fisher卡方案例分析

Fisher卡方

卡方检验研究数据的独立性，在分析样本量较少（比如小于40），也或者期望频数出现小于5时，此时使用fisher卡方检验较为适合。SPSSAU医学研究模块中的卡方检验时，有提供2*2即4表格时提供fisher卡方检验p值，但当为R*C结构时，也或者为汇总表格数据时，可使用fisher卡方按钮单独进行计算。

fisher卡方理论依据为超几何分布，其利用排列的数学原理进行计算，在样本量较大计算量非常大，并且fisher卡方基本上均是针对小样本量数据进行计算，因而SPSSAU在总样本量大于200时依旧不提供fisher卡方检验值。

特别提示：

• SPSSAU系统中共有3处（包括通用方法->交叉卡方，医学研究->卡方检验，医学研究->fisher卡方）提供pearson卡方检验值；
• SPSSAU系统中共有2处（医学研究->卡方检验，此处仅提供2*2时fisher卡方检验值，医学研究->fisher卡方）提供fisher卡方检验。

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1 背景
当前有一项HBV感染医学研究，并被试分为预防组和非预防组，共两组，并且记录阳性和阴性的数据，汇总如下表，似问两组数据HBV感染率有无差别？数据如下：

2 理论
Fisher卡方检验利用超几何分布原理进行计算，共不同与pearson卡方检验会提供卡方值和p值两项。Fisher卡方检验时仅提供p值。SPSSAU在医学研究模块->卡方检验方法中提供2*2时卡方检验，如果是汇总表格格式，也或者R*C结构时，可使用fisher卡方按钮完成计算。
3 操作
本案例操作如下，A1单元格一定要空着，并且放入的数据不包括合计数据，如下图：

4 SPSSAU输出结果
SPSSAU共输出3个表格，如下说明：

5文字分析

上表格展示出fisher卡方、pearson卡方和连续校正卡方统计量，从上表可知：fisher卡方时仅提供p值，而且从pearson卡方和连续校正卡方对应的p值来看，3个值均呈现出一致性结论即：预防组与非预防组时HPV感染情况无明显差异。
特别提示：
通常情况下：如果总样本量>40且期望频数值全部均大于5时，一般使用pearshon卡方值，如果总样本量大于40，但出现期望频数小于5的单元格时，可优先使用连续校正卡方，也或者使用fisher卡方值，如果总样本量小于40，也或者出现期望频数小于1的单元格时，此时建议使用fisher卡方检验。具体以文献为准即可，可能不同文献的标准不完全一致。

上表格展示各单元格的期望频数，上表格可以看到，非预防组阳性的期望频数为3.0<5，并且总样本量为33，因而本案例数据使用fisher卡方检验量较为适合。

上表格展示实际频数，并且可通过下拉选择切换展示效果，按频数或者按百分比展示。
6 剖析
涉及以下几个关键点，分别如下：

• 如果希望进行卡方多重比较等，需要使用SPSSAU医学研究模块里面的卡方检验功能；
• 如果总样本量大于200时，此时SPSSAU不提供fisher卡方检验量，但依旧提供perason统计量和连续校统计量。