协方差与协方差矩阵
标签: 协方差 协方差矩阵 统计
引言
最近在看主成分分析(PCA),其中有一步是计算样本各维度的协方差矩阵。以前在看算法介绍时,也经常遇到,现找了些资料复习,总结如下。
协方差
通常,在提到协方差的时候,需要对其进一步区分。(1)随机变量的协方差。跟数学期望、方差一样,是分布的一个总体参数。(2)样本的协方差。是样本集的一个统计量,可作为联合分布总体参数的一个估计。在实际中计算的通常是样本的协方差。
随机变量的协方差
在概率论和统计中,协方差是对两个随机变量联合分布线性相关程度的一种度量。两个随机变量越线性相关,协方差越大,完全线性无关,协方差为零。定义如下。
cov(X,Y)=E[(X−E[X])(Y−E[Y])]
当X,Y是同一个随机变量时,X与其自身的协方差就是X的方差,可以说方差是协方差的一个特例。
cov(X,X)=E[(X−E[X])(X−E[X])]
或
var(X)=cov(X,X)=E[(X−E[X])2]
由于随机变量的取值范围不同,两个协方差不具备可比性。如X,Y,Z分别是三个随机变量,想要比较X与Y的线性相关程度强,还是X与Z的线性相关程度强,通过cov(X,Y)与cov(X,Z)无法直接比较。定义相关系数η为
η=cov(X,Y)√var(X)⋅var(Y)
通过X的方差var(X)与Y的方差var(Y)对协方差cov(X,Y)归一化,得到相关系数η,η的取值范围是[−1,1]。1表示完全线性相关,−1表示完全线性负相关,0表示线性无关。线性无关并不代表完全无关,更不代表相互独立。
样本的协方差
在实际中,通常我们手头会有一些样本,样本有多个属性,每个样本可以看成一个多维随机变量的样本点,我们需要分析两个维度之间的线性关系。协方差及相关系数是度量随机变量间线性关系的参数,由于不知道具体的分布,只能通过样本来进行估计。
设样本对应的多维随机变量为X=[X1,X2,X3,...,Xn]T,样本集合为{x⋅j=[x1j,x2j,...,xnj]T|1⩽j⩽m},m为样本数量。与样本方差的计算相似,a和b两个维度样本的协方差公式为,其中1⩽a⩽n,1⩽b⩽n,n为样本维度
qab=∑mj=1(xaj−¯xa)(xbj−¯xb)m−1
这里分母为m−1是因为随机变量的数学期望未知,以样本均值代替,自由度减一。
协方差矩阵
多维随机变量的协方差矩阵
对多维随机变量X=[X1,X2,X3,...,Xn]T,我们往往需要计算各维度两两之间的协方差,这样各协方差组成了一个n×n的矩阵,称为协方差矩阵。协方差矩阵是个对称矩阵,对角线上的元素是各维度上随机变量的方差。我们定义协方差矩阵为Σ,这个符号与求和∑相同,需要根据上下文区分。矩阵内的元素Σij为
Σij=cov(Xi,Xj)=E[(Xi−E[Xi])(Xj−E[Xj])]
这样这个矩阵为
Σ=E[(X−E[X])(X−E[X])T]
=⎡⎢
⎢
⎢
⎢
⎢⎣cov(X1,X1)cov(X1,X2)⋯cov(X1,Xn)cov(X2,X1)cov(X2,X2)⋯cov(X2,Xn)⋮⋮⋱⋮cov(Xn,X1)cov(Xn,X2)⋯cov(Xn,Xn)⎤⎥
⎥
⎥
⎥
⎥⎦
=⎡⎢
⎢
⎢
⎢
⎢
⎢⎣E[(X1−E[X1])(X1−E[X1])]E[(X1−E[X1])(X2−E[X2])]⋯E[(X1−E[X1])(Xn−E[Xn])]E[(X2−E[X2])(X1−E[X1])]E[(X2−E[X2])(X2−E[X2])]⋯E[(X2−E[X2])(Xn−E[Xn])]⋮⋮⋱⋮E[(Xn−E[Xn])(X1−E[X1])]E[(Xn−E[Xn])(X2−E[X2])]⋯E[(Xn−E[Xn])(Xn−E[Xn])]⎤⎥
⎥
⎥
⎥
⎥
⎥⎦
样本的协方差矩阵
与上面的协方差矩阵相同,只是矩阵内各元素以样本的协方差替换。样本集合为{x⋅j=[x1j,x2j,...,xnj]T|1⩽j⩽m},m为样本数量,所有样本可以表示成一个n×m的矩阵。我们以^Σ表示样本的协方差矩阵,与Σ区分。
^Σ=⎡⎢
⎢
⎢
⎢
⎢⎣q11q12⋯q1nq21q21⋯q2n⋮⋮⋱⋮qn1qn2⋯qnn⎤⎥
⎥
⎥
⎥
⎥⎦
=1m−1⎡⎢
⎢
⎢
⎢
⎢
⎢⎣∑mj=1(x1j−¯x1)(x1j−¯x1)∑mj=1(x1j−¯x1)(x2j−¯x2)⋯∑mj=1(x1j−¯x1)(xnj−¯xn)∑mj=1(x2j−¯x2)(x1j−¯x1)∑mj=1(x2j−¯x2)(x2j−¯x2)⋯∑mj=1(x2j−¯x2)(xnj−¯xn)⋮⋮⋱⋮∑mj=1(xnj−¯xn)(x1j−¯x1)∑mj=1(xnj−¯xn)(x2j−¯x2)⋯∑mj=1(xnj−¯xn)(xnj−¯xn)⎤⎥
⎥
⎥
⎥
⎥
⎥⎦
=1m−1m∑j=1(x⋅j−¯x)(x⋅j−¯x)T
公式中m为样本数量,¯x为样本的均值,是一个列向量,x⋅j为第j个样本,也是一个列向量。
在写程序计算样本的协方差矩阵时,我们通常用后一种向量形式计算。一个原因是代码更紧凑清晰,另一个原因是计算机对矩阵及向量运算有大量的优化,效率高于在代码中计算每个元素。
需要注意的是,协方差矩阵是计算样本不同维度之间的协方差,而不是对不同样本计算,所以协方差矩阵的大小与维度相同。
很多时候我们只关注不同维度间的线性关系,且要求这种线性关系可以互相比较。所以,在计算协方差矩阵之前,通常会对样本进行归一化,包括两部分:
- y⋅j=x⋅j−¯x。即对样本进行平移,使其重心在原点;
- zi⋅=yi⋅/σi。其中σi是维度i的标准差。这样消除了数值大小的影响。
这样,协方差矩阵^Σ可以写成
^Σ=1m−1m∑j=1z⋅jzT⋅j
该矩阵内的元素具有可比性。
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