03 2017 档案

摘要:哈代-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium),即HW平衡,是指对于一个大且随机交配的种群,基因频率和基因型频率在没有迁移、突变和选择的条件下会保持不变。它是建立在一个理想的群体模式上的,有四个假设前提:1.群体无限大;2.随机婚配;3.没有突变;4.没有大规模迁移和选 阅读全文
posted @ 2017-03-29 16:31 Thinkando 阅读(4240) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1. illumina测序化学原理 2. HiSeq 测序仪工作原理 3. PacBio 单分子超长测序 4. Ion Torrent 测序 5. X10人全基因组测序 6. illumina 公司的Nano Well 测序技术 7.第一代DNA测序 1. illumina测序化学原理 今天的第一期 阅读全文
posted @ 2017-03-29 09:47 Thinkando 阅读(23918) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:PYTHON修饰器的函数式编程 Hello World 下面是代码: 文件名:HELLO.PY 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 def hello(fn): def wrapper(): print "hello, %s" % fn.__name__ fn() print "g 阅读全文
posted @ 2017-03-27 15:16 Thinkando 阅读(500) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:对编程语言比较熟悉的朋友,应该知道“反射”这个机制。Python作为一门动态语言,当然不会缺少这一重要功能。然而,在网络上却很少见到有详细或者深刻的剖析论文。下面结合一个web路由的实例来阐述python的反射机制的使用场景和核心本质。 一、前言 1 2 3 4 5 def f1(): print( 阅读全文
posted @ 2017-03-27 10:13 Thinkando 阅读(534) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:中国译协对外传播翻译委员会中译英研讨会系列讨论词汇选登(1) 来源: 中国翻译协会对外传播翻译委员会 中国译协对外传播翻译委员会中译英研讨会系列讨论词汇选登(1) 来源: 中国翻译协会对外传播翻译委员会 中文 英文译词 关于建设和谐社会的词汇 1 疏导公众情绪 defuse (public) ang 阅读全文
posted @ 2017-03-26 10:35 Thinkando 阅读(1457) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 阅读全文
posted @ 2017-03-26 09:52 Thinkando 阅读(1884) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:一、简单句中的省略 1.省略主语 1)祈使句中的主语通常被省略 如: (You) Open the door, please. 请开一下门。 2) 其它省略主语多限于现成的说法 如: a) (I) Thank you for your help 谢谢你的帮助。 b) (It)Doesn’t matt 阅读全文
posted @ 2017-03-25 21:11 Thinkando 阅读(802) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:8种特殊建库测序 1. RNA-seq 2. 外显子测序 3. small RNA-seq 4. 单细胞DNA测序 5. 单细胞mRNA测序 6. 甲基化测序 7.Moleculo长测序 8. Ribozero和方向性RNA文库 1. RNA-seq 今天呐,主要是给大家介绍一下RNA-seq(RN 阅读全文
posted @ 2017-03-24 22:17 Thinkando 阅读(47492) 评论(1) 推荐(4) 编辑
摘要:Illumina的SNP芯片原理 Illumina的SNP生物芯片的优势在于: 第1,它的检测通量很大,一次可以检测几十万到几百万个SNP位点 第2,它的检测准确性很高,它的准确性可以达到99.9%以上 第3,它的检测的费用相对低廉,大约一个90万位点的芯片(每个样本的)检测费用在一、两千人民币 I 阅读全文
posted @ 2017-03-24 14:23 Thinkando 阅读(29454) 评论(7) 推荐(7) 编辑
摘要:Cleaning data in Python Table of Contents Set up environments Data analysis packages in Python Clean data in Python Load dataset into Spyder Subset Dr 阅读全文
posted @ 2017-03-23 19:36 Thinkando 阅读(1039) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:beta分布介绍 相信大家学过统计学的都对 正态分布 二项分布 均匀分布 等等很熟悉了,但是却鲜少有人去介绍beta分布的。 用一句话来说,beta分布可以看作一个概率的概率分布,当你不知道一个东西的具体概率是多少时,它可以给出了所有概率出现的可能性大小。 举一个简单的例子,熟悉棒球运动的都知道有一 阅读全文
