一棵开花的树sysu

摘要： 摘自：https://mp.weixin.qq.com/s/qFQC7ZQJWGou9wD9WkziAQ 本文继续介绍lammps基本操作命令。 在lammps模拟中，所有的原子处在一个封闭的空间内，这个空间称为盒子（box）。 创建box有两种方法，一是在lammps中使用create_box命令 阅读全文

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摘要： ###############计算单个原子的温度#################compute KE pp ke/atomvariable KB equal 8.625e-5 # 玻尔兹曼常数，eV/K， 这个数要根据计算unit来确定，（1）如果是real单位，能量单位为kcal/mol，则KB 阅读全文

摘要： 1.python script： import numpy def modify(frame, data): # Access the per-particle displacement magnitudes computed by the # 'Displacement Vectors' modi 阅读全文

摘要： # INITIALIZATION echo screen dimension 3boundary p p patom_style fullunits real # 变量定义 variable filename1 index mergevariable T0 equal 300 #初始温度设定为298 阅读全文

摘要： 问题：在MS软件导出car、mdf文件后，因为通过lammps的msi2lmp.exe所导出来的data文件，原子序号不按照我们所想要排列的顺序，如何修改？ 方法： 1.先打开car、mdf文件 2.直接通过复制、粘贴的方式，将想要排在最前边的原子的信息放在前边即可。 阅读全文

摘要： 生成水盒子的in文件代码和data文件见以下链接： https://files.cnblogs.com/files/sysu/creat-water-box.zip?t=1698124054&download=true 1.in文件 # TIP4P/2005 water system variabl 阅读全文

摘要： https://blog.csdn.net/this_capslock/article/details/17415409 阅读全文

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摘要： 1.安装： 官网下载：https://atomsk.univ-lille.fr/dl.php 2.cmd如何打开：按住“菜单”+R，再输入cmd，即可打开； 3.cd 进入装有Atomsk的文件夹，输入atomsk的相关命令即可。 学习资料： 1.b站视频：https://www.bilibili. 阅读全文