摘要：
转载自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_b48a7ac30102w6xg.html 自我学习总结： 1、打开VMD main上Extensions中的TkConsole这是VMD的控制命令区域。 2、围绕x轴旋转90：rotat x by 90 (或者rotat x t 阅读全文
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本文转载自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_b48a7ac30102w4km.html 注意：lammps中并没有完整的clayff势函数，需要将一下三者结合使用。 angle_style harmonic bond_style harmonic pair_style 阅读全文
摘要：
一、认清模型——data文件； 二、读懂in文件； 三、当遇到error时，we can do： 1.查错： （1）从out文件中，复制里边的错误信息（copy一部分，不用全部）； （2）进入到lammps官网的13.3.Error messages中，输入“ctrl+F”，出现下图； （3）“粘贴 阅读全文
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Note： 1.分子动力学结果分析（学习资料）： https://wenku.baidu.com/view/6d9b9e3a5a8102d277a22f03.html### 2.需要进行计算，可以根据自己的需求去lammps官网上，看相关命令（如：compute命令等）。 一、热力学量的分析 二、动 阅读全文
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（转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_b48a7ac30102w4mg.html###） 以下取自：http://simulation.haotui.com/viewthread.php?tid=11368&jdfwkey=cnypw3 收集1：neighbor选取的 阅读全文
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摘自：http://dxli75.blog.163.com/blog/static/106768289201142893419587/ lammps计算的应力有两种： 一是体系整体的应力状态，通过在thermo_style custom里加上pxx pyy pzz pxy pxz pyz字段可将给定 阅读全文
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每个动力学模拟必须要通过fix命令设置系综，若没有设置系综，则就没有时间积分。 一、NVE系综 更新位置和速度，V和E恒定。 velocity all create 300.0 4928459 rot yes dist gaussian #控制原子的初始速度 fix 1 all nve 二、NVT系 阅读全文
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一、notes： 1、不在data文件里写“#”（注释），否则，容易出错； 2、前两行不用写东西（建议）； 3、相互作用系数可以不用写在data里边（如pair_coeff等），可有可无，but for pair_coeff，最好还是在data文件中设定，因为它比在in文件中设定更加方便、简洁。 二 阅读全文