摘要： #按照顺序采样 一共有6种方式进行索引： Basic indexing: [idx][idx][idx] 只能取一个元素 a = tf.ones([1,5,5,3]) a[0][0] a[0][0][0] a[0][0][0][2] Same with Numpy: [idx, idx,...] a 阅读全文

摘要： #创建Tensor ##从numpy上转换得到，或者通过list 通过`tf.convert_to_tensor()'将一个numpy的array或者list转化为tensor tf.convert_to_tensor(np.ones([2,3])) #将int型转化为float64,需要再次将fl 阅读全文

摘要： 参考资料： How to Calculate Relative Risk Relative Risk Ratio and Odds Ratio 如何计算 Relative Risk Relative Risk 表示在暴露组中某个事件发生的概率versus在非暴露组中事件发生的概率比率 Relativ 阅读全文

摘要： 生信技能树R语言部分学习笔记 1. tidyr包能做什么事情？ 1.1 数据清理 tidyr的扁和长 数据的两种组织方式：扁和长，二者包含的信息相同，可以相互转换（用tidyr中的函数：gather-spread） 举例： 扁数据 (1) 扁变长 test_gather <- gather(data 阅读全文

摘要： 生信技能树R语言部分学习笔记 1. 常用可视化R包 作图：base, ggplot2, ggpubr 拼图：par里的mfrow（基础包中图的拼接）, grid.arrange, cowplot, customLayout, patchwork 导出：pdf()等三段论, ggsave(), eof 阅读全文

摘要： 生信技能树R语言部分学习笔记 dir() #列出工作目录下的文件 ls() #列出环境中的变量 #1. 认识csv格式 csv打开方式： (1)默认excel (2)记事本打开 (3)sublime（适用大文件） (4)R语言读取：读进R语言之后的数据是一个数据框，可赋值，变量名与文件名无必然联系， 阅读全文

摘要： 生信技能树R语言部分学习笔记 学习用Rmarkdown来写代码，Rmarkdown可以将注释、代码、运行结构一起展示的一种工具。 #1. 函数与参数 (1)形式参数与实际参数 函数括号里面等号前面的是形式参数，等号后面的是实际参数。形式参数是函数作者设计的，可以不写；实际参数是使用者可以更改的。 ( 阅读全文

摘要： 生信技能树R语言部分学习笔记 #03 数据框、矩阵和列表 ##3.1 数据结构简介 (1) Vector向量：一维 从1：100个整数中，随机取7个数，默认不放回取，如果要有放回取样，需要设置参数replace = TRUE > sample(1:100,7) [1] 38 80 74 96 63 阅读全文

摘要： 生信技能树R语言部分学习笔记 诸事殚精竭虑者，终将一无所成。 腓特烈大帝 #01 R与Rstudio 在R中用新建R project来代替setwd(),方便管理工作目录（默认文件保存的位置）。 #02 数据类型和向量 数据类型分为：数值型(numeric)，字符型(character)，逻辑型(l 阅读全文

摘要： R bioconductor中的scRNAseq数据包是专门提供scRNA-seq数据的包。 #1.Introduction scRNA-seq包提供了一个方便的途径来获得公开的数据集，这些数据集是以SingleCellExperiment 格式存储的。 library(SingleCellExpe 阅读全文