posted @ 2017-03-21 13:06 Thinkando 阅读(8213) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:1 正态分布 若随机变量 服从一个位置参数为 、尺度参数为 的概率分布,且其概率密度函数为 则这个随机变量就称为正态随机变量,正态随机变量服从的分布就称为正态分布,记作 ,读作 服从 ,或 服从正态分布。 2 标准正态分布 3 泊松分布 泊松分布的概率函数为: 泊松分布的参数λ是单位时间(或单位面积 阅读全文
posted @ 2017-03-21 11:25 Thinkando 阅读(2410) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:伽玛分布(Gamma Distribution)是统计学的一种连续概率函数。Gamma分布中的参数α称为形状参数(shape parameter),β称为尺度参数(scale parameter)。 假设随机变量X为 等到第α件事发生所需之等候时间, 密度函数为 特征函数为 Gamma的可加性 编辑 阅读全文
posted @ 2017-03-21 10:25 Thinkando 阅读(70184) 评论(0) 推荐(2) 编辑
摘要:前言 1. 删除重复 2. 异常值监测 3. 替换 4. 数据映射 5. 数值变量类型化 6. 创建哑变量 统计师的Python日记【第7天:数据清洗(1)】 前言 根据我的Python学习计划: Numpy → Pandas → 掌握一些数据清洗、规整、合并等功能 → 掌握类似与SQL的聚合等数据 阅读全文
posted @ 2017-03-20 20:49 Thinkando 阅读(24991) 评论(0) 推荐(2) 编辑
摘要:Combining Data From Multiple Excel Files Introduction A common task for python and pandas is to automate the process of aggregating data from multiple 阅读全文
posted @ 2017-03-20 16:00 Thinkando 阅读(964) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:Merge, join, and concatenate pandas provides various facilities for easily combining together Series, DataFrame, and Panel objects with various kinds 阅读全文
posted @ 2017-03-19 14:55 Thinkando 阅读(1525) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:1. 数据合并 前言 一、横向合并 1. 基本合并语句 2. 键值名不一样的合并 3. “两个数据列名字重复了”的合并 二、纵向堆叠 统计师的Python日记【第6天:数据合并】 前言 根据我的Python学习计划: Numpy → Pandas → 掌握一些数据清洗、规整、合并等功能 → 掌握类似 阅读全文
posted @ 2017-03-17 16:19 Thinkando 阅读(26872) 评论(3) 推荐(1) 编辑
摘要:前言 一、Series 二、Dataframe 1. 数据结构 2. 基本操作 (1)改变索引名 (2)增加一列 (3)排序 (4)删除一列 统计师的Python日记【第4天:欢迎光临Pandas】 前言 第3天我发了一个愿,学Python我的计划是: Numpy → Pandas → 掌握一些数据 阅读全文
posted @ 2017-03-17 16:05 Thinkando 阅读(1585) 评论(1) 推荐(1) 编辑
摘要:Numpy → Pandas → 掌握一些数据清洗、规整、合并等功能 → 掌握类似与SQL的聚合等数据管理功能 → 能够用Python进行统计建模、假设检验等分析技能 → 能用Python打印出100元钱 → 能用Python帮我洗衣服、做饭 → 能用Python给我生小猴子...... 定下了这个 阅读全文
posted @ 2017-03-17 15:50 Thinkando 阅读(2311) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:导入Excel数据至R语言的几种方法 如有如下Excel数据源,如何将数据导入R语言呢?今天主要来介绍几种常见的方法; 一、使用剪贴板,然后使用read.table函数; 首先选择Excel中的数据源,然后复制; 在Rstudio中输入如下脚本,回车即可; read.table("clipboard 阅读全文
posted @ 2017-03-16 22:08 Thinkando 阅读(24236) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:【R笔记】R语言函数总结 R语言与数据挖掘:公式;数据;方法 R语言特征 对大小写敏感 通常,数字,字母,. 和 _都是允许的(在一些国家还包括重音字母)。不过,一个命名必须以 . 或者字母开头,并且如果以 . 开头,第二个字符不允许是数字。 基本命令要么是表达式(expressions)要么就是 阅读全文
posted @ 2017-03-14 16:58 Thinkando 阅读(11635) 评论(0) 推荐(4) 编辑
摘要:第十三章 多项式回归分析 阅读全文
