在非小细胞肺癌中，MET基因的14号外显子突变和年龄，依赖于癌症阶段的CNV，C-MET过表达的关系

背景：c-MET是肝细胞生长因子的酪氨酸激酶受体。MET 14号外显子编码部分c-MET的胞内跨膜结构域，包括重要的调节原件，比如酪氨酸1003，一个降解c-MET的相关酶的结合位点。

           拥有MET 14号外显子跳跃突变的个体，可能出现c-MET活性增强，表达量增强。

目的：拥有MET 14号外显子及其内含子侧翼突变的非小细胞肺癌患者可能对c-Met抑制剂有应答。本文中探索了拥有MET 14号外显子突变的患者的临床特征，病理特征，基因特征。

从NGS数据，蛋白表达，转录本表达层面说明拥有met 14外显子突变的整体特征。

方法：

  NGS：检测282个癌症相关基因的序列

  原位荧光杂交：CNV检测

  RT-PCR：转录本检测

  IHC：c-met表达量检测

结果：

年龄：

带有met 14号外显子突变的病人的年龄一般更大，本研究中的中位年龄为72.5，

对比与ALK,ROS1融合，出现在50-60岁，KARS,EGFR,BRAF突变，出现在61-66岁。

CNV:

C-MET的过表达：

本研究中涉及多个癌种，但只在NSCLCs中发现MET 14号外显子变异，而且病人的中位年龄是72.5。

比起NSCLCs IA ,IIIB期 携带met14号外显子突变的病人和IV期未携带MET14号外显子突变的病人，NSCLCs IV期，携带有MET14号外显子突变的病人中可能也伴随着MET扩增，和c-met免疫组化表达。

 

具体结果：

1.998名NSCLCs患者的NGS结果，MET exon14突变的占3%，28名患者。而且在132名鳞状细胞癌，41名小细胞肺癌，20名良性肿瘤，15名神经内分泌癌患者中都未发现MET exon14突变。

2. 28名拥有MET exon14突变的NSLCLs患者的突变位置：

 

3.MET的表达水平

在28名拥有met exon14突变的NSCLCs中只有26名患者有足够的组织做IHC检测，并且met的表达水平从高（H Score 300）到低（H Score <50）都有。

对比与早中期有met exon14突变的NSCLCs患者和没有met exon14突变的晚期NSCLCs患者，拥有met exon14突变的晚期NSCLCs患者（IV）拥有更高的MET表达量。

 

4.转录本水平分析

 28位病人中只有24位有足够的RNA用于做转录本分析。

24位中发现23位有exon 14跳跃。28号病人没有发现exon 14跳跃，但是其在Cbl结合位点处有一个突变Y1003C，而且其没有发现met扩增，但met表达量很高（H SCORE 300）

在4名未携带exon 14突变的control患者中，未发现exon14跳跃。

 

 

 

5.一个患者的治疗案例

一名64岁不抽烟的女性患者被诊断为NSCLC IV期。

NGS结果：KRAS,EGFR,BRAF未发现驱动变异。ALK，ROS1未发现融合。
MET 14号外显子发现c.3028G>A (AF,94%; DP,867）
高水平的MET扩增。
qRT-PCR结果：Exon 14 skipping。
治疗方案：250mg crizotinib ，每天两次，8 周疗程。
治疗结果：肿瘤明显变小