摘要：
在前面的教程中，我们介绍了使用omicverse完成基本的RNA-seq的分析流程，在本节教程中，我们将介绍如何使用omicverse完成加权基因共表达网络分析WGCNA以及蛋白质相互作用PPI分析。 环境的下载 在这里我们只需要安装omicverse环境即可，有两个方法： 一个是使用conda：c 阅读全文
摘要：
Bulk RNA-seq 分析的一个重要任务是分析差异表达基因，我们可以用 omicverse包 来完成这个任务。在omicverse中，除了最简单的ttest外，在这里，我们介绍一种类似R语言中的Deseq2等包的模型来计算差异表达基因。 原教程地址：https://omicverse.readt 阅读全文
摘要：
Bulk RNA-seq 分析的一个重要任务是分析差异表达基因，我们可以用 omicverse包来完成这个任务。对于差异表达分析而言，首先，我们可> 以先将 gene_id 改为 gene_name。其次，当我们的数据集存在批量效应时，我们可以使用 DEseq2的 SizeFactor 对其进行归一 阅读全文
摘要：
作者按 我们在Python的scverse生态中，重新实现了GPTCelltype的函数，并加入了更多大模型的扩展，同时我们并将其封装进OmicVerse框架中 全文字数|预计阅读时间: 2000|5min ——Starlitnightly（星夜） GPT-4 是一种专为语音理解和生成而设计的大型语 阅读全文