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centos7安装R和rstudio [TOC] 安装R 因为R已经由EPEL仓库管理, 所以使用如下命令安装R completed之后，命令行输入R即打开R的初始界面，有R的提示文档。 安装rstudio 参考rstudio 官网上的内容，Install for Red Hat / CentOS 阅读全文
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R语言paste函数解析 [TOC] paste函数 paste函数的作用就是将R对象转换为字符后连接向量。 参数 ... 一个或多个R对象，要转换为字符向量。 sep 分隔字符串。不是NA_character_。 collapse 分隔结果的可选字符串。不是NA_character_。 从上参数列 阅读全文
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Python NumPy 库学习笔记四 [TOC] NumPy 字符串函数 以下函数用于对 dtype 为 numpy.string_ 或 numpy.unicode_ 的数组执行向量化字符串操作。 它们基于 Python 内置库中的标准字符串函数。 这些函数在字符数组类（numpy.char）中定 阅读全文
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Python NumPy 库学习笔记三 [TOC] NumPy 广播(Broadcast) 广播(Broadcast)是 numpy 对不同形状(shape)的数组进行数值计算的方式， 对数组的算术运算通常在相应的元素上进行。 如果两个数组 a 和 b 形状相同，即满足 a.shape == b.s 阅读全文
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python NumPy库学习笔记二 [TOC] 引言 继续学习numpy库。 主要内容为NumPy 切片和索引 NumPy 切片和索引 ndarray对象的内容可以通过索引或切片来访问和修改，与 Python 中 list 的切片操作一样。 ndarray 数组可以基于 0 n 的下标进行索引，切 阅读全文
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python NumPy库学习笔记一 [TOC] 引言 NumPy(Numerical Python) 是 Python 语言的一个扩展程序库，支持大量的维度数组与矩阵运算，此外也针对数组运算提供大量的数学函数库。NumPy 为开放源代码并且由许多协作者共同维护开发。 NumPy ，SciPy， M 阅读全文
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去除重复行或者只保留唯一值，分别对应两件事情。 去除重复行，指的是，将text 文档中所有有重复行的行不做保留，全都删除。 只保留唯一值，指的是，将text 文档中有重复行的保留且仅保留一个值，最后就实现整个text中每一行均为唯一值。 这两种方法都是基于正则表达式替换的方法，查找的模式是一样的（利 阅读全文
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Rstudio配置镜像 [TOC] 引言 R编程，就是 用别人的包和函数 讲述你自己的故事，所以R编程中经常要进行下载package。生物学分析用的package主要就是从CRAN 和Bioconductor进行下载。R使用install.packages 来安装CRAN中的packages，使用 阅读全文
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notepad++中使用正则表达式 [toc] notepad中正则表达式的语法 首先，注意Notepad++正则表达式字符串最长不能超过69个字符。 第二，notepad中的正则表达式语法与通用的正则表达式语法以及python re模块中支持的正则表达式语法都没有没有实质区别，列举如下： 转义字符 阅读全文
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python 使用多线程 [TOC] 什么是线程？ 在软件编程中，线程是具有独立指令集的最小执行单元。它是进程的一部分，并在共享程序相同的可运行资源(如内存)中运行。线程有一个起点、一个执行序列和一个结果。它有一个指令指针，该指针保存线程的当前状态，并控制下一步以什么顺序执行什么。 举个通俗的例子， 阅读全文