edgeR
摘要：
edgeR:Empirical Analysis of Digital Gene Expression Data in R 一个差异性分析的R包，用于RNA-seq或DNA甲基化等相关技术分析。 其原理利用广义线性模型对每个基因或者甲基化位点建模，然后直接比较线性模型的参数。 输入要求：必须是支持该 阅读全文
posted @ 2017-07-18 23:28 青萍，你好 阅读(5767) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R中的运算符，条件语句，控制语句
摘要：
1.运算符 算术运算符：+，-，*,/ 关系运算符：==，！=，>,>=,<,<= 逻辑运算符：&,|，&&，||，！ &和|称为短逻辑符，&&及||称为长逻辑符。长逻辑符只比较左边和右边的第一个元素，而短逻辑符将会一 一比较所有的元素。 2.条件语句：if ..else 3.控制语句：for,wh 阅读全文
posted @ 2017-07-18 22:00 青萍，你好 阅读(1096) 评论(0) 推荐(0) 编辑
library-type:fr-unstanded vs fisrt-stand vs second-stanrd
摘要：
建库时是否是链特异性建库。 Tophat2: HISAT2:--rna-strandness <string> Specify strand-specific information: the default is unstranded.For single-end reads, use F or 阅读全文
posted @ 2017-07-18 16:09 青萍，你好 阅读(735) 评论(0) 推荐(0) 编辑
