Python 数据分析包:pandas 基础
pandas 是基于 Numpy 构建的含有更高级数据结构和工具的数据分析包
类似于 Numpy 的核心是 ndarray,pandas 也是围绕着 Series 和 DataFrame 两个核心数据结构展开的 。Series 和 DataFrame 分别对应于一维的序列和二维的表结构。pandas 约定俗成的导入方法如下:
from pandas import Series,DataFrame import pandas as pd
Series
Series 可以看做一个定长的有序字典。基本任意的一维数据都可以用来构造 Series 对象:
>>> s = Series([1,2,3.0,'abc']) >>> s 0 1 1 2 2 3 3 abc dtype: object
虽然 dtype:object
可以包含多种基本数据类型,但总感觉会影响性能的样子,最好还是保持单纯的 dtype。
Series 对象包含两个主要的属性:index 和 values,分别为上例中左右两列。因为传给构造器的是一个列表,所以 index 的值是从 0 起递增的整数,如果传入的是一个类字典的键值对结构,就会生成 index-value 对应的 Series;或者在初始化的时候以关键字参数显式指定一个 index 对象:
>>> s = Series(data=[1,3,5,7],index = ['a','b','x','y']) >>> s a 1 b 3 x 5 y 7 dtype: int64 >>> s.index Index(['a', 'b', 'x', 'y'], dtype='object') >>> s.values array([1, 3, 5, 7], dtype=int64)
Series 对象的元素会严格依照给出的 index 构建,这意味着:如果 data 参数是有键值对的,那么只有 index 中含有的键会被使用;以及如果 data 中缺少响应的键,即使给出 NaN 值,这个键也会被添加。
注意 Series 的 index 和 values 的元素之间虽然存在对应关系,但这与字典的映射不同。index 和 values 实际仍为互相独立的 ndarray 数组,因此 Series 对象的性能完全 ok。
Series 这种使用键值对的数据结构最大的好处在于,Series 间进行算术运算时,index 会自动对齐。
另外,Series 对象和它的 index 都含有一个 name
属性:
>>> s.name = 'a_series' >>> s.index.name = 'the_index' >>> s the_index a 1 b 3 x 5 y 7 Name: a_series, dtype: int64
DataFrame
DataFrame 是一个表格型的数据结构,它含有一组有序的列(类似于 index),每列可以是不同的值类型(不像 ndarray 只能有一个 dtype)。基本上可以把 DataFrame 看成是共享同一个 index 的 Series 的集合。
DataFrame 的构造方法与 Series 类似,只不过可以同时接受多条一维数据源,每一条都会成为单独的一列:
>>> data = {'state':['Ohino','Ohino','Ohino','Nevada','Nevada'], 'year':[2000,2001,2002,2001,2002], 'pop':[1.5,1.7,3.6,2.4,2.9]} >>> df = DataFrame(data) >>> df pop state year 0 1.5 Ohino 2000 1 1.7 Ohino 2001 2 3.6 Ohino 2002 3 2.4 Nevada 2001 4 2.9 Nevada 2002 [5 rows x 3 columns]
虽然参数 data 看起来是个字典,但字典的键并非充当 DataFrame 的 index 的角色,而是 Series 的 “name” 属性。这里生成的 index 仍是 “01234”。
较完整的 DataFrame 构造器参数为:DataFrame(data=None,index=None,coloumns=None)
,columns 即 “name”:
>>> df = DataFrame(data,index=['one','two','three','four','five'], columns=['year','state','pop','debt']) >>> df year state pop debt one 2000 Ohino 1.5 NaN two 2001 Ohino 1.7 NaN three 2002 Ohino 3.6 NaN four 2001 Nevada 2.4 NaN five 2002 Nevada 2.9 NaN [5 rows x 4 columns]
同样缺失值由 NaN 补上。看一下 index、columns 和 索引的类型:
>>> df.index Index(['one', 'two', 'three', 'four', 'five'], dtype='object') >>> df.columns Index(['year', 'state', 'pop', 'debt'], dtype='object') >>> type(df['debt']) <class 'pandas.core.series.Series'>
