摘要:
一、官方下载工具Sratoolkit安装 推荐使用conda直接安装,避免配置环境的麻烦,但sratoolkit在conda镜像中的包名为sra-tools 1 conda install -y -c bioconda sra-tools 二、SRA文件下载地址获取 1.NCBI GEO数据库下载地 阅读全文
摘要:
miniconda是anaconda的简化版,包含核心的一些功能,如conda 一、安装 1> 使用wget 从清华镜像源下载miniconda 使用命令uname -m可以查看电脑类型 1 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/min 阅读全文
摘要:
一、参考基因组下载 下载地址: 三大国际数据中心(NCBI、UCSC、ENSEMBL)均可下载 下载过程: 1> 浏览器地址栏输入(建议使用bing搜索引擎,可直接定位到网站下载数据库): 1 hg38 ftp ucsc 2> 点击进入数据库,下翻找到下载地址: 3> 鼠标右键复制下载地址,Linu 阅读全文
摘要:
1.实现方法: 通过数组对象方法splice()可以实现数组元素的去重操作; 通过遍历数组中的每一个元素,将该元素同它之后的所有元素进行逐一比较,若相同,则删除后面的元素,达到去重的目的; 2.splice()用法: splice(i,n,ele)方法:删除数组中指定元素,并将被删除的内容作为返回值 阅读全文
摘要:
1. JS数据类型 在JS中,数据基本可分为两大类: 第一类:五大基本数据类型:(String、Number、Boolean、Null、Undefined); 第二类:引用数据类型:对象(Object) 2.对象的分类 2.1内建对象 由ES标准定义的对象,在ES的任何实现形式中都能够使用;如常见的 阅读全文
摘要:
1.简介 Less相当于是增强版的CSS,其中包括大量针对CSS的拓展,虽然原生CSS3支持用户输入变量,但目前兼容性差;利用Webstorm的file watcher,我们可以编写Less文件,并会被系统自动编译为浏览器可以识别的css文件;但需要提前安装Less; 2.安装流程 2.1安装nod 阅读全文
摘要:
为获取文件名和TCGA样本名之间的映射关系,需利用Python对TCGA metadata.json数据进行处理时,期间需要对metadata.json进行标准化; 1.JSON数据读取 1 import pandas as pd 2 3 jsonPath = r"E:\IT Development 阅读全文