摘要：
GlimmerHMM是一种De novo的新基因预测软件。 新基因发现基于Generalized Hidden Markov Model (GHMM)。 GlimmerHMM把一个基因看做几种特征序列（状态）的有序切换，切换的过程形成马尔科夫链。 特征序列内部序列基于Nth-order interpolated Markov models (IMM)处理。 阅读全文
摘要：
Augustus是一个真核生物基因预测软件，目前有网页服务端和本地版，它基于Hidden-Markov Model（隐马尔科夫链模型HMM）的预测方法，因此需要一个已经研究清楚的物种进行training(学习)之后再对新物种进行prediction（预测），用于trainning的物种应该和需要预测的物种具有较近的亲缘关系. 阅读全文
摘要：
GenScan是一个gene识别软件，主要是通过已知生物的基因结构特征来识别新的基因（parse）。特点包括：1.只考虑编码蛋白的基因。2.模型考虑每个sequence可能有0个，1个，多个，甚至双链都有基因。3.假设transcription units没有overlapping。 阅读全文
摘要：
统计学老师让我们打印出来，挂在床前，好好背诵的东西~ 阅读全文