DataFrame 面向行和面向列的操作基本是平衡的,任意抽出一列都是 Series。
对象属性
重新索引
Series 对象的重新索引通过其 .reindex(index=None,**kwargs)
方法实现。**kwargs
中常用的参数有俩:method=None,fill_value=np.NaN
:
ser = Series([4.5,7.2,-5.3,3.6],index=['d','b','a','c']) >>> a = ['a','b','c','d','e'] >>> ser.reindex(a) a -5.3 b 7.2 c 3.6 d 4.5 e NaN dtype: float64 >>> ser.reindex(a,fill_value=0) a -5.3 b 7.2 c 3.6 d 4.5 e 0.0 dtype: float64 >>> ser.reindex(a,method='ffill') a -5.3 b 7.2 c 3.6 d 4.5 e 4.5 dtype: float64 >>> ser.reindex(a,fill_value=0,method='ffill') a -5.3 b 7.2 c 3.6 d 4.5 e 4.5 dtype: float64
.reindex()
方法会返回一个新对象,其 index 严格遵循给出的参数,method:{'backfill', 'bfill', 'pad', 'ffill', None}
参数用于指定插值(填充)方式,当没有给出时,自动用 fill_value
填充,默认为 NaN(ffill = pad,bfill = back fill,分别指插值时向前还是向后取值)
DataFrame 对象的重新索引方法为:.reindex(index=None,columns=None,**kwargs)
。仅比 Series 多了一个可选的 columns 参数,用于给列索引。用法与上例类似,只不过插值方法method
参数只能应用于行,即轴 0。
>>> state = ['Texas','Utha','California'] >>> df.reindex(columns=state,method='ffill') Texas Utha California a 1 NaN 2 c 4 NaN 5 d 7 NaN 8 [3 rows x 3 columns] >>> df.reindex(index=['a','b','c','d'],columns=state,method='ffill') Texas Utha California a 1 NaN 2 b 1 NaN 2 c 4 NaN 5 d 7 NaN 8 [4 rows x 3 columns]
不过 fill_value
依然对有效。聪明的小伙伴可能已经想到了,可不可以通过 df.T.reindex(index,method='**').T
这样的方式来实现在列上的插值呢,答案是可行的。另外要注意,使用 reindex(index,method='**')
的时候,index 必须是单调的,否则就会引发一个 ValueError: Must be monotonic for forward fill
,比如上例中的最后一次调用,如果使用index=['a','b','d','c']
的话就不行。
删除指定轴上的项
即删除 Series 的元素或 DataFrame 的某一行(列)的意思,通过对象的.drop(labels, axis=0)
方法:
>>> ser d 4.5 b 7.2 a -5.3 c 3.6 dtype: float64 >>> df Ohio Texas California a 0 1 2 c 3 4 5 d 6 7 8 [3 rows x 3 columns] >>> ser.drop('c') d 4.5 b 7.2 a -5.3 dtype: float64 >>> df.drop('a') Ohio Texas California c 3 4 5 d 6 7 8 [2 rows x 3 columns] >>> df.drop(['Ohio','Texas'],axis=1) California a 2 c 5 d 8 [3 rows x 1 columns]
.drop()
返回的是一个新对象,元对象不会被改变。
索引和切片
就像 Numpy,pandas 也支持通过 obj[::]
的方式进行索引和切片,以及通过布尔型数组进行过滤。
不过须要注意,因为 pandas 对象的 index 不限于整数,所以当使用非整数作为切片索引时,它是末端包含的。
>>> foo a 4.5 b 7.2 c -5.3 d 3.6 dtype: float64 >>> bar 0 4.5 1 7.2 2 -5.3 3 3.6 dtype: float64 >>> foo[:2] a 4.5 b 7.2 dtype: float64 >>> bar[:2] 0 4.5 1 7.2 dtype: float64 >>> foo[:'c'] a 4.5 b 7.2 c -5.3 dtype: float64
