计算原子的温度显示到ovito（lammps）、如何将三斜盒子变为正交盒子

###############计算单个原子的温度#################
compute KE pp ke/atom
variable   KB equal 8.625e-5        # 玻尔兹曼常数，eV/K， 这个数要根据计算unit来确定，（1）如果是real单位，能量单位为kcal/mol，则KB=1.987252e-3 Kcal/K；（2）如果是metal单位，能量单位为ev，则KB=8.6173713 ev/K；（3）百度百科的单位为KB=1.380658j/K
variable  TEMP atom c_KE/1.5/${KB} # 单原子温度

dump 4 all custom ${interval} ${filename1}.lammpstrj id type x y z c_coord c_ke_atom c_pe_atom c_displace[1] c_displace[2] c_displace[3] c_displace[4]  v_TEMP

 

##############lammps如何将三斜盒子变为正交盒子######################

在data文件中添加下面一行数据即可
0.0 0.0 0.0 xy xz yz

##############MS如何将斜晶胞改为正晶胞######################

Build——symmetry——Redefine Lattice——A：2 1 0