posted @ 2017-03-14 15:14 Thinkando 阅读(935) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:第十二章 逐步回归和通径分析 1. 逐步回归 2 通径分析 阅读全文
posted @ 2017-03-14 15:07 Thinkando 阅读(2771) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:相关与回归分析基础 变量定义 在研究变量关系的过程中,通常对于被研究的变量,称为因变量,也称为被解释变量,一般用Y表示。其它用来说明或解释因变量变化的变量称为自变量,也称为解释变量,用X表示。自变量可以有一个,也可以有多个。例如,如果我们想预测销售收入,则销售收入就是我们这次研究的因变量,如果我们是 阅读全文
posted @ 2017-03-14 12:48 Thinkando 阅读(2250) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 阅读全文
posted @ 2017-03-11 22:13 Thinkando 阅读(761) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:第十章 协方差分析 第二节 单因素试验资料的协方差分析 分析结果表明,4种处理的供试仔猪平均初生重间存在着极显著的差异,其50 日龄平均重差异不显著。须进行协方差分析,以消除初生重不同对试验结果的影响,减小试验误差,揭示出可能被掩盖的处理间差异的显著性。 (五) 协方差分析 阅读全文
posted @ 2017-03-11 20:35 Thinkando 阅读(1507) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:第九章 常用试验设计及其统计分析 第二节:对比设计 第三节:随机区组设计(randomized block design) 第四节:拉丁方设计(latin square design) 第五节:裂区设计 阅读全文
posted @ 2017-03-11 11:06 Thinkando 阅读(748) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:确定了曲线类型之后,回归的任务就变成确定曲线公式中的参数,因此,也称为曲线拟合。 阅读全文
posted @ 2017-03-10 21:19 Thinkando 阅读(885) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:第七章 直线相关与回归分析 在生物学中,研究两个变量间的关系,主要是为了探求两变量的内在联系,或从一个变量X(可以是随机变量,也可以是一般的变量),去推测另一个随机变量Y。 (三)t检验 b是B的估计值 用|t|比较 第三节:直线相关 Linear Correlation 一、相关系数和决定系数 二 阅读全文
posted @ 2017-03-10 15:50 Thinkando 阅读(2046) 评论(0) 推荐(2) 编辑
摘要:第六章 方差分析 方差分析(Analysis of variance,ANOVA): 又叫变量分析,是英国著名统计学家R . A . Fisher于20世纪提出的。它是用以检验两个或多个均数间差异的假设检验方法。它是一类特定情况下的统计假设检验,或者说是平均数差异显著性检验的一种引伸。 方差分析的基 阅读全文
posted @ 2017-03-09 20:15 Thinkando 阅读(5405) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:第五章 χ2检验 一、χ2检验的定义 二、χ2检验与连续型资料假设检验的区别 三、χ2检验的用途 χ2 检验(Chi-square test) 对样本的频数分布所来自的总体分布是否服从某种理论分布或某种假设分布所作的假设检验,即根据样本的频数分布来推断总体的分布。 χ2检验与测量数据假设检验的区别 阅读全文
posted @ 2017-03-08 13:32 Thinkando 阅读(6597) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:数理统计研究问题的方式,不是对所研究对象的全体(称为总体)进行观察,而是抽取其中的部分(称为样本)进行观察获得数据(抽样),并通过这些数据对总体进行推断。数理统计方法具有“部分推断整体”的特征。 数学中的自由度一般是指能够自由取值的变量个数。数理统计中的自由度是指当以样本的统计量来估计总体的参数时, 阅读全文
posted @ 2017-03-08 10:34 Thinkando 阅读(17269) 评论(1) 推荐(3) 编辑
摘要:第四章 统计推断 统计推断: 由一个样本或一糸列样本所得的结果来推断总体的特征(1 假设检验、2、参数估计) 第一节 假设检验的原理与方法 一 概念 : 假设检验(hypothesis test)又称显著性检验(significance test),就是根据总体的理论分布和小概率原理,对未知或不完全 阅读全文
posted @ 2017-03-07 16:09 Thinkando 阅读(3472) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:T分布:温良宽厚 本文由“医学统计分析精粹”小编“Hiu”原创完成,文章采用知识共享Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0国际许可协议(http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/)进行许可,转载署 阅读全文