这里 foo 和 bar 只有 index 不同——bar 的 index 是整数序列。可见当使用整数索引切片时,结果与 Python 列表或 Numpy 的默认状况相同;换成'c'
这样的字符串索引时,结果就包含了这个边界元素。
另外一个特别之处在于 DataFrame 对象的索引方式,因为他有两个轴向(双重索引)。
可以这么理解:DataFrame 对象的标准切片语法为:.ix[::,::]
。ix 对象可以接受两套切片,分别为行(axis=0)和列(axis=1)的方向:
>>> df Ohio Texas California a 0 1 2 c 3 4 5 d 6 7 8 [3 rows x 3 columns] >>> df.ix[:2,:2] Ohio Texas a 0 1 c 3 4 [2 rows x 2 columns] >>> df.ix['a','Ohio'] 0
而不使用 ix ,直接切的情况就特殊了:
- 索引时,选取的是列
- 切片时,选取的是行
这看起来有点不合逻辑,但作者解释说 “这种语法设定来源于实践”,我们信他。
>>> df['Ohio'] a 0 c 3 d 6 Name: Ohio, dtype: int32 >>> df[:'c'] Ohio Texas California a 0 1 2 c 3 4 5 [2 rows x 3 columns] >>> df[:2] Ohio Texas California a 0 1 2 c 3 4 5 [2 rows x 3 columns]
使用布尔型数组的情况,注意行与列的不同切法(列切法的 :
不能省):
>>> df['Texas']>=4 a False c True d True Name: Texas, dtype: bool >>> df[df['Texas']>=4] Ohio Texas California c 3 4 5 d 6 7 8 [2 rows x 3 columns] >>> df.ix[:,df.ix['c']>=4] Texas California a 1 2 c 4 5 d 7 8 [3 rows x 2 columns]
算术运算和数据对齐
pandas 最重要的一个功能是,它可以对不同索引的对象进行算术运算。在将对象相加时,结果的索引取索引对的并集。自动的数据对齐在不重叠的索引处引入空值,默认为 NaN。
>>> foo = Series({'a':1,'b':2}) >>> foo a 1 b 2 dtype: int64 >>> bar = Series({'b':3,'d':4}) >>> bar b 3 d 4 dtype: int64 >>> foo + bar a NaN b 5 d NaN dtype: float64
DataFrame 的对齐操作会同时发生在行和列上。
当不希望在运算结果中出现 NA 值时,可以使用前面 reindex 中提到过fill_value
参数,不过为了传递这个参数,就需要使用对象的方法,而不是操作符:df1.add(df2,fill_value=0)
。其他算术方法还有:sub(), div(), mul()
。
Series 和 DataFrame 之间的算术运算涉及广播,暂时先不讲。
函数应用和映射
Numpy 的 ufuncs(元素级数组方法)也可用于操作 pandas 对象。
当希望将函数应用到 DataFrame 对象的某一行或列时,可以使用.apply(func, axis=0, args=(), **kwds)
方法。
f = lambda x:x.max()-x.min() >>> df Ohio Texas California a 0 1 2 c 3 4 5 d 6 7 8 [3 rows x 3 columns] >>> df.apply(f) Ohio 6 Texas 6 California 6 dtype: int64 >>> df.apply(f,axis=1) a 2 c 2 d 2 dtype: int64
排序和排名
Series 的 sort_index(ascending=True)
方法可以对 index 进行排序操作,ascending 参数用于控制升序或降序,默认为升序。
若要按值对 Series 进行排序,当使用 .order()
方法,任何缺失值默认都会被放到 Series 的末尾。
在 DataFrame 上,.sort_index(axis=0, by=None, ascending=True)
方法多了一个轴向的选择参数与一个 by 参数,by 参数的作用是针对某一(些)列进行排序(不能对行使用 by 参数):
>>> df.sort_index(by='Ohio') Ohio Texas California a 0 1 2 c 3 4 5 d 6 7 8 [3 rows x 3 columns] >>> df.sort_index(by=['California','Texas']) Ohio Texas California a 0 1 2 c 3 4 5 d 6 7 8 [3 rows x 3 columns] >>> df.sort_index(axis=1) California Ohio Texas a 2 0 1 c 5 3 4 d 8 6 7 [3 rows x 3 columns]
