KEGG通路图应该怎么看(转载)
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不管是RNA-seq的分析数据,还是蛋白组的分析数据,都有一个数据库我们会经常遇到,那就是KEGG pathway。KEGG pathway中有着大量的通路图,以PI3K-Akt signaling pathway(ko04151)为例,里面包含了大量的蛋白等化合物,以及它们之间相互作用的关系,那么我们如何快速的读懂这些通路包含的信息,且看师兄用三张图片让你快速入门。。。。
compound【n. [化学] 化合物;混合物;复合词】
phosphorylation(磷酸化)
dephosphorylation(去磷酸化)
ubiquitination (泛素化)
glycosylation(糖基化)
methylation(甲基化)