第二章里介绍了UCSB-GB，http://genome.ucsc.edu

UCSC-GB以MySQL数据库的形式存储的数据集，因此可以在本机安装MySQL使用接口命令进行访问。

分子结构可视化方面的软件：VMD、PyMol、Jmol、Chimera

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 全基因组关联分析（GWAS）的整合分析方法常用P值法或者Z值法。其中P值法涉及零假设和备择假设。

这里又涉及了统计的假设检验，即两类错误的区分。

第一类是去真，零假设为真，但是拒绝了零假设；

第二类是取伪，零假设为假，但是接受了零假设。