摘要：
"p" 绘散点图"l" 绘实线"b" 所有点被实线连接"o" 实线通过的所有点"h" 绘出点到x轴的竖线"s" 绘出阶梯形曲线"S" 同上"n" 不绘任何点或者曲线 阅读全文
摘要：
目前遇到的问题：1、维数太多，如何降维？2、kmeans聚类的详细方法？3、LDA方法。 阅读全文
摘要：
#和上一篇基本一样，只是聚类对象不同##连接数据库，将数据库中的文件读取出来#加载包library(RMySQL) #建立连接conn <- dbConnect(dbDriver("MySQL"), dbname = "eswp", user="root", password="root")#读取 表2008yearnewtext = dbReadTable(conn, "2008yearnew")[,2:2]#只读取mesh词的那一列，通过前面的第一个下标修改读取的行数#加载tm包lib 阅读全文
摘要：
##R对文档进行层次聚类的尝试##连接数据库，将数据库中的文件读取出来#加载包library(RMySQL) #建立连接conn <- dbConnect(dbDriver("MySQL"), dbname = "eswp", user="root", password="root")#读取 表2008yearnewtext = dbReadTable(conn, "2008yearnew")[,2:2]#只读取mesh词的那一列，通过前面的第一个下标修改读取的行数#加载tm包librar 阅读全文
摘要：
今天收获很多，请教了wang关于R的一些东西，学到了很多，先记录与此。1、聚类后数据的调用，cutree函数2、图片的清晰度问题，png(width="",height="")，之后再plot;标签中文本的大小cex();3、java调用R的问题，wang给我介绍了R2HTML包，我觉得这个包缺少交互，需要继续请教交互性的东西。4、关注opengpu，matlab中的HTML下一步的工作：1、三种聚类方法的进一步明确，参数、输出、调用2、实验和对比；3、java集成。 阅读全文
摘要：
R中read.table详解source：http://wnfdsfy.diandian.com/post/2011-10-17/5856100R is a free software environment for statistical computing and graphics. It compiles and runs on a wide variety of UNIX platforms, Windows and MacOS. --http://www.r-project.org/笔者从事生物信息方面的研究和学习。经常用到R处理和分析数据。为了以后更方便和熟练的使用R就做一些记录， 阅读全文
摘要：
刚刚很艰难的在windows下安装上RMySQL，详见RMySQL在windows下的安装方法迫不及待的测试了一下参考资料：http://www.biosino.org/R/R-doc/R-data_cn/DBI-_002f-RMySQL.html1、连接数据库> library(RMySQL) #加载包> con <- dbConnect(dbDriver("MySQL"), dbname = "eswp", user="root", password="root") #连接数据库，必须通过us 阅读全文
摘要：
添加的内容：在这个文章写完之后，有朋友建议可以通过ODBC来连接MySQL，只需要安装RODBC包，然后在windows下建立和mysql连接的数据源即可，此种方法好像不像下面的方法那样费时间，具体还没有测试，感兴趣的可以测试一下。为了把RMySQL在windows下安装成功，折腾了近一个小时，最终成功，安装过程如下。我的版本是2.15.1，首先使用install.packages("RMySQL")被告知没有包，查看后发现只有linux和mac环境下的包，使用install.packages("RMySQL", type="source&qu 阅读全文
摘要：
http://f.dataguru.cn/thread-14885-1-1.html我安装成功，总结一下system:xp+R+jdkR:C:\Program Files\R\R-2.15.1JDK:C:\Program Files\Java\jdk1.7.0_051.配置好java2.配置rJava1)install.packages("rJava")2)设置环境变量CLASSPATH=C:\Program Files\R\R-2.15.1\library\rJava\jri;PATH=C:\Program Files\R\R-2.15.1\bin\i386R_HOME= 阅读全文
摘要：
1、距离计算## method for class 'TermDocumentMatrix'dissimilarity(x, y = NULL, method)## method for class 'PlainTextDocument'dissimilarity(x, y = NULL, method)参数说明： x：文档-词矩阵或者文本文档； y：文本文档，仅当x是文本文档时y才是文本文档； method：距离计算方法，所有的method均来自于proxy包，proxy包的文档在这里。method的种类主要有：（1）jaccard：jaccard系数（默认方 阅读全文