posted @ 2017-03-07 10:34 Thinkando 阅读(145490) 评论(6) 推荐(12) 编辑
摘要:第三章 概率 与 概率分布 (一)事件 定义:在一定条件下,某种事物出现与否就称为是事件。 自然界和社会生活上发生的现象是各种各样的,常见的有两类。 1、在一定条件下必然出现某种结果或必然不出现某种结果。 确定事件:必然事件(U)(certain event); 不可能事件(V)(impossibl 阅读全文
posted @ 2017-03-06 10:39 Thinkando 阅读(3910) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:伯努利分布 在一次试验中,事件A出现的概率为p,不出现的概率为q=1-p。若以β记事件A出现的次数,则β仅取0,1两值,相应的概率分布为: 二项分布是指在只有两个结果的n次独立的伯努利试验中,所期望的结果出现次数的概率。 阅读全文
posted @ 2017-03-06 09:57 Thinkando 阅读(2152) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:第二章 试验资料的整理与特征数的计算 一、试验资料的类型 对试验资料进行分类是统计归纳的基础。 一、数量性状资料 数量性状(quantitative character)是指能够以计数和测量或度量的方式表示其特征的性状。观察测定数量性状而获得的数据就是数量性状资料 (data of quantita 阅读全文
posted @ 2017-03-05 09:18 Thinkando 阅读(2573) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:生物统计学(第五版)目录 第五版前言第一版前言第一章 概论第一节 生物统计学的概念第二节 统计学发展概况一、古典记录统计学二、近代描述统计学三、现代推断统计学第三节 常用统计学术语一、总体与样本二、参数与统计数三、变量与资料四、因素与水平五、处理与重复六、效应与互作七、准确性与精确性八、误差与错误第 阅读全文
posted @ 2017-03-05 08:43 Thinkando 阅读(3039) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:TCP/IP简介 虽然大家现在对互联网很熟悉,但是计算机网络的出现比互联网要早很多。 计算机为了联网,就必须规定通信协议,早期的计算机网络,都是由各厂商自己规定一套协议,IBM、Apple和Microsoft都有各自的网络协议,互不兼容,这就好比一群人有的说英语,有的说中文,有的说德语,说同一种语言 阅读全文
posted @ 2017-03-04 10:18 Thinkando 阅读(5922) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:Python3 标准库概览 操作系统接口 os模块提供了不少与操作系统相关联的函数。 建议使用 "import os" 风格而非 "from os import *"。这样可以保证随操作系统不同而有所变化的 os.open() 不会覆盖内置函数 open()。 在使用 os 这样的大型模块时内置的 阅读全文
posted @ 2017-03-03 16:24 Thinkando 阅读(1981) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:Python 输入和输出 输出格式美化 Python两种输出值的方式: 表达式语句和 print() 函数。 第三种方式是使用文件对象的 write() 方法,标准输出文件可以用 sys.stdout 引用。 如果你希望输出的形式更加多样,可以使用 str.format() 函数来格式化输出值。 如 阅读全文
posted @ 2017-03-03 16:05 Thinkando 阅读(814) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:Python3 字符串 字符串是 Python 中最常用的数据类型。我们可以使用引号('或")来创建字符串。 创建字符串很简单,只要为变量分配一个值即可。例如: var1 = 'Hello World!' var2 = "Runoob" Python 访问字符串中的值 Python 不支持单字符类型 阅读全文
posted @ 2017-03-02 15:28 Thinkando 阅读(1479) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:基础 格式 表单 框架 图像 音频/视频 链接 列表 表格 样式/节 元信息 编程 全局事件属性 HTML 4 增加了使事件在浏览器中触发动作的能力,比如当用户点击元素时启动 JavaScript。 如需学习更多有关事件编程的知识,请访问我们的 JavaScript 教程。 下面列出了添加到 HTM 阅读全文
posted @ 2017-03-02 14:33 Thinkando 阅读(429) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:一、泊松分布 日常生活中,大量事件是有固定频率的。 某医院平均每小时出生3个婴儿 某公司平均每10分钟接到1个电话 某超市平均每天销售4包xx牌奶粉 某网站平均每分钟有2次访问 某医院平均每小时出生3个婴儿 某公司平均每10分钟接到1个电话 某超市平均每天销售4包xx牌奶粉 某网站平均每分钟有2次访 阅读全文
posted @ 2017-03-01 11:14 Thinkando 阅读(70767) 评论(1) 推荐(5) 编辑