排名(Series.rank(method='average', ascending=True)
)的作用与排序的不同之处在于,他会把对象的 values 替换成名次(从 1 到 n)。这时唯一的问题在于如何处理平级项,方法里的 method
参数就是起这个作用的,他有四个值可选:average, min, max, first
。
>>> ser=Series([3,2,0,3],index=list('abcd')) >>> ser a 3 b 2 c 0 d 3 dtype: int64 >>> ser.rank() a 3.5 b 2.0 c 1.0 d 3.5 dtype: float64 >>> ser.rank(method='min') a 3 b 2 c 1 d 3 dtype: float64 >>> ser.rank(method='max') a 4 b 2 c 1 d 4 dtype: float64 >>> ser.rank(method='first') a 3 b 2 c 1 d 4 dtype: float64
注意在 ser[0]=ser[3] 这对平级项上,不同 method 参数表现出的不同名次。
DataFrame 的 .rank(axis=0, method='average', ascending=True)
方法多了个 axis 参数,可选择按行或列分别进行排名,暂时好像没有针对全部元素的排名方法。
统计方法
pandas 对象有一些统计方法。它们大部分都属于约简和汇总统计,用于从 Series 中提取单个值,或从 DataFrame 的行或列中提取一个 Series。
比如 DataFrame.mean(axis=0,skipna=True)
方法,当数据集中存在 NA 值时,这些值会被简单跳过,除非整个切片(行或列)全是 NA,如果不想这样,则可以通过 skipna=False
来禁用此功能:
>>> df one two a 1.40 NaN b 7.10 -4.5 c NaN NaN d 0.75 -1.3 [4 rows x 2 columns] >>> df.mean() one 3.083333 two -2.900000 dtype: float64 >>> df.mean(axis=1) a 1.400 b 1.300 c NaN d -0.275 dtype: float64 >>> df.mean(axis=1,skipna=False) a NaN b 1.300 c NaN d -0.275 dtype: float64
其他常用的统计方法有:
######################## | ****************************************** |
count | 非 NA 值的数量 |
describe | 针对 Series 或 DF 的列计算汇总统计 |
min , max | 最小值和最大值 |
argmin , argmax | 最小值和最大值的索引位置(整数) |
idxmin , idxmax | 最小值和最大值的索引值 |
quantile | 样本分位数(0 到 1) |
sum | 求和 |
mean | 均值 |
median | 中位数 |
mad | 根据均值计算平均绝对离差 |
var | 方差 |
std | 标准差 |
skew | 样本值的偏度(三阶矩) |
kurt | 样本值的峰度(四阶矩) |
cumsum | 样本值的累计和 |
cummin , cummax | 样本值的累计最大值和累计最小值 |
cumprod | 样本值的累计积 |
diff | 计算一阶差分(对时间序列很有用) |
pct_change | 计算百分数变化 |
处理缺失数据
pandas 中 NA 的主要表现为 np.nan,另外 Python 内建的 None 也会被当做 NA 处理。
处理 NA 的方法有四种:dropna , fillna , isnull , notnull
。
is(not)null
这一对方法对对象做元素级应用,然后返回一个布尔型数组,一般可用于布尔型索引。
dropna
对于一个 Series,dropna 返回一个仅含非空数据和索引值的 Series。
问题在于对 DataFrame 的处理方式,因为一旦 drop 的话,至少要丢掉一行(列)。这里的解决方式与前面类似,还是通过一个额外的参数:dropna(axis=0, how='any', thresh=None)
,how 参数可选的值为 any 或者 all。all 仅在切片元素全为 NA 时才抛弃该行(列)。另外一个有趣的参数是 thresh,该参数的类型为整数,它的作用是,比如 thresh=3,会在一行中至少有 3 个非 NA 值时将其保留。
fillna
fillna(value=None, method=None, axis=0)
中的 value 参数除了基本类型外,还可以使用字典,这样可以实现对不同的列填充不同的值。method 的用法与前面 .reindex()
方法相同,这里不再赘述。
inplace 参数
前面有个点一直没讲,结果整篇示例写下来发现还挺重要的。就是 Series 和 DataFrame 对象的方法中,凡是会对数组作出修改并返回一个新数组的,往往都有一个 replace=False
的可选参数。如果手动设定为 True,那么原数组就可以被替换。