摘要:
摘自:https://mp.weixin.qq.com/s/qFQC7ZQJWGou9wD9WkziAQ 本文继续介绍lammps基本操作命令。 在lammps模拟中,所有的原子处在一个封闭的空间内,这个空间称为盒子(box)。 创建box有两种方法,一是在lammps中使用create_box命令 阅读全文
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###############计算单个原子的温度#################compute KE pp ke/atomvariable KB equal 8.625e-5 # 玻尔兹曼常数,eV/K, 这个数要根据计算unit来确定,(1)如果是real单位,能量单位为kcal/mol,则KB 阅读全文
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1.python script: import numpy def modify(frame, data): # Access the per-particle displacement magnitudes computed by the # 'Displacement Vectors' modi 阅读全文
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# INITIALIZATION echo screen dimension 3boundary p p patom_style fullunits real # 变量定义 variable filename1 index mergevariable T0 equal 300 #初始温度设定为298 阅读全文
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问题:在MS软件导出car、mdf文件后,因为通过lammps的msi2lmp.exe所导出来的data文件,原子序号不按照我们所想要排列的顺序,如何修改? 方法: 1.先打开car、mdf文件 2.直接通过复制、粘贴的方式,将想要排在最前边的原子的信息放在前边即可。 阅读全文
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生成水盒子的in文件代码和data文件见以下链接: https://files.cnblogs.com/files/sysu/creat-water-box.zip?t=1698124054&download=true 1.in文件 # TIP4P/2005 water system variabl 阅读全文
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https://blog.csdn.net/this_capslock/article/details/17415409 阅读全文
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1.安装: 官网下载:https://atomsk.univ-lille.fr/dl.php 2.cmd如何打开:按住“菜单”+R,再输入cmd,即可打开; 3.cd 进入装有Atomsk的文件夹,输入atomsk的相关命令即可。 学习资料: 1.b站视频:https://www.bilibili. 阅读全文
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1.什么是表面能?(可以去b站和youtube上看相关的介绍和解说,很多老师解释得很详细) 定义1:将体相变成表面晶体所需要的能量。 定义2:表面能是恒温、恒压、恒组成情况下,可逆地增加物系表面积须对物质所做的非体积功(单一相)。(对比:粘附功W12是指从相邻两相1和2之间分离需要做的功(两相),可 阅读全文